More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4299 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4299  chloramphenicol acetyltransferase  100 
 
 
210 aa  441  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2950  chloramphenicol O-acetyltransferase  86.12 
 
 
210 aa  362  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359614  normal  0.149612 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1181  antibiotic acetyltransferase  72.28 
 
 
240 aa  327  8e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0246811  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1388  hexapaptide repeat-containing transferase  76.44 
 
 
211 aa  323  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220754  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1998  chloramphenicol acetyltransferase  71.22 
 
 
213 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.427174  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1536  putative chloramphenicol acetyltransferase  68.75 
 
 
208 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000290239  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2793  putative chloramphenicol acetyltransferase  67.96 
 
 
210 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3561  hexapaptide repeat-containing transferase  63.94 
 
 
211 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.367656  normal  0.425944 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0116  hexapaptide repeat-containing transferase  69.27 
 
 
211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278258  hitchhiker  0.00730231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55170  chloramphenicol acetyltransferase  76.27 
 
 
177 aa  269  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000006331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1494  chloramphenicol O-acetyltransferase  63.55 
 
 
218 aa  265  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00845499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2289  hexapaptide repeat-containing transferase  55.61 
 
 
216 aa  239  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000997  acetyltransferase  53.95 
 
 
219 aa  234  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07054  acetyltransferase  52.94 
 
 
217 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0600  hexapaptide repeat-containing transferase  52.53 
 
 
226 aa  227  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.152008  normal  0.590208 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  50.24 
 
 
226 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.476323  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0223  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 
226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4802  chloramphenicol acetyltransferase  63.19 
 
 
294 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0665  hexapaptide repeat-containing transferase  47.17 
 
 
226 aa  207  7e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4048  acetyltransferase  47.09 
 
 
209 aa  177  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.638 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3169  streptogramin A acetyl transferase  44.61 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.210498  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5557  hexapaptide repeat-containing transferase  47.62 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102322 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0704  chloramphenicol O-acetyltransferase  46.91 
 
 
211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.191265  normal  0.790707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2073  VatB  42.93 
 
 
211 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0183643  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2049  VatB  42.44 
 
 
211 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  45.71 
 
 
219 aa  168  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2973  streptogramin A acetyl transferase  42.72 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0391  streptogramin A acetyl transferase  45 
 
 
216 aa  164  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  44.71 
 
 
219 aa  164  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2303  hexapaptide repeat-containing transferase  45.02 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0994  acetyltransferase  42.05 
 
 
210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1384  streptogramin A acetyl transferase  46 
 
 
226 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0253879 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04620  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  43.15 
 
 
218 aa  157  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  43.07 
 
 
210 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2692  streptogramin A acetyl transferase  43.69 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2233  Chloramphenicol O-acetyltransferase  42.78 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0104377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2671  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  42.08 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0117743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2450  acetyltransferase  42.19 
 
 
210 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.602654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2629  acetyltransferase  42.19 
 
 
210 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3345  hexapaptide repeat-containing transferase  40.89 
 
 
209 aa  152  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.972352  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000461  antibiotic acetyltransferase  41.21 
 
 
214 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1763  streptogramin A acetyl transferase  43.69 
 
 
225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2375  virginiamycin A acetyltransferase  42.08 
 
 
210 aa  151  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.462397  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2593  streptogramin A acetyl transferase  42.72 
 
 
224 aa  151  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2780  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.46 
 
 
218 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737809  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1569  hexapaptide repeat-containing transferase  41.46 
 
 
218 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2698  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  41.15 
 
 
209 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.832761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1600  hexapaptide repeat-containing transferase  40.98 
 
 
218 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000573546  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2647  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  41.67 
 
 
210 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000095527 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2511  virginiamycin A acetyltransferase  40.1 
 
 
213 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.153817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0155  hexapaptide repeat-containing transferase  43.35 
 
 
212 aa  148  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1461  hexapaptide repeat-containing transferase  41.46 
 
 
218 aa  148  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1563  hexapaptide repeat-containing transferase  41.46 
 
 
218 aa  147  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2412  virginiamycin A acetyltransferase  41.09 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2656  acetyltransferase  40 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15233  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0046  hypothetical protein  37.37 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2526  streptogramin A acetyl transferase  47.68 
 
 
167 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1978  hexapaptide repeat-containing transferase  41 
 
 
221 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.811569  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0977  antibiotic acetyltransferase  38.31 
 
 
232 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1883  hypothetical protein  39.7 
 
 
213 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0322  antibiotic acetyltransferase  39.8 
 
 
215 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.799706 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1678  hypothetical protein  38.86 
 
 
211 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3559  acetyltransferase  48.3 
 
 
185 aa  142  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00169424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2536  hypothetical protein  40.41 
 
 
212 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0048  hypothetical protein  36.87 
 
 
220 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2866  streptogramin A acetyl transferase  42.11 
 
 
218 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.72072  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0377  hexapaptide repeat-containing transferase  41.45 
 
 
212 aa  141  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3248  chloramphenicol acetyltransferase  46.26 
 
 
185 aa  141  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5872  streptogramin A acetyl transferase  38.19 
 
 
221 aa  141  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3304  acetyltransferase  46.94 
 
 
185 aa  141  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3254  acetyltransferase  46.94 
 
 
185 aa  141  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00705468  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1331  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  44.37 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.956774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1664  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  47.92 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000881874  hitchhiker  1.93873e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4504  streptogramin A acetyl transferase  40.74 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  47.62 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4361  chloramphenicol O-acetyltransferase  38.42 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4157  Chloramphenicol O-acetyltransferase  38.42 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2701  streptogramin A acetyltransferase  42.54 
 
 
217 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97222  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3339  acetyltransferase  46.26 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00224861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3600  acetyltransferase  46.26 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000293004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3563  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  46.26 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000342506  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4229  chloramphenicol O-acetyltransferase  38.42 
 
 
215 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2823  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.44 
 
 
217 aa  135  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.469559  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1147  acetyltransferase  36.04 
 
 
213 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2927  streptogramin A acetyltransferase  41.44 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1155  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.59 
 
 
219 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0378081  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3259  putative acetyltransferase  46 
 
 
206 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2320  chloramphenicol O-acetyltransferase  41.49 
 
 
213 aa  131  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04310  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  38.83 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1706  putative acetyltransferase  35.75 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4804  acetyltransferase  42.68 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0332  putative acetyltransferase  35.23 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0346  putative acetyltransferase  35.23 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.735095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0635  transferase hexapeptide protein  41.97 
 
 
214 aa  125  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4496  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  35.29 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  42.36 
 
 
219 aa  117  9e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1415  antibiotic acetyltransferase  42.38 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.241418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4944  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  42.96 
 
 
174 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0749  chloramphenicol acetyltransferase  41.67 
 
 
208 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.408816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0499  chloramphenicol acetyltransferase  44.22 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0495191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>