More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2793 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2793  putative chloramphenicol acetyltransferase  100 
 
 
210 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1998  chloramphenicol acetyltransferase  76.92 
 
 
213 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.427174  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1536  putative chloramphenicol acetyltransferase  74.76 
 
 
208 aa  341  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000290239  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1181  antibiotic acetyltransferase  64.39 
 
 
240 aa  288  6e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0246811  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3561  hexapaptide repeat-containing transferase  62.8 
 
 
211 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.367656  normal  0.425944 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4299  chloramphenicol acetyltransferase  67.96 
 
 
210 aa  276  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2950  chloramphenicol O-acetyltransferase  67.15 
 
 
210 aa  274  7e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359614  normal  0.149612 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1388  hexapaptide repeat-containing transferase  63.59 
 
 
211 aa  261  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220754  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0116  hexapaptide repeat-containing transferase  61.95 
 
 
211 aa  256  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278258  hitchhiker  0.00730231 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1494  chloramphenicol O-acetyltransferase  58.17 
 
 
218 aa  255  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00845499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2289  hexapaptide repeat-containing transferase  57.21 
 
 
216 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000997  acetyltransferase  53.49 
 
 
219 aa  229  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55170  chloramphenicol acetyltransferase  67.61 
 
 
177 aa  224  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000006331 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07054  acetyltransferase  54.79 
 
 
217 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0600  hexapaptide repeat-containing transferase  47.92 
 
 
226 aa  194  7e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.152008  normal  0.590208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4802  chloramphenicol acetyltransferase  67.79 
 
 
294 aa  187  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0223  hexapaptide repeat-containing transferase  43.2 
 
 
226 aa  184  8e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  43.69 
 
 
226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.476323  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0665  hexapaptide repeat-containing transferase  45.73 
 
 
226 aa  180  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5557  hexapaptide repeat-containing transferase  46.67 
 
 
219 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  44.29 
 
 
219 aa  167  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2303  hexapaptide repeat-containing transferase  45.24 
 
 
219 aa  167  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  44.29 
 
 
219 aa  167  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3169  streptogramin A acetyl transferase  44.28 
 
 
213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.210498  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4048  acetyltransferase  44.92 
 
 
209 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.638 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2073  VatB  44.5 
 
 
211 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0183643  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0391  streptogramin A acetyl transferase  44.78 
 
 
216 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2049  VatB  43.98 
 
 
211 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000461  antibiotic acetyltransferase  42.35 
 
 
214 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0994  acetyltransferase  41.62 
 
 
210 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1384  streptogramin A acetyl transferase  45.5 
 
 
226 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0253879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0322  antibiotic acetyltransferase  41.84 
 
 
215 aa  149  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.799706 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  42.71 
 
 
210 aa  148  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0155  hexapaptide repeat-containing transferase  45.03 
 
 
212 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479916 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0704  chloramphenicol O-acetyltransferase  41.27 
 
 
211 aa  144  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.191265  normal  0.790707 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2671  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  41.71 
 
 
210 aa  144  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0117743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2450  acetyltransferase  41.71 
 
 
210 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.602654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2629  acetyltransferase  41.71 
 
 
210 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2973  streptogramin A acetyl transferase  42.33 
 
 
217 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2375  virginiamycin A acetyltransferase  41.71 
 
 
210 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.462397  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04620  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  42.39 
 
 
218 aa  141  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2698  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  40.7 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.832761  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0977  antibiotic acetyltransferase  39.29 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2412  virginiamycin A acetyltransferase  40.7 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2233  Chloramphenicol O-acetyltransferase  39.04 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0104377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2647  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  41.21 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000095527 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2511  virginiamycin A acetyltransferase  39.7 
 
 
213 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.153817  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4157  Chloramphenicol O-acetyltransferase  38.78 
 
 
215 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4361  chloramphenicol O-acetyltransferase  38.78 
 
 
215 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1461  hexapaptide repeat-containing transferase  42.93 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3345  hexapaptide repeat-containing transferase  39.29 
 
 
209 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.972352  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1569  hexapaptide repeat-containing transferase  42.93 
 
 
218 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5872  streptogramin A acetyl transferase  40.4 
 
 
221 aa  137  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2656  acetyltransferase  39.7 
 
 
210 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15233  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2780  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.93 
 
 
218 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737809  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1600  hexapaptide repeat-containing transferase  42.41 
 
 
218 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000573546  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2692  streptogramin A acetyl transferase  42.57 
 
 
224 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1563  hexapaptide repeat-containing transferase  42.93 
 
 
218 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4229  chloramphenicol O-acetyltransferase  38.27 
 
 
215 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1763  streptogramin A acetyl transferase  43.39 
 
 
225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2593  streptogramin A acetyl transferase  42.08 
 
 
224 aa  134  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0046  hypothetical protein  37.06 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0048  hypothetical protein  36.55 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3304  acetyltransferase  41.72 
 
 
185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3254  acetyltransferase  41.72 
 
 
185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00705468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3339  acetyltransferase  41.72 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00224861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3600  acetyltransferase  41.72 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000293004  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1678  hypothetical protein  37.63 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  41.72 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2866  streptogramin A acetyl transferase  49.25 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.72072  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3563  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  41.06 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000342506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1664  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  41.06 
 
 
185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000881874  hitchhiker  1.93873e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3559  acetyltransferase  41.72 
 
 
185 aa  128  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00169424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3248  chloramphenicol acetyltransferase  40.4 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1147  acetyltransferase  41.89 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0377  hexapaptide repeat-containing transferase  39.49 
 
 
212 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208373  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2526  streptogramin A acetyl transferase  47.3 
 
 
167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1331  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  40.25 
 
 
195 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.956774  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1978  hexapaptide repeat-containing transferase  38.14 
 
 
221 aa  123  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.811569  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2320  chloramphenicol O-acetyltransferase  37.24 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1883  hypothetical protein  38.95 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2536  hypothetical protein  38.95 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4504  streptogramin A acetyl transferase  38.02 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3259  putative acetyltransferase  34.55 
 
 
206 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  42.47 
 
 
219 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1155  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.41 
 
 
219 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0378081  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4496  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  37.42 
 
 
212 aa  111  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4804  acetyltransferase  41.06 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4944  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  38.89 
 
 
174 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2701  streptogramin A acetyltransferase  37.91 
 
 
217 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97222  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0913  chloramphenicol acetyltransferase  43.07 
 
 
212 aa  108  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1706  putative acetyltransferase  33.86 
 
 
214 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558833  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2756  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  43.28 
 
 
220 aa  108  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.801902  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0591  acetyltransferase  44 
 
 
218 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0346  putative acetyltransferase  33.33 
 
 
214 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.735095 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0332  putative acetyltransferase  33.33 
 
 
214 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2823  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.46 
 
 
217 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.469559  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2927  streptogramin A acetyltransferase  37.91 
 
 
217 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0933  hexapeptide repeat-containing transferase  41.45 
 
 
209 aa  106  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.201434  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3901  hexapaptide repeat-containing transferase  42.86 
 
 
196 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0602656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>