More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0953 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1122  gamma-glutamyl phosphate reductase  93.18 
 
 		 425 aa  773    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2975  gamma-glutamyl phosphate reductase  88.1 
 
 		 422 aa  736    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  87.03 
 
 		 425 aa  723    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.739308  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1038  gamma-glutamyl phosphate reductase  87.26 
 
 		 425 aa  724    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.901559  hitchhiker  0.0000854394 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3323  gamma-glutamyl phosphate reductase  87.03 
 
 		 425 aa  721    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 425 aa  860    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0991  gamma-glutamyl phosphate reductase  99.06 
 
 		 425 aa  850    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.145269  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0967  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.58 
 
 		 424 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.58 
 
 		 424 aa  642    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0715531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0955  gamma-glutamyl phosphate reductase  98.82 
 
 		 425 aa  850    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3541  gamma-glutamyl phosphate reductase  86.56 
 
 		 425 aa  717    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.38 
 
 		 424 aa  621  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3084  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.38 
 
 		 421 aa  620  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2847  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.19 
 
 		 429 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.948477  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2515  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.88 
 
 		 420 aa  560  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0306758  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.65 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.89 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  58.65 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.65 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.65 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0240  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.65 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0275  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.65 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0870327  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.65 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0270  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.65 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2952  gamma-glutamyl phosphate reductase  60 
 
 		 415 aa  491  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.434526  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.31 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.66 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.69 
 
 		 416 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.21 
 
 		 415 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1863  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.21 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000148264  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.69 
 
 		 416 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004267  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.66 
 
 		 411 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000573407  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.45 
 
 		 416 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3287  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.73 
 
 		 419 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.21 
 
 		 416 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.97 
 
 		 417 aa  478  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3149  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.73 
 
 		 419 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485003  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01163  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.14 
 
 		 411 aa  477  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3300  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.73 
 
 		 419 aa  474  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00136137  normal  0.0296518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.18 
 
 		 418 aa  466  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0978  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.39 
 
 		 413 aa  464  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.925276  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3283  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.97 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3430  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.97 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000815894  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0763  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.11 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4447  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.44 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3350  gamma-glutamyl phosphate reductase  55 
 
 		 422 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000409724 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 		 425 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3208  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.16 
 
 		 418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.5 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 		 418 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.38 
 
 		 424 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.78 
 
 		 415 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.02 
 
 		 415 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.42 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.79 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.29 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.68 
 
 		 415 aa  395  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.83 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.12 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.02 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.51 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.57 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  45.95 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.37 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.87 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.98 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.37 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.14 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.88 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.6 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.73 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.49 
 
 		 418 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.65 
 
 		 418 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.21 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.1 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.07 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.49 
 
 		 418 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.52 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1645  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.34 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  hitchhiker  0.00108459 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.73 
 
 		 414 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.04 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0674  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.76 
 
 		 441 aa  365  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  46 
 
 		 420 aa  365  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.46 
 
 		 418 aa  363  4e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2141  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.27 
 
 		 459 aa  362  7.0000000000000005e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1194  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.97 
 
 		 420 aa  362  7.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.89 
 
 		 410 aa  361  1e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18230  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.51 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.5 
 
 		 424 aa  361  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.69 
 
 		 423 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3197  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.46 
 
 		 434 aa  360  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.95 
 
 		 429 aa  360  3e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.58 
 
 		 416 aa  360  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.48 
 
 		 435 aa  359  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>