More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2337 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 415 aa  842    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6814  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.43 
 
 		 415 aa  578  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0152004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4430  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.59 
 
 		 416 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0494311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.31 
 
 		 416 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1100  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0861  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0911248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1479  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000378604  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1684  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 		 418 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000238537  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1865  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 418 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1574  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.28 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1576  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.8 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725209 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1415  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.28 
 
 		 417 aa  388  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.39 
 
 		 411 aa  379  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.48 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.25 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.5 
 
 		 424 aa  365  1e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.48 
 
 		 415 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.99 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.99 
 
 		 415 aa  358  7e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.37 
 
 		 416 aa  356  5e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.52 
 
 		 414 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0284  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.38 
 
 		 417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.58 
 
 		 415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.01 
 
 		 420 aa  352  5e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.02 
 
 		 418 aa  350  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1716  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.8 
 
 		 413 aa  350  4e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0634  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.86 
 
 		 407 aa  350  4e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.76 
 
 		 416 aa  348  9e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3208  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.91 
 
 		 420 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.65 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.12 
 
 		 415 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  44.74 
 
 		 419 aa  346  3e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.27 
 
 		 417 aa  346  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.65 
 
 		 416 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.65 
 
 		 416 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.65 
 
 		 416 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.83 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2975  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.83 
 
 		 422 aa  343  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0763  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.74 
 
 		 423 aa  343  5e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208576 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.68 
 
 		 418 aa  343  5e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.31 
 
 		 417 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  42.31 
 
 		 417 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.86 
 
 		 410 aa  342  7e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3350  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.26 
 
 		 422 aa  341  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000409724 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.31 
 
 		 417 aa  340  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1645  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.5 
 
 		 431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  hitchhiker  0.00108459 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2847  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.34 
 
 		 429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.948477  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.87 
 
 		 418 aa  339  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.35 
 
 		 417 aa  339  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1018  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  43.69 
 
 		 425 aa  340  4e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.79 
 
 		 418 aa  339  5.9999999999999996e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.4 
 
 		 419 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1122  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.86 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3084  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.72 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0991  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.1 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.145269  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.5 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.45 
 
 		 430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.24 
 
 		 419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.63 
 
 		 418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.45 
 
 		 424 aa  336  5e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0715531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.71 
 
 		 418 aa  336  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.54 
 
 		 418 aa  335  7e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.86 
 
 		 425 aa  335  7e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4447  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.69 
 
 		 423 aa  335  9e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.39 
 
 		 418 aa  335  9e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.79 
 
 		 446 aa  335  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0955  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.86 
 
 		 425 aa  334  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.73 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.03 
 
 		 418 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  42 
 
 		 417 aa  333  4e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3287  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.08 
 
 		 419 aa  333  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3323  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.37 
 
 		 425 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3149  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.08 
 
 		 419 aa  333  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  42 
 
 		 417 aa  333  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0674  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.48 
 
 		 441 aa  332  6e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1268  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  43.94 
 
 		 409 aa  332  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1038  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.37 
 
 		 425 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.901559  hitchhiker  0.0000854394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0275  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.77 
 
 		 417 aa  332  8e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0870327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0270  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.77 
 
 		 417 aa  332  8e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1863  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.32 
 
 		 417 aa  332  8e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000148264  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0240  gamma-glutamyl phosphate reductase  42 
 
 		 417 aa  332  9e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  42 
 
 		 417 aa  331  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.14 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3300  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.83 
 
 		 419 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00136137  normal  0.0296518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.13 
 
 		 425 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.739308  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.01 
 
 		 456 aa  331  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.39 
 
 		 415 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3541  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.13 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.39 
 
 		 415 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.46 
 
 		 417 aa  329  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.89 
 
 		 415 aa  329  6e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.39 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.19 
 
 		 418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.46 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0978  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.56 
 
 		 413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.925276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.95 
 
 		 418 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.48 
 
 		 415 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0784  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.86 
 
 		 423 aa  325  9e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3538  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.92 
 
 		 415 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>