More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2952 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2952  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
415 aa  840    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.434526  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1863  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.22 
 
 
417 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000148264  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01163  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.77 
 
 
411 aa  528  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004267  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.04 
 
 
411 aa  521  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000573407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.2 
 
 
424 aa  523  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0715531 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0978  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.8 
 
 
413 aa  523  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.925276  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2847  gamma-glutamyl phosphate reductase  60 
 
 
429 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.948477  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.48 
 
 
417 aa  511  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.58 
 
 
424 aa  511  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3300  gamma-glutamyl phosphate reductase  60 
 
 
419 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00136137  normal  0.0296518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3149  gamma-glutamyl phosphate reductase  60 
 
 
419 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3287  gamma-glutamyl phosphate reductase  60 
 
 
419 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.04 
 
 
417 aa  502  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3084  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.28 
 
 
421 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.28 
 
 
417 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.42 
 
 
416 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2975  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.96 
 
 
422 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.55 
 
 
417 aa  491  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.08 
 
 
415 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.42 
 
 
416 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.42 
 
 
416 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.42 
 
 
416 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.31 
 
 
417 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3323  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.48 
 
 
425 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.55 
 
 
417 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1038  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.48 
 
 
425 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.901559  hitchhiker  0.0000854394 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0967  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.83 
 
 
424 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0955  gamma-glutamyl phosphate reductase  60 
 
 
425 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  58.31 
 
 
417 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.8 
 
 
417 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1122  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.76 
 
 
425 aa  485  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.24 
 
 
425 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.739308  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3541  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.76 
 
 
425 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0270  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.8 
 
 
417 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0275  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.8 
 
 
417 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0870327  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3283  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.8 
 
 
417 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  60 
 
 
425 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.8 
 
 
417 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0240  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.8 
 
 
417 aa  485  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.31 
 
 
417 aa  481  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0991  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.76 
 
 
425 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.145269  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3430  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.55 
 
 
417 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000815894  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.88 
 
 
418 aa  473  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2515  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.01 
 
 
420 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0306758  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0763  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.94 
 
 
423 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.208576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3350  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.39 
 
 
422 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000409724 
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 
424 aa  425  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 
425 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4447  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.65 
 
 
423 aa  423  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3208  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.44 
 
 
420 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.72 
 
 
424 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
418 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
420 aa  392  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
415 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 
415 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.16 
 
 
415 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.28 
 
 
415 aa  388  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.04 
 
 
415 aa  388  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.26 
 
 
418 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.34 
 
 
415 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.19 
 
 
434 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 
430 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.03 
 
 
419 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.22 
 
 
418 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.87 
 
 
411 aa  378  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.62 
 
 
415 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.57 
 
 
445 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.34 
 
 
418 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1194  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.75 
 
 
420 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.46 
 
 
418 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18230  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.32 
 
 
426 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.32 
 
 
415 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.19 
 
 
418 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.32 
 
 
415 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.32 
 
 
415 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.21 
 
 
429 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.36 
 
 
419 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.6 
 
 
428 aa  363  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.32 
 
 
418 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  47 
 
 
435 aa  362  5.0000000000000005e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1503  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.24 
 
 
419 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690049  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2672  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.91 
 
 
424 aa  362  8e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322038  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.91 
 
 
418 aa  362  9e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.83 
 
 
415 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.49 
 
 
414 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.39 
 
 
420 aa  361  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  46 
 
 
416 aa  361  1e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.52 
 
 
418 aa  361  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.08 
 
 
415 aa  360  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.52 
 
 
418 aa  360  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.32 
 
 
418 aa  359  6e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.09 
 
 
418 aa  358  9e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.37 
 
 
416 aa  358  9e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.12 
 
 
418 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.07 
 
 
414 aa  358  9.999999999999999e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.83 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.69 
 
 
446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.4 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1018  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  45.01 
 
 
425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.22 
 
 
417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>