116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5297 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5297  flagellar biosynthesis protein; flagellar basal body-associated protein  100 
 
 		 171 aa  337  7e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.687162  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5885  flagellar basal body-associated protein FliL  77.4 
 
 		 145 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.42085  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0026  flagellar basal body-associated protein FliL  42.94 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34435  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2177  flagellar basal body-associated protein FliL  43.05 
 
 		 154 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000145203  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2044  flagellar basal body-associated protein FliL  43.05 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.172108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1704  flagellar basal body-associated protein FliL  43.05 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0548667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1698  flagellar basal body-associated protein FliL  43.05 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1240  flagellar basal body-associated protein FliL  43.05 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.476659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2720  flagellar basal body-associated protein FliL  43.05 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.083272  normal  0.321922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4174  flagellar basal body-associated protein FliL  51.96 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1570  flagellar basal body-associated protein FliL  49.04 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.195075  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2937  flagellar basal body-associated protein FliL  48.54 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3776  flagellar basal body-associated protein FliL  50.49 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.368254  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2765  flagellar basal body-associated protein FliL  43.02 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0239  flagellar basal body-associated protein FliL  43.02 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0033  flagellar basal body-associated protein FliL  52.43 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2953  flagellar basal body-associated protein FliL  38.51 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1972  flagellar basal body-associated protein FliL  38.24 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.824881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0159  flagellar basal body-associated protein FliL  52.53 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.528891 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0042  flagellar basal body-associated protein FliL  52.43 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1961  flagellar basal body-associated protein FliL  43.07 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.245008  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0029  flagellar basal body-associated protein FliL  39.66 
 
 		 177 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0041  flagellar basal body-associated protein FliL  39.66 
 
 		 177 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0060  flagellar basal body-associated protein FliL  39.66 
 
 		 177 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3225  flagellar basal body-associated protein FliL  51.46 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2138  flagellar basal body-associated protein FliL  50 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225342 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2191  flagellar basal body-associated protein FliL  50 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.697575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2133  flagellar basal body-associated protein FliL  50 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1144  flagellar basal body-associated protein FliL  50 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.100016  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1267  flagellar basal body-associated protein FliL  50 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0379  flagellar basal body-associated protein FliL  40.74 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3676  flagellar basal body-associated protein FliL  39.39 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.814795 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4753  flagellar basal body-associated protein FliL  39.39 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0044  flagellar basal body-associated protein FliL  49.51 
 
 		 177 aa  97.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3498  flagellar basal body-associated protein FliL  42.6 
 
 		 165 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1868  flagellar basal body-associated protein FliL  42.6 
 
 		 165 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  42.6 
 
 		 165 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2684  flagellar basal body-associated protein FliL  42.6 
 
 		 165 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2535  flagellar basal body-associated protein FliL  46.94 
 
 		 155 aa  95.1  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472707  normal  0.623543 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1351  flagellar basal body-associated protein FliL  40.91 
 
 		 166 aa  94.4  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.516143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  51.04 
 
 		 165 aa  91.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1606  flagellar basal body-associated protein FliL  39.26 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.0493559 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2906  flagellar basal body-associated protein FliL  41.59 
 
 		 190 aa  89  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24170  Flagellar basal body-associated protein  43.69 
 
 		 162 aa  88.6  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0209551  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1546  flagellar basal body-associated protein FliL  47.66 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0556  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 		 199 aa  85.1  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521306  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2298  flagellar basal body-associated protein FliL  48.57 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2398  flagellar basal body-associated protein FliL  48.57 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.335561  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3075  flagellar basal body-associated protein FliL  36.55 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0644  flagellar basal body-associated protein FliL  38.61 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1885  flagellar basal body-associated protein FliL  47.12 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2581  flagellar basal body-associated protein FliL  47.12 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3801  flagellar basal body-associated protein FliL  35.86 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0931816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4389  flagellar basal body-associated protein FliL  35.71 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1119  flagellar basal body-associated protein FliL  34.85 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0767  flagellar basal body-associated protein FliL  34.78 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  31.85 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0840  flagellar basal body-associated protein FliL  35.29 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0923  flagellar basal body-associated protein FliL  30.22 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.102944  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0860  flagellar protein (FliL)-like protein  29.45 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  32.43 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  32.43 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0571  flagellar basal body-associated protein  36.9 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0580  flagellar basal body-associated protein FliL  24.4 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1022  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  30.43 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1320  flagellar basal body-associated protein FliL  35.92 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0264374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1170  flagellar basal body-associated protein  28.48 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0879  flagellar basal body-associated protein FliL  29.31 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0792203  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1630  flagellar basal body-associated protein FliL  32.54 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2166  flagellar basal body-associated protein FliL  32.09 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0373  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3569  flagellar basal body-associated protein FliL  27.89 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1682  flagellar basal body-associated protein FliL  30.47 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3828  flagellar basal body-associated protein FliL  29.41 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2176  flagellar basal body-associated protein FliL  26.05 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3912  flagellar basal body-associated protein FliL  28.57 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0271549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3436  flagellar basal body-associated protein FliL  27.84 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1741  flagellar basal body-associated protein FliL  30.39 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1324  flagellar basal body-associated protein FliL  28.87 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3586  flagellar protein FliL  29.34 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.89846  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1595  flagellar basal body-associated protein FliL  30.39 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1407  flagellar basal body-associated protein FliL  30.39 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.875078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1545  flagellar basal body-associated protein FliL  28.85 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0541868  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2930  flagellar basal body-associated protein FliL  34.95 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3101  flagellar basal body-associated protein FliL  29.29 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1164  flagellar basal body-associated protein FliL  29.59 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.372404  normal  0.0336547 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1874  flagellar basal body-associated protein FliL  34.95 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361073  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0853  flagellar basal body-associated protein FliL  30.22 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.325723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2735  flagellar basal body-associated protein FliL  36.7 
 
 		 171 aa  48.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2563  flagellar basal body-associated protein FliL  29.1 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4199  flagellar basal body-associated protein FliL  25 
 
 		 166 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.742849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1637  flagellar basal body-associated protein FliL  28.42 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.600168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69100  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.83 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2212  flagellar basal body-associated protein FliL  32.65 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0420  flagellar protein FliL  30.61 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.706283  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1846  flagellar basal body-associated protein FliL  32.63 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188721  decreased coverage  0.00824516 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  30.46 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3885  flagellar basal body-associated protein FliL  25.9 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0323637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3294  flagellar basal body-associated protein FliL  30.3 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>