123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3676 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3676  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 		 164 aa  331  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.814795 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4753  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 		 164 aa  331  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0379  flagellar basal body-associated protein FliL  83.33 
 
 		 164 aa  220  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1606  flagellar basal body-associated protein FliL  42.07 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.0493559 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1972  flagellar basal body-associated protein FliL  39.55 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.824881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3225  flagellar basal body-associated protein FliL  37.72 
 
 		 178 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0033  flagellar basal body-associated protein FliL  37.72 
 
 		 178 aa  94.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0042  flagellar basal body-associated protein FliL  37.72 
 
 		 178 aa  94.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0026  flagellar basal body-associated protein FliL  35.93 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34435  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0029  flagellar basal body-associated protein FliL  37.65 
 
 		 177 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0041  flagellar basal body-associated protein FliL  37.65 
 
 		 177 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0060  flagellar basal body-associated protein FliL  37.65 
 
 		 177 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1351  flagellar basal body-associated protein FliL  41.06 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.516143  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2937  flagellar basal body-associated protein FliL  40.48 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  33.12 
 
 		 167 aa  84.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0556  flagellar basal body-associated protein FliL  34.09 
 
 		 199 aa  84.3  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521306  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5297  flagellar biosynthesis protein; flagellar basal body-associated protein  37.74 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.687162  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3776  flagellar basal body-associated protein FliL  40.78 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.368254  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2765  flagellar basal body-associated protein FliL  36.97 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0239  flagellar basal body-associated protein FliL  36.97 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3498  flagellar basal body-associated protein FliL  36.97 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1868  flagellar basal body-associated protein FliL  36.97 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  36.97 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2684  flagellar basal body-associated protein FliL  36.97 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  37.95 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0159  flagellar basal body-associated protein FliL  41.41 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.528891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2953  flagellar basal body-associated protein FliL  30.07 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0044  flagellar basal body-associated protein FliL  33.53 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4389  flagellar basal body-associated protein FliL  31.84 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24170  Flagellar basal body-associated protein  37.86 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0209551  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  32.5 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5885  flagellar basal body-associated protein FliL  39.39 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.42085  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4174  flagellar basal body-associated protein FliL  39.81 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1119  flagellar basal body-associated protein FliL  32.28 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1961  flagellar basal body-associated protein FliL  32.03 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.245008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0767  flagellar basal body-associated protein FliL  39.82 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1545  flagellar basal body-associated protein FliL  32.54 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0541868  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3075  flagellar basal body-associated protein FliL  31.97 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10365  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1570  flagellar basal body-associated protein FliL  33.75 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.195075  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3801  flagellar basal body-associated protein FliL  31.29 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0931816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2906  flagellar basal body-associated protein FliL  36.52 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3586  flagellar protein FliL  32.9 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.89846  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1710  flagellar basal body-associated protein FliL  31.21 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0644  flagellar basal body-associated protein FliL  29.48 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1704  flagellar basal body-associated protein FliL  29.45 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0548667  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2720  flagellar basal body-associated protein FliL  29.45 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.083272  normal  0.321922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2044  flagellar basal body-associated protein FliL  29.45 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.172108  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2177  flagellar basal body-associated protein FliL  29.38 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000145203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1698  flagellar basal body-associated protein FliL  29.45 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1240  flagellar basal body-associated protein FliL  29.45 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.476659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002821  flagellar biosynthesis protein FliL  31.06 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45810  flagellar basal body-associated protein FliL  30 
 
 		 173 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1170  flagellar basal body-associated protein  29.09 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3569  flagellar basal body-associated protein FliL  32.69 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1022  flagellar basal body-associated protein FliL  31.97 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02881  flagellar basal body-associated protein FliL  28.66 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0571  flagellar basal body-associated protein  30.15 
 
 		 210 aa  60.8  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3885  flagellar basal body-associated protein FliL  30 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0323637  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2298  flagellar basal body-associated protein FliL  30.07 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2398  flagellar basal body-associated protein FliL  30.07 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.335561  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  28.19 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  28.19 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1546  flagellar basal body-associated protein FliL  33.86 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1988  flagellar basal body-associated protein FliL  30.77 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0706  flagellar basal body-associated protein FliL  30.46 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0840  flagellar basal body-associated protein FliL  27.85 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1968  flagellar protein FliL, putative  29.09 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0636604  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2535  flagellar basal body-associated protein FliL  32.17 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472707  normal  0.623543 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0580  flagellar basal body-associated protein FliL  28.57 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1874  flagellar basal body-associated protein FliL  32.38 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361073  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3448  flagellar basal body-associated protein FliL  28.99 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1320  flagellar basal body-associated protein FliL  29.07 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0264374  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0923  flagellar basal body-associated protein FliL  27.66 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.102944  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0974  flagellar basal body-associated protein FliL  28.57 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0154404  normal  0.0446936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2138  flagellar basal body-associated protein FliL  32.87 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225342 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2191  flagellar basal body-associated protein FliL  32.87 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.697575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2133  flagellar basal body-associated protein FliL  32.87 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1144  flagellar basal body-associated protein FliL  32.87 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.100016  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1267  flagellar basal body-associated protein FliL  32.87 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1630  flagellar basal body-associated protein FliL  30.64 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1885  flagellar basal body-associated protein FliL  33.12 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0653  flagellar basal body-associated protein FliL  28.24 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0879  flagellar basal body-associated protein FliL  30.41 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0792203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03155  flagellar basal body-associated protein FliL  27.04 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3685  flagellar basal body-associated protein FliL  31.88 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0403111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  23.23 
 
 		 184 aa  52  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.927719  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3921  flagellar basal body-associated protein FliL  30.5 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4359  flagellar basal body-associated protein FliL  30.5 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1507  flagellar basal body-associated protein FliL  30.5 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5508  flagellar basal body-associated protein FliL  32.67 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2335  flagellar basal body-associated protein FliL  25.35 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0372257  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1164  flagellar basal body-associated protein FliL  28.76 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.372404  normal  0.0336547 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0860  flagellar protein (FliL)-like protein  27.59 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1372  flagellar basal body-associated protein FliL  25.81 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0654602  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0853  flagellar basal body-associated protein FliL  27.59 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.325723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2581  flagellar basal body-associated protein FliL  33.76 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3912  flagellar basal body-associated protein FliL  34.95 
 
 		 172 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0271549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3060  flagellar basal body-associated protein FliL  27.39 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0042028  normal  0.0913138 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1637  flagellar basal body-associated protein FliL  32.99 
 
 		 169 aa  47.4  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.600168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3101  flagellar basal body-associated protein FliL  35.92 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>