88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1330 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1330  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 		 173 aa  346  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1188  flagellar basal body-associated protein FliL  70.11 
 
 		 173 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2930  flagellar basal body-associated protein FliL  66.86 
 
 		 175 aa  231  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3062  flagellar basal body-associated protein FliL  68 
 
 		 174 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1443  flagellar basal body-associated protein FliL  68 
 
 		 174 aa  230  9e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.251302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2920  flagellar basal body-associated protein FliL  72.22 
 
 		 175 aa  225  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.972456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3060  flagellar basal body-associated protein FliL  70.12 
 
 		 173 aa  225  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0042028  normal  0.0913138 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  66.85 
 
 		 171 aa  225  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1624  flagellar basal body-associated protein FliL  68.97 
 
 		 172 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2291  flagellar basal body-associated protein FliL  67.43 
 
 		 175 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3222  flagellar basal body-associated protein FliL  72.67 
 
 		 174 aa  214  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1348  flagellar basal body-associated protein FliL  70.99 
 
 		 174 aa  209  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.298791 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1288  flagellar basal body-associated protein FliL  68.75 
 
 		 175 aa  207  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1355  flagellar basal body-associated protein FliL  68.75 
 
 		 175 aa  207  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1372  flagellar basal body-associated protein FliL  66.67 
 
 		 173 aa  206  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0654602  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1367  flagellar basal body-associated protein FliL  63.48 
 
 		 172 aa  205  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02881  flagellar basal body-associated protein FliL  46.41 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  46.1 
 
 		 184 aa  124  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.927719  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002821  flagellar biosynthesis protein FliL  41.18 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1710  flagellar basal body-associated protein FliL  42.86 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03155  flagellar basal body-associated protein FliL  40.59 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3041  flagellar basal body-associated protein FliL  45.2 
 
 		 175 aa  114  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568891  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2302  flagellar basal body-associated protein FliL  38.12 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  39.02 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1545  flagellar basal body-associated protein FliL  32.95 
 
 		 167 aa  89  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0541868  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3448  flagellar basal body-associated protein FliL  33.74 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1968  flagellar protein FliL, putative  31.03 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0636604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  31.41 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  31.41 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2176  flagellar basal body-associated protein FliL  27.61 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3885  flagellar basal body-associated protein FliL  34.15 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0323637  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  31.1 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45810  flagellar basal body-associated protein FliL  33.95 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5270  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  36.54 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.569633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5209  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  34.86 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5118  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  34.86 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0488  flagellar basal body-associated protein FliL  25.32 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0694  Flagellar basal body-associated protein-like protein  32.35 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5032  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  34.58 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0974  flagellar basal body-associated protein FliL  32.74 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0154404  normal  0.0446936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3921  flagellar basal body-associated protein FliL  30.56 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3685  flagellar basal body-associated protein FliL  30.66 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0403111  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5230  flagellar protein FliL, putative  30.84 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5444  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.47 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  30.84 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4359  flagellar basal body-associated protein FliL  32.38 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1507  flagellar basal body-associated protein FliL  32.38 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3436  flagellar basal body-associated protein FliL  26.11 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2166  flagellar basal body-associated protein FliL  29.37 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1874  flagellar basal body-associated protein FliL  33.65 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361073  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1170  flagellar basal body-associated protein  26.25 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0126  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.21 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0130  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.32 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0131  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.32 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4228  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.32 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2336  flagellar basal body-associated protein FliL  25.55 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2419  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  29.27 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.210521  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0923  flagellar basal body-associated protein FliL  28.18 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.102944  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  30.17 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0126  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.71 
 
 		 136 aa  52  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177877  hitchhiker  0.000000178382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5976  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  30.39 
 
 		 139 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0127  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69100  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  32.52 
 
 		 139 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002144  flagellar biosynthesis protein FliL  26.83 
 
 		 136 aa  51.2  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797924  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0121  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.71 
 
 		 136 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00070  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  24.14 
 
 		 137 aa  50.8  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1320  flagellar basal body-associated protein FliL  30 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0264374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0127  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.71 
 
 		 136 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0049  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  24.83 
 
 		 133 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1988  flagellar basal body-associated protein FliL  27.46 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0132  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  28.3 
 
 		 136 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00274  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.83 
 
 		 136 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0860  flagellar protein (FliL)-like protein  28.65 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3584  flagellar basal body-associated protein-like  24.77 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3438  flagellar basal body-associated protein FliL  25.96 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3622  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25.49 
 
 		 133 aa  45.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.725258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1630  flagellar basal body-associated protein FliL  29.26 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3294  flagellar basal body-associated protein FliL  24.59 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4825  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.42 
 
 		 150 aa  44.7  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4430  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25.49 
 
 		 137 aa  44.3  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0096  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.42 
 
 		 133 aa  44.3  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018352  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2897  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  20.14 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3742  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.47 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254584  hitchhiker  0.00169193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3951  flagellar basal body-associated protein FliL  25.95 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4147  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25.18 
 
 		 133 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  27.84 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0760  flagellar basal body-associated protein FliL  27.18 
 
 		 140 aa  42.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0580  flagellar basal body-associated protein FliL  23.76 
 
 		 169 aa  40.8  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>