More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1863 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1863  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
417 aa  849    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000148264  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0978  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.18 
 
 
413 aa  660    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.925276  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004267  gamma-glutamyl phosphate reductase  84.18 
 
 
411 aa  723    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000573407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01163  gamma-glutamyl phosphate reductase  84.43 
 
 
411 aa  726    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3300  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.95 
 
 
419 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00136137  normal  0.0296518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3287  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.95 
 
 
419 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3149  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.95 
 
 
419 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485003  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.86 
 
 
417 aa  528  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2952  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.22 
 
 
415 aa  527  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.434526  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.39 
 
 
417 aa  524  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.3 
 
 
417 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3283  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.74 
 
 
417 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3430  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.26 
 
 
417 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000815894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.05 
 
 
417 aa  500  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.71 
 
 
418 aa  501  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.85 
 
 
417 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.21 
 
 
416 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.17 
 
 
424 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0715531 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.21 
 
 
416 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  58.85 
 
 
417 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.89 
 
 
417 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.41 
 
 
416 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.27 
 
 
417 aa  490  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3084  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.27 
 
 
421 aa  488  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0270  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.03 
 
 
417 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0240  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.27 
 
 
417 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.27 
 
 
417 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.27 
 
 
417 aa  490  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.21 
 
 
416 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0275  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.03 
 
 
417 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0870327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.87 
 
 
415 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2847  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 
429 aa  481  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.948477  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.66 
 
 
424 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0967  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.87 
 
 
424 aa  477  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.21 
 
 
425 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0955  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.21 
 
 
425 aa  461  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1122  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.97 
 
 
425 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0991  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.21 
 
 
425 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.145269  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2975  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.14 
 
 
422 aa  455  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3323  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.14 
 
 
425 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1038  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.14 
 
 
425 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.901559  hitchhiker  0.0000854394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3350  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.65 
 
 
422 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000409724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3541  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.9 
 
 
425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.9 
 
 
425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.739308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0763  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.78 
 
 
423 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.208576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3208  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.9 
 
 
420 aa  438  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4447  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.18 
 
 
423 aa  435  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2515  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.87 
 
 
420 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0306758  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.63 
 
 
415 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.71 
 
 
424 aa  395  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.02 
 
 
418 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 
415 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 
424 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.75 
 
 
425 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.55 
 
 
420 aa  385  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.22 
 
 
415 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.26 
 
 
419 aa  381  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.48 
 
 
415 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.08 
 
 
415 aa  378  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.12 
 
 
419 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.49 
 
 
419 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.49 
 
 
415 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0284  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.34 
 
 
417 aa  370  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.91 
 
 
415 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  46 
 
 
415 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.25 
 
 
415 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.25 
 
 
415 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.25 
 
 
415 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  46 
 
 
415 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.83 
 
 
414 aa  363  4e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.91 
 
 
418 aa  362  6e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.05 
 
 
416 aa  362  6e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.06 
 
 
424 aa  361  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.65 
 
 
418 aa  361  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.17 
 
 
418 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.86 
 
 
411 aa  360  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.89 
 
 
430 aa  360  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.72 
 
 
413 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.66 
 
 
418 aa  359  4e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.17 
 
 
415 aa  358  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.36 
 
 
418 aa  358  9e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.78 
 
 
419 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2781  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.52 
 
 
414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2992  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.52 
 
 
414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.440021  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.31 
 
 
418 aa  356  5e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0993  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.69 
 
 
449 aa  355  6.999999999999999e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150647  normal  0.0290588 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.3 
 
 
434 aa  355  7.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.64 
 
 
418 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.53 
 
 
429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0083  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.06 
 
 
425 aa  353  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.13 
 
 
445 aa  353  4e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.37 
 
 
418 aa  353  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.86 
 
 
418 aa  352  7e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.75 
 
 
410 aa  351  1e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.33 
 
 
420 aa  351  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.67 
 
 
421 aa  350  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.38 
 
 
456 aa  351  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1716  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.3 
 
 
413 aa  350  3e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1100  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.23 
 
 
418 aa  349  4e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.29 
 
 
421 aa  348  9e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>