88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4203 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4203  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 
166 aa  331  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3828  flagellar basal body-associated protein FliL  54.8 
 
 
174 aa  185  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3436  flagellar basal body-associated protein FliL  55.15 
 
 
177 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3912  flagellar basal body-associated protein FliL  53.98 
 
 
172 aa  175  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0271549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3294  flagellar basal body-associated protein FliL  51.18 
 
 
183 aa  157  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0420  flagellar protein FliL  74.47 
 
 
173 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.706283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3101  flagellar basal body-associated protein FliL  69.39 
 
 
174 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1170  flagellar basal body-associated protein  38.86 
 
 
167 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3569  flagellar basal body-associated protein FliL  36.42 
 
 
166 aa  95.9  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1320  flagellar basal body-associated protein FliL  34.59 
 
 
178 aa  94.4  7e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0264374  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1630  flagellar basal body-associated protein FliL  31.32 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0879  flagellar basal body-associated protein FliL  35.92 
 
 
179 aa  92  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0792203  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1595  flagellar basal body-associated protein FliL  36.88 
 
 
178 aa  87.8  6e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1407  flagellar basal body-associated protein FliL  36.62 
 
 
178 aa  87.8  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.875078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0580  flagellar basal body-associated protein FliL  34.32 
 
 
169 aa  87  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0923  flagellar basal body-associated protein FliL  28.57 
 
 
175 aa  87  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.102944  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1741  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0840  flagellar basal body-associated protein FliL  33.11 
 
 
187 aa  85.5  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0271  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 
183 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2914  flagellar basal body-associated protein FliL  40.43 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.667538  normal  0.215161 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0653  flagellar basal body-associated protein FliL  36.08 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0373  flagellar basal body-associated protein FliL  37.62 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2212  flagellar basal body-associated protein FliL  33.07 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1637  flagellar basal body-associated protein FliL  36.28 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.600168  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3586  flagellar protein FliL  28.38 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.89846  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  31.48 
 
 
167 aa  61.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0783  flagellar basal body-associated protein FliL  31.91 
 
 
159 aa  58.2  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0860  flagellar protein (FliL)-like protein  30.07 
 
 
159 aa  57.4  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0769  flagellar basal body-associated protein FliL  32.98 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0606  flagellar basal body-associated protein FliL  29.3 
 
 
159 aa  55.5  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16760  flagellar basal body-associated protein FliL  30.21 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431059  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  29.81 
 
 
174 aa  55.1  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  29.81 
 
 
174 aa  55.1  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1367  flagellar basal body-associated protein FliL  28.24 
 
 
172 aa  54.7  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0571  flagellar basal body-associated protein  32.1 
 
 
210 aa  52.4  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1022  flagellar basal body-associated protein FliL  24.43 
 
 
200 aa  52.4  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2036  flagellar basal body-associated protein FliL  31.58 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.339688  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2765  flagellar basal body-associated protein FliL  30.69 
 
 
180 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0239  flagellar basal body-associated protein FliL  30.69 
 
 
180 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0413  flagellar basal body-associated protein FliL  28 
 
 
200 aa  50.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2684  flagellar basal body-associated protein FliL  30.69 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  30.69 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1868  flagellar basal body-associated protein FliL  30.69 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3498  flagellar basal body-associated protein FliL  30.69 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1404  flagellar basal body-associated protein FliL  28.85 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.28248  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0026  flagellar basal body-associated protein FliL  31.37 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34435  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1972  flagellar basal body-associated protein FliL  30.61 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.824881  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2930  flagellar basal body-associated protein FliL  26.9 
 
 
175 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2735  flagellar basal body-associated protein FliL  34.04 
 
 
171 aa  48.5  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0694  Flagellar basal body-associated protein-like protein  29.17 
 
 
134 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1433  flagellar basal body-associated protein FliL  26.09 
 
 
197 aa  47.8  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3062  flagellar basal body-associated protein FliL  28.49 
 
 
174 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1756  flagellar basal body-associated protein FliL  25 
 
 
161 aa  47.8  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002821  flagellar biosynthesis protein FliL  25.43 
 
 
167 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0488  flagellar basal body-associated protein FliL  29.17 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1710  flagellar basal body-associated protein FliL  28.32 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  28.99 
 
 
171 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1372  flagellar basal body-associated protein FliL  27.22 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0654602  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2166  flagellar basal body-associated protein FliL  32.04 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31100  flagellar basal body-associated protein  32.99 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.655971  normal  0.261377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1443  flagellar basal body-associated protein FliL  27.75 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.251302  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2920  flagellar basal body-associated protein FliL  27.67 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.972456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3060  flagellar basal body-associated protein FliL  27.04 
 
 
173 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0042028  normal  0.0913138 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0767  flagellar basal body-associated protein FliL  27.1 
 
 
187 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.577701  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4753  flagellar basal body-associated protein FliL  31.15 
 
 
164 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  29.59 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3676  flagellar basal body-associated protein FliL  31.15 
 
 
164 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.814795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2013  flagellar basal body-associated protein FliL  24.14 
 
 
142 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1682  flagellar basal body-associated protein FliL  26.73 
 
 
135 aa  44.3  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1351  flagellar basal body-associated protein FliL  28.57 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.516143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3951  flagellar basal body-associated protein FliL  22.5 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0644  flagellar basal body-associated protein FliL  27.17 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24170  Flagellar basal body-associated protein  31 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0209551  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2176  flagellar basal body-associated protein FliL  24.84 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48892  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2336  flagellar basal body-associated protein FliL  27.55 
 
 
132 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2906  flagellar basal body-associated protein FliL  27.93 
 
 
190 aa  42.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5297  flagellar biosynthesis protein; flagellar basal body-associated protein  27.55 
 
 
171 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.687162  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3634  flagellar basal body-associated protein FliL  24 
 
 
151 aa  42  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.171536  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1846  flagellar basal body-associated protein FliL  28.12 
 
 
134 aa  42  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188721  decreased coverage  0.00824516 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1164  flagellar basal body-associated protein FliL  29 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.372404  normal  0.0336547 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2009  flagellar basal body-associated protein FliL  24.75 
 
 
261 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5885  flagellar basal body-associated protein FliL  28.57 
 
 
145 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.42085  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2322  flagellar protein FliL-related protein  24.34 
 
 
158 aa  41.6  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3075  flagellar basal body-associated protein FliL  26.25 
 
 
190 aa  41.2  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10365  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1874  flagellar basal body-associated protein FliL  29.81 
 
 
171 aa  40.8  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361073  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4199  flagellar basal body-associated protein FliL  27.89 
 
 
166 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.742849  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0325  flagellar basal body-associated protein FliL  24.53 
 
 
168 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3776  flagellar basal body-associated protein FliL  31.07 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.368254  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>