89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1704 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1240  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 
154 aa  313  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.476659  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1704  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 
154 aa  313  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0548667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1698  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 
154 aa  313  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2720  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 
154 aa  313  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.083272  normal  0.321922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2044  flagellar basal body-associated protein FliL  99.35 
 
 
154 aa  311  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.172108  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2177  flagellar basal body-associated protein FliL  99.35 
 
 
154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000145203  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2535  flagellar basal body-associated protein FliL  74.19 
 
 
155 aa  223  7e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472707  normal  0.623543 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2138  flagellar basal body-associated protein FliL  76.77 
 
 
155 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1267  flagellar basal body-associated protein FliL  76.77 
 
 
155 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1144  flagellar basal body-associated protein FliL  76.77 
 
 
155 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.100016  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2133  flagellar basal body-associated protein FliL  76.77 
 
 
155 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2191  flagellar basal body-associated protein FliL  76.77 
 
 
155 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.697575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2953  flagellar basal body-associated protein FliL  58 
 
 
161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1570  flagellar basal body-associated protein FliL  56.77 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.195075  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1885  flagellar basal body-associated protein FliL  57.23 
 
 
161 aa  149  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2298  flagellar basal body-associated protein FliL  53.16 
 
 
156 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2398  flagellar basal body-associated protein FliL  53.16 
 
 
156 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.335561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1546  flagellar basal body-associated protein FliL  55.35 
 
 
159 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2581  flagellar basal body-associated protein FliL  56.6 
 
 
159 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1961  flagellar basal body-associated protein FliL  41.41 
 
 
165 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.245008  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5297  flagellar biosynthesis protein; flagellar basal body-associated protein  51.02 
 
 
171 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.687162  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5885  flagellar basal body-associated protein FliL  46.94 
 
 
145 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.42085  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1972  flagellar basal body-associated protein FliL  36.3 
 
 
168 aa  87.8  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.824881  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24170  Flagellar basal body-associated protein  45.63 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0209551  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2937  flagellar basal body-associated protein FliL  42.31 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4174  flagellar basal body-associated protein FliL  37.25 
 
 
165 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0042  flagellar basal body-associated protein FliL  38.83 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200475  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0033  flagellar basal body-associated protein FliL  38.83 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0026  flagellar basal body-associated protein FliL  39.42 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34435  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1606  flagellar basal body-associated protein FliL  37.41 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.0493559 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0041  flagellar basal body-associated protein FliL  37.86 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0029  flagellar basal body-associated protein FliL  37.86 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0060  flagellar basal body-associated protein FliL  37.86 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3776  flagellar basal body-associated protein FliL  39.81 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.368254  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0159  flagellar basal body-associated protein FliL  42.42 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.528891 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3225  flagellar basal body-associated protein FliL  36.89 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0044  flagellar basal body-associated protein FliL  35.92 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0644  flagellar basal body-associated protein FliL  38.89 
 
 
191 aa  73.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1868  flagellar basal body-associated protein FliL  38.24 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  38.24 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2684  flagellar basal body-associated protein FliL  38.24 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3498  flagellar basal body-associated protein FliL  38.24 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0239  flagellar basal body-associated protein FliL  38.24 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2765  flagellar basal body-associated protein FliL  38.24 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1351  flagellar basal body-associated protein FliL  30.52 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.516143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  37.76 
 
 
165 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1119  flagellar basal body-associated protein FliL  30.08 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3075  flagellar basal body-associated protein FliL  40.45 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10365  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4389  flagellar basal body-associated protein FliL  38.89 
 
 
222 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3801  flagellar basal body-associated protein FliL  39.33 
 
 
190 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0931816  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0379  flagellar basal body-associated protein FliL  36.54 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0556  flagellar basal body-associated protein FliL  41.33 
 
 
199 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521306  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3676  flagellar basal body-associated protein FliL  31.97 
 
 
164 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.814795 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4753  flagellar basal body-associated protein FliL  31.97 
 
 
164 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0767  flagellar basal body-associated protein FliL  32.17 
 
 
187 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.577701  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  30.67 
 
 
173 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0571  flagellar basal body-associated protein  35.05 
 
 
210 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2906  flagellar basal body-associated protein FliL  33.04 
 
 
190 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3634  flagellar basal body-associated protein FliL  26.85 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.171536  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1022  flagellar basal body-associated protein FliL  32.53 
 
 
200 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1545  flagellar basal body-associated protein FliL  28.3 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0541868  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  28.19 
 
 
174 aa  50.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  28.19 
 
 
174 aa  50.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3885  flagellar basal body-associated protein FliL  32.77 
 
 
173 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0323637  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0653  flagellar basal body-associated protein FliL  28.79 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3584  flagellar basal body-associated protein-like  31.31 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1846  flagellar basal body-associated protein FliL  29.2 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188721  decreased coverage  0.00824516 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1404  flagellar basal body-associated protein FliL  25.86 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.28248  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  21.05 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1936  flagellar basal body-associated protein FliL  27.97 
 
 
182 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.340814  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1874  flagellar basal body-associated protein FliL  31.68 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361073  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1324  flagellar basal body-associated protein FliL  21.83 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45810  flagellar basal body-associated protein FliL  30.48 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.97 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1170  flagellar basal body-associated protein  25.15 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0840  flagellar basal body-associated protein FliL  26.09 
 
 
187 aa  45.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3569  flagellar basal body-associated protein FliL  33 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0467  flagellar basal body-associated protein FliL  28.87 
 
 
151 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5976  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.52 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3041  flagellar basal body-associated protein FliL  27.78 
 
 
175 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568891  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2166  flagellar basal body-associated protein FliL  27.62 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1507  flagellar basal body-associated protein FliL  26.36 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2930  flagellar basal body-associated protein FliL  26.04 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4359  flagellar basal body-associated protein FliL  26.36 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3921  flagellar basal body-associated protein FliL  25.45 
 
 
165 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166425  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1637  flagellar basal body-associated protein FliL  28.57 
 
 
169 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.600168  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3685  flagellar basal body-associated protein FliL  25.45 
 
 
165 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0403111  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0853  flagellar basal body-associated protein FliL  26.62 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.325723  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0580  flagellar basal body-associated protein FliL  23.23 
 
 
169 aa  40.4  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>