More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0425 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 416 aa  848    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4430  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.91 
 
 		 416 aa  600  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0494311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6814  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.69 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0152004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.31 
 
 		 415 aa  504  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1415  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.44 
 
 		 417 aa  438  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1574  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.96 
 
 		 417 aa  438  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1100  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 		 418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.87 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000378604  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0861  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0911248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1479  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1684  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.51 
 
 		 418 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000238537  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1865  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.68 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1576  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.65 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725209 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.79 
 
 		 411 aa  373  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.9 
 
 		 416 aa  366  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3208  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.18 
 
 		 420 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.62 
 
 		 424 aa  364  1e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.62 
 
 		 425 aa  365  1e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.37 
 
 		 416 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.09 
 
 		 418 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.63 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  44.63 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.86 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.37 
 
 		 416 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.12 
 
 		 415 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.37 
 
 		 417 aa  362  7.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.37 
 
 		 416 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.74 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.23 
 
 		 446 aa  361  1e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.12 
 
 		 416 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.1 
 
 		 418 aa  359  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0763  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.61 
 
 		 423 aa  359  6e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4447  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.87 
 
 		 423 aa  358  7e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.12 
 
 		 414 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1716  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.96 
 
 		 413 aa  358  9.999999999999999e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.15 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0991  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.67 
 
 		 425 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.145269  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.39 
 
 		 419 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.8 
 
 		 418 aa  356  5e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.73 
 
 		 424 aa  356  5e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0715531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.26 
 
 		 417 aa  355  5.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3300  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.91 
 
 		 419 aa  355  5.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00136137  normal  0.0296518 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0955  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.42 
 
 		 425 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.42 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0634  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.13 
 
 		 407 aa  355  1e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3149  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.91 
 
 		 419 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3287  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.91 
 
 		 419 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.53 
 
 		 415 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.28 
 
 		 415 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.93 
 
 		 417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.13 
 
 		 430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0275  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.39 
 
 		 417 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0870327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0270  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.39 
 
 		 417 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.39 
 
 		 417 aa  352  7e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.38 
 
 		 418 aa  352  7e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.39 
 
 		 417 aa  352  7e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2847  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.63 
 
 		 429 aa  352  7e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.948477  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3084  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.91 
 
 		 421 aa  352  7e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3350  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.06 
 
 		 422 aa  352  8e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000409724 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.2 
 
 		 415 aa  350  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2975  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.17 
 
 		 422 aa  351  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.39 
 
 		 417 aa  351  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0240  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.39 
 
 		 417 aa  351  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.75 
 
 		 417 aa  349  4e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.23 
 
 		 418 aa  349  5e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.43 
 
 		 445 aa  349  5e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.99 
 
 		 416 aa  348  1e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0284  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.56 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0784  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.19 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0978  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.28 
 
 		 413 aa  347  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.925276  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.34 
 
 		 418 aa  346  4e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.6 
 
 		 419 aa  346  5e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.55 
 
 		 420 aa  345  8e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1018  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  44.97 
 
 		 425 aa  345  8.999999999999999e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3197  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.19 
 
 		 434 aa  345  8.999999999999999e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3323  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.69 
 
 		 425 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.81 
 
 		 410 aa  345  1e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1268  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.22 
 
 		 409 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2009  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.75 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00109825  hitchhiker  0.000000000000564296 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1319  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.27 
 
 		 407 aa  345  1e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1038  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.69 
 
 		 425 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.901559  hitchhiker  0.0000854394 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1863  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.77 
 
 		 417 aa  343  4e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000148264  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.44 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.739308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3283  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.5 
 
 		 417 aa  343  4e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3541  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.44 
 
 		 425 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.29 
 
 		 415 aa  342  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.29 
 
 		 415 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1122  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.94 
 
 		 425 aa  342  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.41 
 
 		 418 aa  340  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.03 
 
 		 418 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.02 
 
 		 435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2952  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.48 
 
 		 415 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.434526  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.45 
 
 		 418 aa  339  5e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.25 
 
 		 418 aa  338  8e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18230  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  45.82 
 
 		 426 aa  338  9e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.5 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0967  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.27 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.48 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01163  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.17 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>