More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3300 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3283  gamma-glutamyl phosphate reductase  80.1 
 
 		 417 aa  674    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3300  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 419 aa  857    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00136137  normal  0.0296518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3149  gamma-glutamyl phosphate reductase  99.76 
 
 		 419 aa  854    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485003  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.86 
 
 		 417 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3430  gamma-glutamyl phosphate reductase  79.62 
 
 		 417 aa  664    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000815894  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  79.38 
 
 		 417 aa  683    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3287  gamma-glutamyl phosphate reductase  99.76 
 
 		 419 aa  854    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  79.09 
 
 		 417 aa  677    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  86.81 
 
 		 417 aa  738    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.66 
 
 		 417 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  72.66 
 
 		 417 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.66 
 
 		 417 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.42 
 
 		 417 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0275  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.42 
 
 		 417 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0870327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0270  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.42 
 
 		 417 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.42 
 
 		 417 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.42 
 
 		 417 aa  610  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.5 
 
 		 416 aa  604  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.5 
 
 		 416 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0240  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.18 
 
 		 417 aa  607  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.5 
 
 		 416 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.5 
 
 		 416 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.78 
 
 		 415 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004267  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.2 
 
 		 411 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000573407  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1863  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.95 
 
 		 417 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000148264  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01163  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.2 
 
 		 411 aa  535  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.11 
 
 		 418 aa  536  1e-151  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0978  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.71 
 
 		 413 aa  529  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.925276  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2952  gamma-glutamyl phosphate reductase  60 
 
 		 415 aa  495  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.434526  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0967  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.11 
 
 		 424 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.07 
 
 		 424 aa  480  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.66 
 
 		 424 aa  481  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0715531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3084  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.14 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2847  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.88 
 
 		 429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.948477  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2975  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.15 
 
 		 422 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3350  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.19 
 
 		 422 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000409724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0763  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.42 
 
 		 423 aa  464  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208576 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.42 
 
 		 425 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.739308  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.73 
 
 		 425 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1038  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.42 
 
 		 425 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.901559  hitchhiker  0.0000854394 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3323  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.18 
 
 		 425 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3541  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.42 
 
 		 425 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0955  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 		 425 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0991  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.145269  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1122  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.53 
 
 		 425 aa  448  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4447  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.66 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3208  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.7 
 
 		 420 aa  443  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2515  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.47 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0306758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.6 
 
 		 418 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.88 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.79 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.75 
 
 		 419 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.63 
 
 		 425 aa  398  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.36 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.26 
 
 		 418 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.89 
 
 		 420 aa  393  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.25 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.32 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.96 
 
 		 415 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.41 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.88 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.94 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.23 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.19 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.87 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.38 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.63 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.52 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.8 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.68 
 
 		 414 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.58 
 
 		 410 aa  374  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.54 
 
 		 430 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  45.3 
 
 		 419 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.91 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.06 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.26 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.74 
 
 		 415 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.89 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0284  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.1 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1319  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.02 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.02 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.04 
 
 		 418 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11440  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.78 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0385  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.87 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.427307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0456  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 		 418 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.64 
 
 		 418 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2279  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.73 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0615198  hitchhiker  0.00168342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.76 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.45 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.3 
 
 		 418 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.27 
 
 		 413 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.3 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1227  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.75 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.683793  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.04 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.84 
 
 		 415 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.04 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.84 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  43.91 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>