131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3921 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3921  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 		 165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4359  flagellar basal body-associated protein FliL  97.58 
 
 		 165 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1507  flagellar basal body-associated protein FliL  97.58 
 
 		 165 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3685  flagellar basal body-associated protein FliL  89.7 
 
 		 165 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0403111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1545  flagellar basal body-associated protein FliL  77.38 
 
 		 167 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0541868  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3448  flagellar basal body-associated protein FliL  74.27 
 
 		 170 aa  243  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1968  flagellar protein FliL, putative  72.02 
 
 		 167 aa  228  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0636604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  55.43 
 
 		 173 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45810  flagellar basal body-associated protein FliL  59.77 
 
 		 173 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3885  flagellar basal body-associated protein FliL  59.2 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0323637  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  40.38 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2176  flagellar basal body-associated protein FliL  36.63 
 
 		 180 aa  110  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002821  flagellar biosynthesis protein FliL  37.27 
 
 		 167 aa  92  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3438  flagellar basal body-associated protein FliL  40 
 
 		 170 aa  92  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1988  flagellar basal body-associated protein FliL  39.77 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1367  flagellar basal body-associated protein FliL  33.96 
 
 		 172 aa  84.7  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2166  flagellar basal body-associated protein FliL  37.82 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3062  flagellar basal body-associated protein FliL  32.95 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1443  flagellar basal body-associated protein FliL  32.39 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.251302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1372  flagellar basal body-associated protein FliL  33.12 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0654602  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1710  flagellar basal body-associated protein FliL  30.63 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5032  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  38.53 
 
 		 134 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2920  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.972456  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1874  flagellar basal body-associated protein FliL  37.58 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361073  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1330  flagellar basal body-associated protein FliL  31.29 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0488  flagellar basal body-associated protein FliL  31.58 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3060  flagellar basal body-associated protein FliL  30.63 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0042028  normal  0.0913138 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3222  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1348  flagellar basal body-associated protein FliL  33.14 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.298791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5444  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  32.21 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3584  flagellar basal body-associated protein-like  33.04 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69100  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  35.25 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2930  flagellar basal body-associated protein FliL  31.07 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5209  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  35.78 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1624  flagellar basal body-associated protein FliL  30.51 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5118  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  35.78 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0694  Flagellar basal body-associated protein-like protein  34.78 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5976  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  35.25 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0974  flagellar basal body-associated protein FliL  36.54 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0154404  normal  0.0446936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  36.7 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5270  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  35.78 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.569633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2302  flagellar basal body-associated protein FliL  33.85 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2291  flagellar basal body-associated protein FliL  31.46 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  30.06 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5230  flagellar protein FliL, putative  36.7 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  36.7 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  32.89 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  32.89 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02881  flagellar basal body-associated protein FliL  27.47 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1188  flagellar basal body-associated protein FliL  30.57 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03155  flagellar basal body-associated protein FliL  33.96 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0467  flagellar basal body-associated protein FliL  35.4 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1606  flagellar basal body-associated protein FliL  34.36 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.0493559 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002144  flagellar biosynthesis protein FliL  31.3 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797924  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2336  flagellar basal body-associated protein FliL  33.01 
 
 		 132 aa  62  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1288  flagellar basal body-associated protein FliL  29.88 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0127  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.59 
 
 		 136 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178302 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1355  flagellar basal body-associated protein FliL  30.49 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2419  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  34.26 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.210521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  28.26 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.927719  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00274  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  30.43 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2897  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  32.5 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0121  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.21 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0126  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.21 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177877  hitchhiker  0.000000178382 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0026  flagellar basal body-associated protein FliL  25.93 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4825  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.45 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0126  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.81 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1351  flagellar basal body-associated protein FliL  28.87 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.516143  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4753  flagellar basal body-associated protein FliL  31.43 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3676  flagellar basal body-associated protein FliL  31.43 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.814795 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0760  flagellar basal body-associated protein FliL  28.85 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0130  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.09 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1119  flagellar basal body-associated protein FliL  30.52 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3742  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25.86 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254584  hitchhiker  0.00169193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0049  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.59 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0127  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.43 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4430  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.47 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2765  flagellar basal body-associated protein FliL  26.71 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0239  flagellar basal body-associated protein FliL  26.71 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0096  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  23.48 
 
 		 133 aa  52.4  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3498  flagellar basal body-associated protein FliL  26.71 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0606  flagellar basal body-associated protein FliL  26.97 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1868  flagellar basal body-associated protein FliL  26.71 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4228  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25.36 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  26.71 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2684  flagellar basal body-associated protein FliL  26.71 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4147  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.45 
 
 		 133 aa  52.4  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0131  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25.36 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00070  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.62 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0580  flagellar basal body-associated protein FliL  26.9 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1961  flagellar basal body-associated protein FliL  26.19 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.245008  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  27.33 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3622  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.47 
 
 		 133 aa  50.8  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.725258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2044  flagellar basal body-associated protein FliL  26.14 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.172108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1170  flagellar basal body-associated protein  28 
 
 		 167 aa  50.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1704  flagellar basal body-associated protein FliL  26.14 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0548667  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2720  flagellar basal body-associated protein FliL  26.14 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.083272  normal  0.321922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2177  flagellar basal body-associated protein FliL  26.14 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000145203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1698  flagellar basal body-associated protein FliL  26.14 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1240  flagellar basal body-associated protein FliL  26.14 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.476659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>