87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2398 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2298  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 
156 aa  313  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2398  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 
156 aa  313  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.335561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2953  flagellar basal body-associated protein FliL  64.6 
 
 
161 aa  205  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1570  flagellar basal body-associated protein FliL  61.44 
 
 
162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.195075  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1885  flagellar basal body-associated protein FliL  61.01 
 
 
161 aa  176  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2177  flagellar basal body-associated protein FliL  53.16 
 
 
154 aa  167  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000145203  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2044  flagellar basal body-associated protein FliL  53.16 
 
 
154 aa  166  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.172108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1704  flagellar basal body-associated protein FliL  53.16 
 
 
154 aa  166  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0548667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1698  flagellar basal body-associated protein FliL  53.16 
 
 
154 aa  166  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1240  flagellar basal body-associated protein FliL  53.16 
 
 
154 aa  166  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.476659  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2720  flagellar basal body-associated protein FliL  53.16 
 
 
154 aa  166  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.083272  normal  0.321922 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2138  flagellar basal body-associated protein FliL  54.72 
 
 
155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1267  flagellar basal body-associated protein FliL  54.72 
 
 
155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2191  flagellar basal body-associated protein FliL  54.72 
 
 
155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.697575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1144  flagellar basal body-associated protein FliL  54.72 
 
 
155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.100016  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2133  flagellar basal body-associated protein FliL  54.72 
 
 
155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2535  flagellar basal body-associated protein FliL  54.72 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472707  normal  0.623543 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2581  flagellar basal body-associated protein FliL  61.64 
 
 
159 aa  161  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1546  flagellar basal body-associated protein FliL  60 
 
 
159 aa  158  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1961  flagellar basal body-associated protein FliL  49.07 
 
 
165 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.245008  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5297  flagellar biosynthesis protein; flagellar basal body-associated protein  51.49 
 
 
171 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.687162  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1972  flagellar basal body-associated protein FliL  38.52 
 
 
168 aa  91.3  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.824881  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5885  flagellar basal body-associated protein FliL  48.51 
 
 
145 aa  91.3  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.42085  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0026  flagellar basal body-associated protein FliL  35.29 
 
 
180 aa  87  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34435  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3776  flagellar basal body-associated protein FliL  43.27 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.368254  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2937  flagellar basal body-associated protein FliL  40.95 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2684  flagellar basal body-associated protein FliL  34.64 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  34.64 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1868  flagellar basal body-associated protein FliL  34.64 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3498  flagellar basal body-associated protein FliL  34.64 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2765  flagellar basal body-associated protein FliL  34.64 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0239  flagellar basal body-associated protein FliL  34.64 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24170  Flagellar basal body-associated protein  39.42 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0209551  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0159  flagellar basal body-associated protein FliL  41 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.528891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0044  flagellar basal body-associated protein FliL  36.54 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0033  flagellar basal body-associated protein FliL  36.54 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0042  flagellar basal body-associated protein FliL  36.54 
 
 
178 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200475  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0644  flagellar basal body-associated protein FliL  36.79 
 
 
191 aa  77.4  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0060  flagellar basal body-associated protein FliL  36.54 
 
 
177 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0029  flagellar basal body-associated protein FliL  36.54 
 
 
177 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0041  flagellar basal body-associated protein FliL  36.54 
 
 
177 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4389  flagellar basal body-associated protein FliL  31.62 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3225  flagellar basal body-associated protein FliL  35.58 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  36.36 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4174  flagellar basal body-associated protein FliL  35.58 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0379  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1351  flagellar basal body-associated protein FliL  36.19 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.516143  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0556  flagellar basal body-associated protein FliL  30.5 
 
 
199 aa  70.5  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521306  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3075  flagellar basal body-associated protein FliL  32.47 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10365  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1606  flagellar basal body-associated protein FliL  35.95 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.0493559 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3676  flagellar basal body-associated protein FliL  30.53 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.814795 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4753  flagellar basal body-associated protein FliL  30.53 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0571  flagellar basal body-associated protein  29.77 
 
 
210 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3801  flagellar basal body-associated protein FliL  38.82 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0931816  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0767  flagellar basal body-associated protein FliL  36.21 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.577701  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1119  flagellar basal body-associated protein FliL  29.71 
 
 
208 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3569  flagellar basal body-associated protein FliL  30.72 
 
 
166 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0653  flagellar basal body-associated protein FliL  26.32 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45810  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 
173 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2906  flagellar basal body-associated protein FliL  31.36 
 
 
190 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3885  flagellar basal body-associated protein FliL  30.77 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0323637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  29.88 
 
 
173 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  25.68 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  25.68 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  22.5 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0840  flagellar basal body-associated protein FliL  26.5 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1404  flagellar basal body-associated protein FliL  24.21 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.28248  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3584  flagellar basal body-associated protein-like  31.03 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0467  flagellar basal body-associated protein FliL  27.55 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3448  flagellar basal body-associated protein FliL  25.79 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3685  flagellar basal body-associated protein FliL  24.06 
 
 
165 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0403111  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0580  flagellar basal body-associated protein FliL  20.75 
 
 
169 aa  43.9  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0783  flagellar basal body-associated protein FliL  27.54 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02881  flagellar basal body-associated protein FliL  23.16 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3921  flagellar basal body-associated protein FliL  25.19 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166425  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4359  flagellar basal body-associated protein FliL  25.93 
 
 
165 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1507  flagellar basal body-associated protein FliL  25.93 
 
 
165 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2166  flagellar basal body-associated protein FliL  25.77 
 
 
171 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1443  flagellar basal body-associated protein FliL  25.58 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.251302  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1022  flagellar basal body-associated protein FliL  23.81 
 
 
200 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5270  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.27 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.569633  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3062  flagellar basal body-associated protein FliL  25.58 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5118  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.27 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3041  flagellar basal body-associated protein FliL  26.32 
 
 
175 aa  42  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568891  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1968  flagellar protein FliL, putative  24.84 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0636604  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5209  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.27 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  26.19 
 
 
171 aa  41.2  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>