More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0978 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0978  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 413 aa  840    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.925276  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01163  gamma-glutamyl phosphate reductase  80.1 
 
 		 411 aa  682    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1863  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.18 
 
 		 417 aa  660    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000148264  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004267  gamma-glutamyl phosphate reductase  80.1 
 
 		 411 aa  681    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000573407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3300  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.71 
 
 		 419 aa  529  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00136137  normal  0.0296518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3149  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.71 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3287  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.71 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.99 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.74 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2952  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.8 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.434526  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  60 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3283  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.74 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3430  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.26 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000815894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.35 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0826655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.8 
 
 		 417 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.8 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  58.8 
 
 		 417 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.84 
 
 		 418 aa  484  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.11 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.52 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0270  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.28 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0275  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.28 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0870327  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.21 
 
 		 416 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.21 
 
 		 416 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.52 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.52 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.97 
 
 		 416 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0240  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.52 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.97 
 
 		 416 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3084  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.42 
 
 		 421 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.83 
 
 		 424 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0715531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0967  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.35 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.21 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2847  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.48 
 
 		 429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.948477  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3350  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.53 
 
 		 422 aa  448  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000409724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.39 
 
 		 425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0991  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.39 
 
 		 425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.145269  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0955  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.63 
 
 		 425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2975  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 		 422 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0763  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.19 
 
 		 423 aa  438  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208576 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1122  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.69 
 
 		 425 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1038  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.73 
 
 		 425 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.901559  hitchhiker  0.0000854394 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3323  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.73 
 
 		 425 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 		 425 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.739308  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3541  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.25 
 
 		 425 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4447  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.73 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2515  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.93 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0306758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3208  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.84 
 
 		 420 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.14 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.17 
 
 		 425 aa  385  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.88 
 
 		 418 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.76 
 
 		 420 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.15 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.22 
 
 		 415 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.22 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.07 
 
 		 415 aa  363  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.17 
 
 		 415 aa  363  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.83 
 
 		 415 aa  363  3e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.16 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.25 
 
 		 418 aa  360  3e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.93 
 
 		 415 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.16 
 
 		 419 aa  358  7e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.9 
 
 		 415 aa  358  8e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.66 
 
 		 415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.66 
 
 		 415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.66 
 
 		 415 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.17 
 
 		 415 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.78 
 
 		 418 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.1 
 
 		 418 aa  352  5e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  48 
 
 		 418 aa  352  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0083  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.78 
 
 		 425 aa  352  8e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0993  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.75 
 
 		 449 aa  352  8e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150647  normal  0.0290588 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.56 
 
 		 414 aa  352  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.17 
 
 		 415 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.42 
 
 		 411 aa  350  2e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.41 
 
 		 416 aa  350  2e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2781  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.17 
 
 		 414 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2992  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.17 
 
 		 414 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.440021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.83 
 
 		 421 aa  347  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0284  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.06 
 
 		 417 aa  347  3e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.83 
 
 		 430 aa  344  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.02 
 
 		 416 aa  344  2e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.81 
 
 		 416 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.46 
 
 		 414 aa  344  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2252  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.15 
 
 		 415 aa  343  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.628785  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.42 
 
 		 415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.38 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2993  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.63 
 
 		 415 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471186  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2884  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.39 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.13 
 
 		 419 aa  341  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  43.69 
 
 		 419 aa  340  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.63 
 
 		 418 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.4 
 
 		 418 aa  339  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.18 
 
 		 429 aa  338  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.34 
 
 		 445 aa  338  9e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.76 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.83 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1319  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.81 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.84 
 
 		 427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>