90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3041 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3041  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 		 175 aa  348  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568891  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02881  flagellar basal body-associated protein FliL  56.52 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  51.7 
 
 		 184 aa  164  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.927719  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3060  flagellar basal body-associated protein FliL  50.3 
 
 		 173 aa  147  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0042028  normal  0.0913138 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002821  flagellar biosynthesis protein FliL  43.75 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1372  flagellar basal body-associated protein FliL  47.02 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0654602  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1624  flagellar basal body-associated protein FliL  49.14 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2930  flagellar basal body-associated protein FliL  44.44 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3062  flagellar basal body-associated protein FliL  44.63 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1443  flagellar basal body-associated protein FliL  44.63 
 
 		 174 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.251302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1188  flagellar basal body-associated protein FliL  44.75 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  43.75 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2291  flagellar basal body-associated protein FliL  47.49 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1710  flagellar basal body-associated protein FliL  41.14 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2920  flagellar basal body-associated protein FliL  44.97 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.972456  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1348  flagellar basal body-associated protein FliL  46.67 
 
 		 174 aa  127  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.298791 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1367  flagellar basal body-associated protein FliL  44.69 
 
 		 172 aa  124  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1330  flagellar basal body-associated protein FliL  44 
 
 		 173 aa  124  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03155  flagellar basal body-associated protein FliL  41.48 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3222  flagellar basal body-associated protein FliL  43.27 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1288  flagellar basal body-associated protein FliL  49.31 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1355  flagellar basal body-associated protein FliL  48.61 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2302  flagellar basal body-associated protein FliL  35.19 
 
 		 161 aa  98.2  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  32.94 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  28.8 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3885  flagellar basal body-associated protein FliL  36.84 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0323637  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  27.22 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  27.22 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2176  flagellar basal body-associated protein FliL  28.48 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1874  flagellar basal body-associated protein FliL  40.48 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361073  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1545  flagellar basal body-associated protein FliL  26.97 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0541868  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3448  flagellar basal body-associated protein FliL  28.16 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45810  flagellar basal body-associated protein FliL  34.21 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1968  flagellar protein FliL, putative  26.97 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0636604  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0974  flagellar basal body-associated protein FliL  33.01 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0154404  normal  0.0446936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0556  flagellar basal body-associated protein FliL  29.87 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521306  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0488  flagellar basal body-associated protein FliL  31.13 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5230  flagellar protein FliL, putative  32.08 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  32.08 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5209  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  31.73 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0706  flagellar basal body-associated protein FliL  27.91 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3584  flagellar basal body-associated protein-like  26.61 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5118  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  31.73 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  32.38 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5032  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  31.73 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4389  flagellar basal body-associated protein FliL  26.37 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4753  flagellar basal body-associated protein FliL  24.66 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3676  flagellar basal body-associated protein FliL  24.66 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.814795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5270  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  30.77 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.569633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2166  flagellar basal body-associated protein FliL  29.91 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5444  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.85 
 
 		 146 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24170  Flagellar basal body-associated protein  28.85 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0209551  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4359  flagellar basal body-associated protein FliL  30 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1698  flagellar basal body-associated protein FliL  24.28 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1240  flagellar basal body-associated protein FliL  24.28 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.476659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2720  flagellar basal body-associated protein FliL  24.28 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.083272  normal  0.321922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2044  flagellar basal body-associated protein FliL  24.28 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.172108  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1606  flagellar basal body-associated protein FliL  24.1 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.0493559 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1704  flagellar basal body-associated protein FliL  24.28 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0548667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1507  flagellar basal body-associated protein FliL  30 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3569  flagellar basal body-associated protein FliL  28.3 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2177  flagellar basal body-associated protein FliL  24.28 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000145203  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0923  flagellar basal body-associated protein FliL  23.46 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.102944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69100  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.03 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3921  flagellar basal body-associated protein FliL  27.62 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3438  flagellar basal body-associated protein FliL  28.43 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5976  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.03 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1570  flagellar basal body-associated protein FliL  22.91 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.195075  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3586  flagellar protein FliL  28.09 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.89846  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3685  flagellar basal body-associated protein FliL  31.25 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0403111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0379  flagellar basal body-associated protein FliL  25.17 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1119  flagellar basal body-associated protein FliL  24.16 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  25.27 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3436  flagellar basal body-associated protein FliL  27.62 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1170  flagellar basal body-associated protein  26.7 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0879  flagellar basal body-associated protein FliL  23.33 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0792203  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00070  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  24.58 
 
 		 137 aa  44.7  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1972  flagellar basal body-associated protein FliL  21.56 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.824881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2336  flagellar basal body-associated protein FliL  25.45 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1267  flagellar basal body-associated protein FliL  29.59 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1144  flagellar basal body-associated protein FliL  29.59 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.100016  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2133  flagellar basal body-associated protein FliL  29.59 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2191  flagellar basal body-associated protein FliL  29.59 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.697575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2138  flagellar basal body-associated protein FliL  29.59 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225342 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0571  flagellar basal body-associated protein  26.57 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5508  flagellar basal body-associated protein FliL  28.48 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1164  flagellar basal body-associated protein FliL  25.56 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.372404  normal  0.0336547 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0653  flagellar basal body-associated protein FliL  28.65 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2398  flagellar basal body-associated protein FliL  22.35 
 
 		 156 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.335561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2298  flagellar basal body-associated protein FliL  22.35 
 
 		 156 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>