More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0385 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0456  gamma-glutamyl phosphate reductase  92.98 
 
 
413 aa  694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0385  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
413 aa  810    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.427307  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.78 
 
 
418 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.94 
 
 
418 aa  549  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7264  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.03 
 
 
419 aa  545  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.52 
 
 
445 aa  546  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  69.9 
 
 
429 aa  541  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.11 
 
 
418 aa  528  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1818  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.28 
 
 
429 aa  527  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1227  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.41 
 
 
419 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.683793  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.92 
 
 
424 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.63 
 
 
430 aa  508  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1603  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.15 
 
 
417 aa  500  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.048422  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1194  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.25 
 
 
420 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11440  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  64.82 
 
 
446 aa  494  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.99 
 
 
418 aa  479  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5256  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.49 
 
 
418 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2279  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.25 
 
 
434 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0615198  hitchhiker  0.00168342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12455  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.27 
 
 
415 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.440889 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1645  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.83 
 
 
431 aa  464  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  hitchhiker  0.00108459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1507  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.39 
 
 
448 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0477436  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3197  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.32 
 
 
434 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2387  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.78 
 
 
450 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0346385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.59 
 
 
415 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.87 
 
 
419 aa  449  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2813  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.15 
 
 
424 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0167812  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2644  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.72 
 
 
415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.842217  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.37 
 
 
418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.21 
 
 
415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.96 
 
 
415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2141  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.49 
 
 
459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3934  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.98 
 
 
415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18230  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  57.42 
 
 
426 aa  441  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
415 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.39 
 
 
414 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
415 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.94 
 
 
419 aa  438  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 
415 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.49 
 
 
413 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 
415 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
419 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3538  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.45 
 
 
415 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.61 
 
 
419 aa  431  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3543  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.45 
 
 
415 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3611  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.45 
 
 
415 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0809422  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
415 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 
415 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3452  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.62 
 
 
432 aa  425  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0199566  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10150  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  55.4 
 
 
449 aa  426  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0955423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2884  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.86 
 
 
428 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2781  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
414 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2992  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
414 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.440021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2252  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.6 
 
 
415 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.628785  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.82 
 
 
415 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 
413 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.49 
 
 
415 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.49 
 
 
414 aa  415  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.06 
 
 
415 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2993  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.62 
 
 
415 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2672  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.18 
 
 
424 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322038  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.82 
 
 
415 aa  412  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.72 
 
 
420 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1018  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.61 
 
 
425 aa  414  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.27 
 
 
420 aa  411  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.36 
 
 
446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.03 
 
 
418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.44 
 
 
418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.71 
 
 
411 aa  402  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.46 
 
 
418 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 
416 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.25 
 
 
416 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.23 
 
 
416 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.63 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.71 
 
 
418 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
416 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0784  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
423 aa  400  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
415 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.74 
 
 
434 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.27 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.02 
 
 
417 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.91 
 
 
427 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  49.02 
 
 
417 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  53.45 
 
 
428 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1268  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  53.71 
 
 
409 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.99 
 
 
419 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.08 
 
 
417 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1716  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.54 
 
 
413 aa  395  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.53 
 
 
417 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.74 
 
 
418 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.72 
 
 
418 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0240  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.53 
 
 
417 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.53 
 
 
417 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.02 
 
 
417 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0270  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.53 
 
 
417 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
416 aa  393  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0275  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.53 
 
 
417 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0870327  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.04 
 
 
418 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.37 
 
 
424 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.74 
 
 
418 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.48 
 
 
418 aa  391  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>