106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0420 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0420  flagellar protein FliL  100 
 
 
173 aa  337  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.706283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3436  flagellar basal body-associated protein FliL  63.93 
 
 
177 aa  205  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3101  flagellar basal body-associated protein FliL  77.84 
 
 
174 aa  204  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3828  flagellar basal body-associated protein FliL  62.87 
 
 
174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3912  flagellar basal body-associated protein FliL  64.02 
 
 
172 aa  186  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0271549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3294  flagellar basal body-associated protein FliL  60.48 
 
 
183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4203  flagellar basal body-associated protein FliL  52.66 
 
 
166 aa  157  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1170  flagellar basal body-associated protein  36.36 
 
 
167 aa  94.4  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3569  flagellar basal body-associated protein FliL  38.96 
 
 
166 aa  91.3  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0580  flagellar basal body-associated protein FliL  32.75 
 
 
169 aa  87  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1630  flagellar basal body-associated protein FliL  27.71 
 
 
179 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0923  flagellar basal body-associated protein FliL  28.74 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.102944  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2914  flagellar basal body-associated protein FliL  39.09 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.667538  normal  0.215161 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1320  flagellar basal body-associated protein FliL  27.95 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0264374  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0879  flagellar basal body-associated protein FliL  30.28 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0840  flagellar basal body-associated protein FliL  27.92 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1595  flagellar basal body-associated protein FliL  34 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1407  flagellar basal body-associated protein FliL  34 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.875078  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1741  flagellar basal body-associated protein FliL  34 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2212  flagellar basal body-associated protein FliL  32.54 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0271  flagellar basal body-associated protein FliL  31 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0373  flagellar basal body-associated protein FliL  32.35 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0653  flagellar basal body-associated protein FliL  33.65 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3586  flagellar protein FliL  35.79 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.89846  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0860  flagellar protein (FliL)-like protein  36.04 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1637  flagellar basal body-associated protein FliL  37.36 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.600168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0769  flagellar basal body-associated protein FliL  32.98 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0783  flagellar basal body-associated protein FliL  31.09 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1372  flagellar basal body-associated protein FliL  31.95 
 
 
173 aa  58.2  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0654602  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1433  flagellar basal body-associated protein FliL  32.71 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0026  flagellar basal body-associated protein FliL  34.43 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1756  flagellar basal body-associated protein FliL  28.07 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0413  flagellar basal body-associated protein FliL  30.28 
 
 
200 aa  55.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2930  flagellar basal body-associated protein FliL  28.11 
 
 
175 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3062  flagellar basal body-associated protein FliL  28.8 
 
 
174 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2735  flagellar basal body-associated protein FliL  35.59 
 
 
171 aa  54.7  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  29.34 
 
 
159 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1443  flagellar basal body-associated protein FliL  28.8 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.251302  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16760  flagellar basal body-associated protein FliL  27 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431059  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0706  flagellar basal body-associated protein FliL  29.24 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2765  flagellar basal body-associated protein FliL  35.29 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0239  flagellar basal body-associated protein FliL  35.29 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3498  flagellar basal body-associated protein FliL  35.29 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1868  flagellar basal body-associated protein FliL  35.29 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  35.29 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2684  flagellar basal body-associated protein FliL  35.29 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  29.12 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1710  flagellar basal body-associated protein FliL  29.82 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2036  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 
148 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.339688  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0033  flagellar basal body-associated protein FliL  34.31 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0488  flagellar basal body-associated protein FliL  30.21 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5885  flagellar basal body-associated protein FliL  33.67 
 
 
145 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.42085  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  29 
 
 
167 aa  51.6  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2920  flagellar basal body-associated protein FliL  28.82 
 
 
175 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.972456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0042  flagellar basal body-associated protein FliL  34.31 
 
 
178 aa  51.2  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200475  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1404  flagellar basal body-associated protein FliL  30.43 
 
 
154 aa  51.2  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.28248  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1846  flagellar basal body-associated protein FliL  32.11 
 
 
134 aa  50.8  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188721  decreased coverage  0.00824516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3225  flagellar basal body-associated protein FliL  34.31 
 
 
178 aa  50.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1164  flagellar basal body-associated protein FliL  33.67 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.372404  normal  0.0336547 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0029  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0041  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2291  flagellar basal body-associated protein FliL  28.89 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  34.34 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1682  flagellar basal body-associated protein FliL  28.71 
 
 
135 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0060  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002821  flagellar biosynthesis protein FliL  27.37 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2176  flagellar basal body-associated protein FliL  32.5 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48892  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1972  flagellar basal body-associated protein FliL  31 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.824881  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0044  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 
177 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1022  flagellar basal body-associated protein FliL  30.77 
 
 
200 aa  48.5  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5297  flagellar biosynthesis protein; flagellar basal body-associated protein  30.61 
 
 
171 aa  48.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.687162  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3060  flagellar basal body-associated protein FliL  26.67 
 
 
173 aa  48.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0042028  normal  0.0913138 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1624  flagellar basal body-associated protein FliL  28.42 
 
 
172 aa  47.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2013  flagellar basal body-associated protein FliL  26.32 
 
 
142 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0606  flagellar basal body-associated protein FliL  29.9 
 
 
159 aa  47.4  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4753  flagellar basal body-associated protein FliL  33.61 
 
 
164 aa  47.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3676  flagellar basal body-associated protein FliL  33.61 
 
 
164 aa  47.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.814795 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3222  flagellar basal body-associated protein FliL  30.99 
 
 
174 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31100  flagellar basal body-associated protein  29.19 
 
 
161 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.655971  normal  0.261377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1367  flagellar basal body-associated protein FliL  28.14 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0767  flagellar basal body-associated protein FliL  25.83 
 
 
187 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.577701  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0853  flagellar basal body-associated protein FliL  27.4 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.325723  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03155  flagellar basal body-associated protein FliL  27.84 
 
 
166 aa  44.7  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3466  flagellar basal body-associated protein FliL  21.14 
 
 
254 aa  44.7  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0571  flagellar basal body-associated protein  28.09 
 
 
210 aa  44.3  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4199  flagellar basal body-associated protein FliL  30.49 
 
 
166 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.742849  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3622  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.725258  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3450  flagellar basal body-associated protein FliL  25 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.524005  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0694  Flagellar basal body-associated protein-like protein  25 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24170  Flagellar basal body-associated protein  35 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0209551  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4174  flagellar basal body-associated protein FliL  31.31 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1936  flagellar basal body-associated protein FliL  24.2 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.340814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1366  flagellar basal body-associated protein FliL  27.93 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4714  flagellar basal body-associated protein FliL  26.89 
 
 
221 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1348  flagellar basal body-associated protein FliL  27.22 
 
 
174 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.298791 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2399  flagellar basal body-associated protein FliL  23.76 
 
 
119 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1988  flagellar basal body-associated protein FliL  28.57 
 
 
166 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1874  flagellar basal body-associated protein FliL  31.73 
 
 
171 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361073  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1119  flagellar basal body-associated protein FliL  28.4 
 
 
208 aa  41.6  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0385  flagellar basal body-associated protein, putative  28.12 
 
 
250 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>