104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3222 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3222  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 		 174 aa  345  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3062  flagellar basal body-associated protein FliL  85.06 
 
 		 174 aa  292  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1443  flagellar basal body-associated protein FliL  84.48 
 
 		 174 aa  290  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.251302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  82.76 
 
 		 171 aa  290  8e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2930  flagellar basal body-associated protein FliL  85.23 
 
 		 175 aa  288  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1348  flagellar basal body-associated protein FliL  89.71 
 
 		 174 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.298791 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2920  flagellar basal body-associated protein FliL  85.8 
 
 		 175 aa  269  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.972456  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1288  flagellar basal body-associated protein FliL  87.43 
 
 		 175 aa  258  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1355  flagellar basal body-associated protein FliL  87.43 
 
 		 175 aa  255  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1188  flagellar basal body-associated protein FliL  70.93 
 
 		 173 aa  235  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2291  flagellar basal body-associated protein FliL  74.58 
 
 		 175 aa  231  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3060  flagellar basal body-associated protein FliL  71.84 
 
 		 173 aa  230  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0042028  normal  0.0913138 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1330  flagellar basal body-associated protein FliL  70.45 
 
 		 173 aa  225  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1624  flagellar basal body-associated protein FliL  70.45 
 
 		 172 aa  224  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1372  flagellar basal body-associated protein FliL  70.62 
 
 		 173 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0654602  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1367  flagellar basal body-associated protein FliL  64.25 
 
 		 172 aa  201  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02881  flagellar basal body-associated protein FliL  47.78 
 
 		 179 aa  140  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  48.28 
 
 		 184 aa  134  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.927719  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002821  flagellar biosynthesis protein FliL  45.98 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1710  flagellar basal body-associated protein FliL  46.63 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2302  flagellar basal body-associated protein FliL  42.77 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03155  flagellar basal body-associated protein FliL  43.1 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3041  flagellar basal body-associated protein FliL  47.18 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568891  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1545  flagellar basal body-associated protein FliL  37.08 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0541868  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  38.67 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3885  flagellar basal body-associated protein FliL  35.03 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0323637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45810  flagellar basal body-associated protein FliL  33.9 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  36.31 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  36.31 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  32.78 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3448  flagellar basal body-associated protein FliL  30.81 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1968  flagellar protein FliL, putative  32.57 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0636604  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0694  Flagellar basal body-associated protein-like protein  32.73 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3436  flagellar basal body-associated protein FliL  32.62 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3685  flagellar basal body-associated protein FliL  33.09 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0403111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2176  flagellar basal body-associated protein FliL  29.61 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  30.66 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3921  flagellar basal body-associated protein FliL  32.16 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166425  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5230  flagellar protein FliL, putative  33.03 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0488  flagellar basal body-associated protein FliL  27.56 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4359  flagellar basal body-associated protein FliL  32.75 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1507  flagellar basal body-associated protein FliL  32.75 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5270  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  35.24 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.569633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5209  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  34.29 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5118  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  34.29 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0974  flagellar basal body-associated protein FliL  33.63 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0154404  normal  0.0446936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5032  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  33.33 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0923  flagellar basal body-associated protein FliL  28.25 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.102944  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5444  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.2 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1874  flagellar basal body-associated protein FliL  34.95 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361073  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2166  flagellar basal body-associated protein FliL  31.2 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002144  flagellar biosynthesis protein FliL  26.32 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797924  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  30.56 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00274  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.32 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0130  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.57 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0126  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.57 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4228  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.57 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0131  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.57 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0126  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  31.03 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177877  hitchhiker  0.000000178382 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2336  flagellar basal body-associated protein FliL  30.21 
 
 		 132 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3584  flagellar basal body-associated protein-like  31.25 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  27.84 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0127  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.2 
 
 		 136 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178302 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0121  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  31.03 
 
 		 136 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0127  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25.44 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0132  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  31.03 
 
 		 136 aa  51.6  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3828  flagellar basal body-associated protein FliL  35.5 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1988  flagellar basal body-associated protein FliL  27.75 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2419  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25.64 
 
 		 136 aa  51.6  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.210521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3294  flagellar basal body-associated protein FliL  26.56 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3622  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.59 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.725258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3438  flagellar basal body-associated protein FliL  26.92 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00070  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  24.56 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3912  flagellar basal body-associated protein FliL  34.71 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0271549 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69100  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  30.39 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5976  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  30.39 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1320  flagellar basal body-associated protein FliL  27.81 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0264374  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0049  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.03 
 
 		 133 aa  48.9  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0760  flagellar basal body-associated protein FliL  29.13 
 
 		 140 aa  48.5  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0026  flagellar basal body-associated protein FliL  31.52 
 
 		 180 aa  48.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0096  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25.44 
 
 		 133 aa  47.8  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4825  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.63 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4430  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  27.16 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1170  flagellar basal body-associated protein  30.18 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1119  flagellar basal body-associated protein FliL  30.16 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0706  flagellar basal body-associated protein FliL  26.47 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3247  flagellar basal body-associated protein FliL  30.59 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1741  flagellar basal body-associated protein FliL  28.03 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1606  flagellar basal body-associated protein FliL  27.38 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.0493559 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0556  flagellar basal body-associated protein FliL  23.97 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3634  flagellar basal body-associated protein FliL  23.75 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.171536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1407  flagellar basal body-associated protein FliL  28.03 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.875078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0580  flagellar basal body-associated protein FliL  24.43 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1595  flagellar basal body-associated protein FliL  28.03 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2897  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  24.39 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1972  flagellar basal body-associated protein FliL  28.67 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.824881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3742  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.44 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254584  hitchhiker  0.00169193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4147  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.74 
 
 		 133 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24170  Flagellar basal body-associated protein  30.1 
 
 		 162 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0209551  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4753  flagellar basal body-associated protein FliL  28.17 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.887693 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>