87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4430 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4430  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3742  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  72.59 
 
 		 135 aa  213  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254584  hitchhiker  0.00169193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4825  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  67.86 
 
 		 150 aa  203  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0049  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  65.93 
 
 		 133 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3622  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  70 
 
 		 133 aa  190  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.725258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0096  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  74.55 
 
 		 133 aa  186  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4147  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  60 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0126  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  61.27 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0130  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  60.56 
 
 		 140 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0131  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  60.56 
 
 		 140 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4228  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  60.56 
 
 		 140 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0126  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  60.29 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177877  hitchhiker  0.000000178382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0127  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  60.29 
 
 		 136 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178302 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0121  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  59.56 
 
 		 136 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0127  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  57.75 
 
 		 140 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0132  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  60.29 
 
 		 136 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0065  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  45.99 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.795758  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00070  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  47.37 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2897  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  40.88 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002144  flagellar biosynthesis protein FliL  46.28 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797924  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0124  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  52.38 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00274  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  44.54 
 
 		 136 aa  120  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2419  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  38.28 
 
 		 136 aa  120  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.210521  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69100  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.36 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2176  flagellar basal body-associated protein FliL  28.7 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.95 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5976  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.36 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  28.71 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5270  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.569633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.69 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5230  flagellar protein FliL, putative  29.69 
 
 		 135 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45810  flagellar basal body-associated protein FliL  28.12 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  22.02 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  22.02 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5118  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.88 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0694  Flagellar basal body-associated protein-like protein  27.72 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5032  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.21 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5209  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.1 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3885  flagellar basal body-associated protein FliL  26.04 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0323637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1545  flagellar basal body-associated protein FliL  25 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0541868  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1874  flagellar basal body-associated protein FliL  23.76 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361073  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5444  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.4 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0467  flagellar basal body-associated protein FliL  25.56 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182844  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1507  flagellar basal body-associated protein FliL  27.45 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3438  flagellar basal body-associated protein FliL  24.75 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0488  flagellar basal body-associated protein FliL  23.19 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4359  flagellar basal body-associated protein FliL  27.45 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3060  flagellar basal body-associated protein FliL  27.68 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0042028  normal  0.0913138 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1968  flagellar protein FliL, putative  23.47 
 
 		 167 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0636604  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3921  flagellar basal body-associated protein FliL  26.47 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1624  flagellar basal body-associated protein FliL  27.45 
 
 		 172 aa  52  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03155  flagellar basal body-associated protein FliL  27.45 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3448  flagellar basal body-associated protein FliL  23.47 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1372  flagellar basal body-associated protein FliL  30.86 
 
 		 173 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0654602  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3685  flagellar basal body-associated protein FliL  26.47 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0403111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1367  flagellar basal body-associated protein FliL  26.96 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002821  flagellar biosynthesis protein FliL  26.04 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3584  flagellar basal body-associated protein-like  20.39 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1710  flagellar basal body-associated protein FliL  24.76 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  28.4 
 
 		 171 aa  50.1  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1682  flagellar basal body-associated protein FliL  29.81 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2166  flagellar basal body-associated protein FliL  20.59 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  22.77 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1355  flagellar basal body-associated protein FliL  27.5 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1288  flagellar basal body-associated protein FliL  27.5 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2920  flagellar basal body-associated protein FliL  27.16 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.972456  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1443  flagellar basal body-associated protein FliL  27.16 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.251302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3062  flagellar basal body-associated protein FliL  27.16 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2930  flagellar basal body-associated protein FliL  27.16 
 
 		 175 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1348  flagellar basal body-associated protein FliL  27.16 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.298791 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3222  flagellar basal body-associated protein FliL  27.16 
 
 		 174 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0760  flagellar basal body-associated protein FliL  25.49 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2291  flagellar basal body-associated protein FliL  27.16 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1988  flagellar basal body-associated protein FliL  26.47 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1164  flagellar basal body-associated protein FliL  26.19 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.372404  normal  0.0336547 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1188  flagellar basal body-associated protein FliL  28.4 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1330  flagellar basal body-associated protein FliL  25.74 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02881  flagellar basal body-associated protein FliL  22.77 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2302  flagellar basal body-associated protein FliL  21.35 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3498  flagellar basal body-associated protein FliL  23.76 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2684  flagellar basal body-associated protein FliL  23.76 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  23.76 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1868  flagellar basal body-associated protein FliL  23.76 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0026  flagellar basal body-associated protein FliL  28.3 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0239  flagellar basal body-associated protein FliL  23.76 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2765  flagellar basal body-associated protein FliL  23.76 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0974  flagellar basal body-associated protein FliL  20.75 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0154404  normal  0.0446936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>