More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3415 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  84.87 
 
 		 424 aa  741    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 424 aa  852    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0715531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3084  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.57 
 
 		 421 aa  635    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2847  gamma-glutamyl phosphate reductase  76.78 
 
 		 429 aa  671    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.948477  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0955  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.06 
 
 		 425 aa  624  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.58 
 
 		 425 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0991  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.82 
 
 		 425 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.145269  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1122  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.87 
 
 		 425 aa  614  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2975  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.81 
 
 		 422 aa  615  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.33 
 
 		 425 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.739308  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1038  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.57 
 
 		 425 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.901559  hitchhiker  0.0000854394 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3541  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.1 
 
 		 425 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0967  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.9 
 
 		 424 aa  595  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3323  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.33 
 
 		 425 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2515  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.54 
 
 		 420 aa  548  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0306758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2952  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.2 
 
 		 415 aa  512  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.434526  normal  0.142114 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.47 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.89 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01163  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.35 
 
 		 411 aa  494  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0275  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.89 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0870327  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.89 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  59.47 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.13 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0270  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.89 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004267  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.35 
 
 		 411 aa  497  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000573407  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1863  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.17 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000148264  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.89 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0240  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.89 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.05 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.55 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.97 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3287  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.66 
 
 		 419 aa  481  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3149  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.66 
 
 		 419 aa  481  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485003  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3300  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.66 
 
 		 419 aa  481  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00136137  normal  0.0296518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 		 416 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 		 416 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.35 
 
 		 415 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 		 416 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 		 416 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.01 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3283  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.99 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0978  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.83 
 
 		 413 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.925276  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3430  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.99 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000815894  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.66 
 
 		 418 aa  468  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0763  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.83 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3350  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.26 
 
 		 422 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000409724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4447  gamma-glutamyl phosphate reductase  53 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.69 
 
 		 425 aa  411  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3208  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.22 
 
 		 420 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 424 aa  398  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.5 
 
 		 415 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.92 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.5 
 
 		 424 aa  398  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.01 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.52 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.93 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.32 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.5 
 
 		 419 aa  385  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.47 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.73 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.19 
 
 		 411 aa  382  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.81 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.99 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.28 
 
 		 417 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.76 
 
 		 419 aa  375  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.51 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.84 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.51 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.7 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.94 
 
 		 418 aa  371  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.39 
 
 		 415 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1645  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.83 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  hitchhiker  0.00108459 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.41 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.94 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.45 
 
 		 419 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.72 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.67 
 
 		 418 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.28 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.47 
 
 		 418 aa  364  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.73 
 
 		 429 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.56 
 
 		 429 aa  363  3e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.77 
 
 		 418 aa  363  4e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.55 
 
 		 416 aa  363  4e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.41 
 
 		 415 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.41 
 
 		 415 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.53 
 
 		 456 aa  362  6e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.41 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.45 
 
 		 434 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.39 
 
 		 418 aa  361  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.16 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.16 
 
 		 415 aa  360  3e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  44.81 
 
 		 423 aa  360  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.98 
 
 		 418 aa  359  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0993  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 449 aa  360  4e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150647  normal  0.0290588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11440  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.03 
 
 		 446 aa  359  5e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.74 
 
 		 418 aa  359  5e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0385  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.33 
 
 		 413 aa  359  6e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.427307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.67 
 
 		 415 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.89 
 
 		 418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.1 
 
 		 410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>