87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1188 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1188  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 		 173 aa  348  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3062  flagellar basal body-associated protein FliL  70.93 
 
 		 174 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1443  flagellar basal body-associated protein FliL  70.93 
 
 		 174 aa  233  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.251302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2930  flagellar basal body-associated protein FliL  70.86 
 
 		 175 aa  231  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3060  flagellar basal body-associated protein FliL  73.91 
 
 		 173 aa  231  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0042028  normal  0.0913138 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1330  flagellar basal body-associated protein FliL  69.36 
 
 		 173 aa  228  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2920  flagellar basal body-associated protein FliL  73.75 
 
 		 175 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.972456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1624  flagellar basal body-associated protein FliL  70.93 
 
 		 172 aa  227  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3222  flagellar basal body-associated protein FliL  72.96 
 
 		 174 aa  223  8e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  69.94 
 
 		 171 aa  223  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1372  flagellar basal body-associated protein FliL  69.81 
 
 		 173 aa  221  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0654602  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1348  flagellar basal body-associated protein FliL  72.96 
 
 		 174 aa  217  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.298791 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1288  flagellar basal body-associated protein FliL  72.5 
 
 		 175 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1355  flagellar basal body-associated protein FliL  72.5 
 
 		 175 aa  209  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2291  flagellar basal body-associated protein FliL  65.71 
 
 		 175 aa  207  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1367  flagellar basal body-associated protein FliL  61.63 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02881  flagellar basal body-associated protein FliL  45.41 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  47.77 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.927719  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002821  flagellar biosynthesis protein FliL  43.75 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3041  flagellar basal body-associated protein FliL  42.13 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568891  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1710  flagellar basal body-associated protein FliL  42.37 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2302  flagellar basal body-associated protein FliL  43.8 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03155  flagellar basal body-associated protein FliL  43.75 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1545  flagellar basal body-associated protein FliL  32.69 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0541868  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  35.8 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3448  flagellar basal body-associated protein FliL  30.43 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  32.26 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  32.26 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  28.74 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3885  flagellar basal body-associated protein FliL  33.09 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0323637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45810  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1968  flagellar protein FliL, putative  28.4 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0636604  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5118  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  36.54 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5209  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  36.54 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2176  flagellar basal body-associated protein FliL  26.9 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5270  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  35.58 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.569633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0488  flagellar basal body-associated protein FliL  30.97 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5032  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  33.64 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0694  Flagellar basal body-associated protein-like protein  30.39 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5444  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  30.43 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0974  flagellar basal body-associated protein FliL  29.33 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0154404  normal  0.0446936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3685  flagellar basal body-associated protein FliL  29.5 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0403111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3921  flagellar basal body-associated protein FliL  29.5 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1874  flagellar basal body-associated protein FliL  32.85 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361073  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  31.78 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5230  flagellar protein FliL, putative  31.78 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4359  flagellar basal body-associated protein FliL  30.94 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1507  flagellar basal body-associated protein FliL  30.94 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2166  flagellar basal body-associated protein FliL  27.14 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  31.48 
 
 		 134 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2336  flagellar basal body-associated protein FliL  28.57 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0760  flagellar basal body-associated protein FliL  31.07 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0923  flagellar basal body-associated protein FliL  27.01 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.102944  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0130  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.71 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0126  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  32.1 
 
 		 136 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177877  hitchhiker  0.000000178382 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3436  flagellar basal body-associated protein FliL  27.03 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4228  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.71 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0131  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.71 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0126  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.71 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1320  flagellar basal body-associated protein FliL  28.3 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0264374  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0121  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  32.1 
 
 		 136 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0127  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  32.1 
 
 		 136 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0132  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  32.1 
 
 		 136 aa  47.4  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3294  flagellar basal body-associated protein FliL  26.29 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  28.98 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3438  flagellar basal body-associated protein FliL  27.36 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5976  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  31.37 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3622  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.78 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.725258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002144  flagellar biosynthesis protein FliL  28.05 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69100  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  31.37 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3584  flagellar basal body-associated protein-like  29.36 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00274  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.05 
 
 		 136 aa  45.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4825  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  30.86 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0127  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  24.31 
 
 		 140 aa  44.7  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0124  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27 
 
 		 129 aa  44.7  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4430  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.4 
 
 		 137 aa  44.7  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1170  flagellar basal body-associated protein  25 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2419  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.83 
 
 		 136 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.210521  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1630  flagellar basal body-associated protein FliL  24.59 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0860  flagellar protein (FliL)-like protein  29.9 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1988  flagellar basal body-associated protein FliL  24.31 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4147  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.32 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0049  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  24.07 
 
 		 133 aa  42  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2897  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.83 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0879  flagellar basal body-associated protein FliL  28.86 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0096  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.16 
 
 		 133 aa  40.8  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018352  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0606  flagellar basal body-associated protein FliL  25.97 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>