102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3060 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3060  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 		 173 aa  347  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0042028  normal  0.0913138 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1624  flagellar basal body-associated protein FliL  82.66 
 
 		 172 aa  275  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1372  flagellar basal body-associated protein FliL  80.35 
 
 		 173 aa  260  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0654602  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3062  flagellar basal body-associated protein FliL  71.02 
 
 		 174 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2930  flagellar basal body-associated protein FliL  70.45 
 
 		 175 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1443  flagellar basal body-associated protein FliL  71.02 
 
 		 174 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.251302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  72.99 
 
 		 171 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1188  flagellar basal body-associated protein FliL  71.84 
 
 		 173 aa  235  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1330  flagellar basal body-associated protein FliL  69.71 
 
 		 173 aa  230  6e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2291  flagellar basal body-associated protein FliL  70.06 
 
 		 175 aa  229  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1367  flagellar basal body-associated protein FliL  67.63 
 
 		 172 aa  228  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2920  flagellar basal body-associated protein FliL  69.14 
 
 		 175 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.972456  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3222  flagellar basal body-associated protein FliL  71.26 
 
 		 174 aa  223  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1348  flagellar basal body-associated protein FliL  70.86 
 
 		 174 aa  222  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.298791 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1288  flagellar basal body-associated protein FliL  69.14 
 
 		 175 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1355  flagellar basal body-associated protein FliL  70.29 
 
 		 175 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02881  flagellar basal body-associated protein FliL  45.95 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3041  flagellar basal body-associated protein FliL  52.14 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568891  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  47.77 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.927719  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002821  flagellar biosynthesis protein FliL  42.86 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1710  flagellar basal body-associated protein FliL  42.24 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2302  flagellar basal body-associated protein FliL  39.63 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03155  flagellar basal body-associated protein FliL  43.35 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  35.43 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1545  flagellar basal body-associated protein FliL  31.25 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0541868  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45810  flagellar basal body-associated protein FliL  36.49 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3885  flagellar basal body-associated protein FliL  37.16 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0323637  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  34.84 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  34.84 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3448  flagellar basal body-associated protein FliL  30.23 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1968  flagellar protein FliL, putative  28.74 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0636604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2176  flagellar basal body-associated protein FliL  29.28 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5209  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  34.62 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5118  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  34.62 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.41 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5230  flagellar protein FliL, putative  32.23 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  28 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5032  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  34.62 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0694  Flagellar basal body-associated protein-like protein  29.41 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5270  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  33.65 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.569633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4359  flagellar basal body-associated protein FliL  28.81 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5444  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  31.62 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1507  flagellar basal body-associated protein FliL  28.81 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  35.58 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0488  flagellar basal body-associated protein FliL  27.95 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3921  flagellar basal body-associated protein FliL  28.81 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3685  flagellar basal body-associated protein FliL  30.43 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0403111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0126  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.31 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177877  hitchhiker  0.000000178382 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0974  flagellar basal body-associated protein FliL  28.26 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0154404  normal  0.0446936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1874  flagellar basal body-associated protein FliL  33.98 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361073  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0121  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.31 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0127  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.31 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4228  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.91 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0127  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  30 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0126  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.91 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0131  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.91 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0130  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.91 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2166  flagellar basal body-associated protein FliL  28.41 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4825  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  32.35 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2419  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.74 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.210521  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00274  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.74 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002144  flagellar biosynthesis protein FliL  28.05 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797924  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0132  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  31.82 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3436  flagellar basal body-associated protein FliL  27.07 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0049  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  30.63 
 
 		 133 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3622  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  30.68 
 
 		 133 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.725258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2336  flagellar basal body-associated protein FliL  24.63 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4430  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.68 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0860  flagellar protein (FliL)-like protein  30.17 
 
 		 159 aa  51.6  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3247  flagellar basal body-associated protein FliL  30.49 
 
 		 192 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00070  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  24.64 
 
 		 137 aa  51.2  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  31.25 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3742  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  30.68 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254584  hitchhiker  0.00169193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3438  flagellar basal body-associated protein FliL  27.45 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5976  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.33 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0096  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.45 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4147  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  31.82 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69100  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.17 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3828  flagellar basal body-associated protein FliL  25.73 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0760  flagellar basal body-associated protein FliL  30.1 
 
 		 140 aa  48.5  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1988  flagellar basal body-associated protein FliL  25 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0879  flagellar basal body-associated protein FliL  28.38 
 
 		 179 aa  47.8  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0792203  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2897  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.83 
 
 		 136 aa  47.4  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3569  flagellar basal body-associated protein FliL  30.2 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3912  flagellar basal body-associated protein FliL  25.86 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0271549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1123  flagellar basal body-associated protein FliL  25 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.484196 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0923  flagellar basal body-associated protein FliL  26.19 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.102944  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3584  flagellar basal body-associated protein-like  23.85 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1972  flagellar basal body-associated protein FliL  24.54 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.824881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3049  flagellar basal body-associated protein FliL  31.68 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.971745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3273  flagellar basal body-associated protein FliL  31.68 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3294  flagellar basal body-associated protein FliL  25.42 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0653  flagellar basal body-associated protein FliL  24.64 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1320  flagellar basal body-associated protein FliL  26.38 
 
 		 178 aa  42  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0264374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0580  flagellar basal body-associated protein FliL  23.6 
 
 		 169 aa  42  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3101  flagellar basal body-associated protein FliL  28.12 
 
 		 174 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4203  flagellar basal body-associated protein FliL  30.21 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0420  flagellar protein FliL  28.12 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.706283  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4753  flagellar basal body-associated protein FliL  25.53 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24170  Flagellar basal body-associated protein  27.84 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0209551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>