124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0314 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  100 
 
 		 134 aa  268  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5230  flagellar protein FliL, putative  55.73 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  55.73 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5444  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  57.36 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5209  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  63.3 
 
 		 153 aa  140  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5118  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  63.3 
 
 		 148 aa  140  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5270  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  62.96 
 
 		 134 aa  139  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.569633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5032  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  61.11 
 
 		 134 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69100  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  51.61 
 
 		 139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5976  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  56.73 
 
 		 139 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00274  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  33.08 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2419  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  33.83 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.210521  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3584  flagellar basal body-associated protein-like  38.39 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002144  flagellar biosynthesis protein FliL  28.57 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797924  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0121  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  34.59 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0126  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  34.59 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177877  hitchhiker  0.000000178382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0127  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  34.59 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3622  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  33.07 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.725258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4825  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  32.67 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2897  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  33.08 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3742  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  30.83 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254584  hitchhiker  0.00169193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4359  flagellar basal body-associated protein FliL  37.61 
 
 		 165 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3448  flagellar basal body-associated protein FliL  38.89 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1507  flagellar basal body-associated protein FliL  37.61 
 
 		 165 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2302  flagellar basal body-associated protein FliL  39.05 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  35.29 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3921  flagellar basal body-associated protein FliL  36.7 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2176  flagellar basal body-associated protein FliL  31.62 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4430  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.48 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002821  flagellar biosynthesis protein FliL  36.89 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1968  flagellar protein FliL, putative  40.59 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0636604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45810  flagellar basal body-associated protein FliL  34.15 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0126  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.99 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03155  flagellar basal body-associated protein FliL  35.92 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3685  flagellar basal body-associated protein FliL  38.53 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0403111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1545  flagellar basal body-associated protein FliL  37.14 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0541868  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0130  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.99 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4228  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.99 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0131  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.99 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3885  flagellar basal body-associated protein FliL  34.15 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0323637  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1367  flagellar basal body-associated protein FliL  35.58 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0694  Flagellar basal body-associated protein-like protein  32.56 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0467  flagellar basal body-associated protein FliL  26.62 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182844  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0127  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.2 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  32.17 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  32.17 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4147  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.48 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1710  flagellar basal body-associated protein FliL  34.62 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0049  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.03 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  28.97 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0974  flagellar basal body-associated protein FliL  36.54 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0154404  normal  0.0446936 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0132  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  32.29 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0096  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.52 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0760  flagellar basal body-associated protein FliL  30.89 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3060  flagellar basal body-associated protein FliL  35.58 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0042028  normal  0.0913138 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1874  flagellar basal body-associated protein FliL  33.01 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361073  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0488  flagellar basal body-associated protein FliL  26.98 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1372  flagellar basal body-associated protein FliL  33.02 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0654602  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1624  flagellar basal body-associated protein FliL  32.08 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0065  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.21 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.795758  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  33.06 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2291  flagellar basal body-associated protein FliL  32.41 
 
 		 175 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00070  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.92 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  33.71 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.927719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3062  flagellar basal body-associated protein FliL  29.25 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1443  flagellar basal body-associated protein FliL  32.58 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.251302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2930  flagellar basal body-associated protein FliL  32.58 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2336  flagellar basal body-associated protein FliL  25.37 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3222  flagellar basal body-associated protein FliL  30.56 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3041  flagellar basal body-associated protein FliL  32.38 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568891  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2920  flagellar basal body-associated protein FliL  29.63 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.972456  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1288  flagellar basal body-associated protein FliL  32.58 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1355  flagellar basal body-associated protein FliL  29.63 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1348  flagellar basal body-associated protein FliL  29.63 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.298791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3438  flagellar basal body-associated protein FliL  30.56 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02881  flagellar basal body-associated protein FliL  31.19 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1330  flagellar basal body-associated protein FliL  32.58 
 
 		 173 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2166  flagellar basal body-associated protein FliL  28.57 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1988  flagellar basal body-associated protein FliL  31.07 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0879  flagellar basal body-associated protein FliL  28.43 
 
 		 179 aa  50.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0792203  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1188  flagellar basal body-associated protein FliL  34.83 
 
 		 173 aa  50.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0124  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  23.76 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3634  flagellar basal body-associated protein FliL  26.85 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.171536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24170  Flagellar basal body-associated protein  29.49 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0209551  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1682  flagellar basal body-associated protein FliL  28.57 
 
 		 135 aa  48.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0379  flagellar basal body-associated protein FliL  29.36 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1756  flagellar basal body-associated protein FliL  29.37 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0653  flagellar basal body-associated protein FliL  29.41 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1704  flagellar basal body-associated protein FliL  27.73 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0548667  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2720  flagellar basal body-associated protein FliL  27.73 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.083272  normal  0.321922 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0606  flagellar basal body-associated protein FliL  29.17 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2044  flagellar basal body-associated protein FliL  27.73 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.172108  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2177  flagellar basal body-associated protein FliL  25.9 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000145203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1698  flagellar basal body-associated protein FliL  27.73 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1240  flagellar basal body-associated protein FliL  27.73 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.476659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2914  flagellar basal body-associated protein FliL  29.29 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.667538  normal  0.215161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1119  flagellar basal body-associated protein FliL  34.88 
 
 		 208 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1164  flagellar basal body-associated protein FliL  23.3 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.372404  normal  0.0336547 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1961  flagellar basal body-associated protein FliL  24.55 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.245008  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3676  flagellar basal body-associated protein FliL  26.42 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.814795 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>