More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0993 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0993  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 449 aa  883    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150647  normal  0.0290588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0763  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.67 
 
 		 423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3350  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.1 
 
 		 422 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000409724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4447  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.57 
 
 		 423 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.86 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.14 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  52.14 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.77 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  53 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.38 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0275  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.38 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0870327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0270  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.38 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.07 
 
 		 425 aa  398  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3208  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.26 
 
 		 420 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.38 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1863  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.69 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000148264  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0240  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.14 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 424 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0715531 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004267  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000573407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.31 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0967  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.23 
 
 		 424 aa  395  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.6 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3287  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.56 
 
 		 419 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3300  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.56 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00136137  normal  0.0296518 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3084  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 421 aa  388  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3149  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.56 
 
 		 419 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485003  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01163  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 		 411 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.07 
 
 		 416 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.31 
 
 		 416 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 417 aa  388  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0978  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 413 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.925276  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 		 416 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.71 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.19 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2847  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.71 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.948477  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.52 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.07 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3283  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.19 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0991  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.47 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.145269  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2975  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 		 422 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3430  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.59 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000815894  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0955  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.23 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.99 
 
 		 420 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2952  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.58 
 
 		 415 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.434526  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2515  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.09 
 
 		 420 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0306758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1122  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 425 aa  364  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.77 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3323  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 425 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.89 
 
 		 419 aa  358  9e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1038  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 425 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.901559  hitchhiker  0.0000854394 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3541  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 425 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.739308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.12 
 
 		 415 aa  354  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 414 aa  353  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.73 
 
 		 418 aa  352  5.9999999999999994e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.47 
 
 		 415 aa  352  7e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.28 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.47 
 
 		 415 aa  351  2e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.45 
 
 		 419 aa  349  7e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2141  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 459 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.36 
 
 		 414 aa  347  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.03 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.28 
 
 		 423 aa  346  4e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.86 
 
 		 418 aa  347  4e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.25 
 
 		 418 aa  346  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.37 
 
 		 416 aa  346  5e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.96 
 
 		 418 aa  345  8e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.1 
 
 		 418 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.99 
 
 		 418 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.91 
 
 		 418 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2387  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.18 
 
 		 450 aa  342  7e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0346385  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.61 
 
 		 421 aa  341  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.4 
 
 		 446 aa  341  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.37 
 
 		 417 aa  339  5e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.02 
 
 		 414 aa  337  2.9999999999999997e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 		 418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.04 
 
 		 413 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.37 
 
 		 415 aa  334  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0674  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.49 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.88 
 
 		 418 aa  333  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.61 
 
 		 415 aa  333  4e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.56 
 
 		 420 aa  333  4e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.94 
 
 		 415 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.35 
 
 		 419 aa  331  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.44 
 
 		 413 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 		 445 aa  330  2e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0385  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 		 413 aa  330  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.427307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.1 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.86 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.64 
 
 		 429 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.24 
 
 		 418 aa  330  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.13 
 
 		 415 aa  329  6e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.48 
 
 		 418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.76 
 
 		 418 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.97 
 
 		 418 aa  327  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0083  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.84 
 
 		 425 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.43 
 
 		 458 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>