More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0357 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  85.37 
 
 
417 aa  719    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  85.13 
 
 
417 aa  710    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  99.04 
 
 
416 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  85.13 
 
 
417 aa  710    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  98.32 
 
 
415 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  98.32 
 
 
416 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
416 aa  849    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  85.13 
 
 
417 aa  710    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.1 
 
 
417 aa  641    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0270  gamma-glutamyl phosphate reductase  84.65 
 
 
417 aa  706    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  85.61 
 
 
417 aa  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  83.45 
 
 
417 aa  704    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0275  gamma-glutamyl phosphate reductase  84.65 
 
 
417 aa  706    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0870327  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0240  gamma-glutamyl phosphate reductase  85.37 
 
 
417 aa  716    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  99.28 
 
 
416 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  85.37 
 
 
417 aa  719    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.9 
 
 
417 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.12 
 
 
417 aa  616  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3430  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.9 
 
 
417 aa  611  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000815894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3283  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.66 
 
 
417 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3300  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.5 
 
 
419 aa  604  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00136137  normal  0.0296518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3287  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.5 
 
 
419 aa  604  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3149  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.5 
 
 
419 aa  604  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485003  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.45 
 
 
418 aa  522  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1863  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.21 
 
 
417 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000148264  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004267  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.67 
 
 
411 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000573407  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0978  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.97 
 
 
413 aa  478  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.925276  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2847  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.87 
 
 
429 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.948477  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2952  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.42 
 
 
415 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.434526  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 
424 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0715531 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01163  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.93 
 
 
411 aa  477  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.9 
 
 
424 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0967  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.11 
 
 
424 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3084  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.97 
 
 
421 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2975  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.8 
 
 
422 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0763  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.58 
 
 
423 aa  461  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.208576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.21 
 
 
425 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0991  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.21 
 
 
425 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.145269  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0955  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.21 
 
 
425 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3541  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.59 
 
 
425 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1122  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.73 
 
 
425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3350  gamma-glutamyl phosphate reductase  55 
 
 
422 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000409724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3323  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.59 
 
 
425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4447  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.66 
 
 
423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1038  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.59 
 
 
425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.901559  hitchhiker  0.0000854394 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.59 
 
 
425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.739308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3208  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.89 
 
 
420 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2515  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.9 
 
 
420 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0306758  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
424 aa  432  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
425 aa  433  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.28 
 
 
424 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.64 
 
 
418 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.9 
 
 
418 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.35 
 
 
430 aa  413  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 
418 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.43 
 
 
420 aa  414  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.75 
 
 
419 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.58 
 
 
445 aa  413  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 
415 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 
415 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.23 
 
 
415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.98 
 
 
415 aa  404  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 
418 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.03 
 
 
419 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
418 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.13 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.25 
 
 
418 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.23 
 
 
416 aa  397  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2141  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 
459 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.91 
 
 
419 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1227  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.93 
 
 
419 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.683793  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1716  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.88 
 
 
413 aa  392  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 
415 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 
418 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.58 
 
 
420 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0385  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.02 
 
 
413 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.427307  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.3 
 
 
411 aa  391  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2279  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.19 
 
 
434 aa  391  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0615198  hitchhiker  0.00168342 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18230  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.15 
 
 
426 aa  385  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.13 
 
 
424 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.34 
 
 
418 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.1 
 
 
421 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.6 
 
 
434 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7264  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.75 
 
 
419 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0784  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.57 
 
 
423 aa  382  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.7 
 
 
415 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.91 
 
 
418 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.51 
 
 
413 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2387  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.98 
 
 
450 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0346385  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1194  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.13 
 
 
420 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0284  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.12 
 
 
417 aa  380  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11440  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.14 
 
 
446 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.95 
 
 
427 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.38 
 
 
414 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.32 
 
 
417 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.99 
 
 
414 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.34 
 
 
418 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 
419 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.6 
 
 
435 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.86 
 
 
413 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>