136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1968 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1968  flagellar protein FliL, putative  100 
 
 		 167 aa  333  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0636604  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3448  flagellar basal body-associated protein FliL  94.74 
 
 		 170 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1545  flagellar basal body-associated protein FliL  73.81 
 
 		 167 aa  249  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0541868  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3921  flagellar basal body-associated protein FliL  76.19 
 
 		 165 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4359  flagellar basal body-associated protein FliL  75 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1507  flagellar basal body-associated protein FliL  75 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3685  flagellar basal body-associated protein FliL  75.6 
 
 		 165 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0403111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  57.5 
 
 		 173 aa  189  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45810  flagellar basal body-associated protein FliL  56.9 
 
 		 173 aa  180  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3885  flagellar basal body-associated protein FliL  55.75 
 
 		 173 aa  174  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0323637  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  39.77 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2176  flagellar basal body-associated protein FliL  37.34 
 
 		 180 aa  117  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002821  flagellar biosynthesis protein FliL  38.75 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1710  flagellar basal body-associated protein FliL  35.67 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3062  flagellar basal body-associated protein FliL  33.14 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1988  flagellar basal body-associated protein FliL  39.24 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1367  flagellar basal body-associated protein FliL  31.74 
 
 		 172 aa  87.8  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1443  flagellar basal body-associated protein FliL  32.57 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.251302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3438  flagellar basal body-associated protein FliL  36.54 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  36.67 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  36.67 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  30.95 
 
 		 171 aa  84.3  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2930  flagellar basal body-associated protein FliL  32.39 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03155  flagellar basal body-associated protein FliL  34.81 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1330  flagellar basal body-associated protein FliL  31.03 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1372  flagellar basal body-associated protein FliL  32.91 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0654602  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2920  flagellar basal body-associated protein FliL  32.92 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.972456  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3222  flagellar basal body-associated protein FliL  32.1 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1348  flagellar basal body-associated protein FliL  32.34 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.298791 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3060  flagellar basal body-associated protein FliL  30.19 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0042028  normal  0.0913138 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2302  flagellar basal body-associated protein FliL  35.38 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2166  flagellar basal body-associated protein FliL  33.62 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1624  flagellar basal body-associated protein FliL  31.9 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1874  flagellar basal body-associated protein FliL  38.61 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361073  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3584  flagellar basal body-associated protein-like  34.86 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  30.6 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.927719  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02881  flagellar basal body-associated protein FliL  29.89 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0974  flagellar basal body-associated protein FliL  35.92 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0154404  normal  0.0446936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69100  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  37.9 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1188  flagellar basal body-associated protein FliL  29.63 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  38.89 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2291  flagellar basal body-associated protein FliL  31.32 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1288  flagellar basal body-associated protein FliL  30.49 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0488  flagellar basal body-associated protein FliL  29.56 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5032  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  35.34 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5976  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  35.48 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5209  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  35.45 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5444  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  32.24 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5118  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  35.45 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5270  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  35.45 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.569633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1355  flagellar basal body-associated protein FliL  31.74 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5230  flagellar protein FliL, putative  36.11 
 
 		 135 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  36.11 
 
 		 135 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0467  flagellar basal body-associated protein FliL  33.62 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2419  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  32.71 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.210521  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00070  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.7 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0580  flagellar basal body-associated protein FliL  27.27 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002144  flagellar biosynthesis protein FliL  29.51 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00274  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  30.33 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2897  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  31.9 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0026  flagellar basal body-associated protein FliL  27.61 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0127  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.34 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1606  flagellar basal body-associated protein FliL  30.54 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.0493559 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3622  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25.86 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.725258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1164  flagellar basal body-associated protein FliL  24.36 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.372404  normal  0.0336547 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1119  flagellar basal body-associated protein FliL  26.5 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2765  flagellar basal body-associated protein FliL  26.71 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0239  flagellar basal body-associated protein FliL  26.71 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3498  flagellar basal body-associated protein FliL  26.71 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1868  flagellar basal body-associated protein FliL  26.71 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  26.71 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2684  flagellar basal body-associated protein FliL  26.71 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  25.93 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2336  flagellar basal body-associated protein FliL  28.81 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4430  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  21.37 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0126  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.24 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0049  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  23.47 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1351  flagellar basal body-associated protein FliL  26.63 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.516143  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1972  flagellar basal body-associated protein FliL  25 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.824881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0044  flagellar basal body-associated protein FliL  30.1 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0130  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.47 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0760  flagellar basal body-associated protein FliL  28 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0694  Flagellar basal body-associated protein-like protein  27.27 
 
 		 134 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24170  Flagellar basal body-associated protein  31.06 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0209551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3041  flagellar basal body-associated protein FliL  28.42 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568891  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1320  flagellar basal body-associated protein FliL  24.28 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0264374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3742  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  23.48 
 
 		 135 aa  51.6  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254584  hitchhiker  0.00169193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4825  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  23.96 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4228  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25.74 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0131  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25.74 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0127  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25 
 
 		 136 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3225  flagellar basal body-associated protein FliL  30.38 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0042  flagellar basal body-associated protein FliL  30.38 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0033  flagellar basal body-associated protein FliL  30.38 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0096  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  22.81 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018352  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0126  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  24.49 
 
 		 136 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177877  hitchhiker  0.000000178382 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4753  flagellar basal body-associated protein FliL  27.27 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3676  flagellar basal body-associated protein FliL  27.27 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.814795 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0653  flagellar basal body-associated protein FliL  27.71 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1741  flagellar basal body-associated protein FliL  26.45 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>