More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2320 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2320  chloramphenicol O-acetyltransferase  100 
 
 
213 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1706  putative acetyltransferase  56.04 
 
 
214 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558833  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0332  putative acetyltransferase  55.56 
 
 
214 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0346  putative acetyltransferase  55.56 
 
 
214 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.735095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0738  hexapaptide repeat-containing transferase  58.82 
 
 
217 aa  217  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12843  normal  0.0447634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0704  chloramphenicol O-acetyltransferase  45.83 
 
 
211 aa  181  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.191265  normal  0.790707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2049  VatB  41.71 
 
 
211 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2073  VatB  41.71 
 
 
211 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0183643  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3169  streptogramin A acetyl transferase  44.86 
 
 
213 aa  171  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.210498  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0377  hexapaptide repeat-containing transferase  42.79 
 
 
212 aa  170  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208373  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4048  acetyltransferase  46.6 
 
 
209 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0391  streptogramin A acetyl transferase  43.19 
 
 
216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2536  hypothetical protein  43.19 
 
 
212 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5872  streptogramin A acetyl transferase  39.73 
 
 
221 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1461  hexapaptide repeat-containing transferase  42.38 
 
 
218 aa  159  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0155  hexapaptide repeat-containing transferase  42.06 
 
 
212 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4504  streptogramin A acetyl transferase  42.72 
 
 
216 aa  158  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1600  hexapaptide repeat-containing transferase  41.59 
 
 
218 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000573546  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1883  hypothetical protein  41.78 
 
 
213 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04620  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  42.93 
 
 
218 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1763  streptogramin A acetyl transferase  43.19 
 
 
225 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1569  hexapaptide repeat-containing transferase  41.59 
 
 
218 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2780  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.01 
 
 
218 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737809  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1384  streptogramin A acetyl transferase  44.1 
 
 
226 aa  155  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0253879 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2973  streptogramin A acetyl transferase  43.52 
 
 
217 aa  155  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1563  hexapaptide repeat-containing transferase  41.43 
 
 
218 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2692  streptogramin A acetyl transferase  43.66 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2593  streptogramin A acetyl transferase  42.72 
 
 
224 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2233  Chloramphenicol O-acetyltransferase  36.62 
 
 
213 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0104377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  41.2 
 
 
210 aa  148  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0994  acetyltransferase  40.87 
 
 
210 aa  148  8e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2671  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  38.89 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0117743 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1978  hexapaptide repeat-containing transferase  40.53 
 
 
221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.811569  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1678  hypothetical protein  39.79 
 
 
211 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2698  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  40.47 
 
 
209 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.832761  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2701  streptogramin A acetyltransferase  40.93 
 
 
217 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97222  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2450  acetyltransferase  39.91 
 
 
210 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.602654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2629  acetyltransferase  39.91 
 
 
210 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2866  streptogramin A acetyl transferase  39.81 
 
 
218 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.72072  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2511  virginiamycin A acetyltransferase  38.43 
 
 
213 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.153817  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3561  hexapaptide repeat-containing transferase  43.81 
 
 
211 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.367656  normal  0.425944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2927  streptogramin A acetyltransferase  40.47 
 
 
217 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2656  acetyltransferase  39.53 
 
 
210 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15233  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0635  transferase hexapeptide protein  44.44 
 
 
214 aa  142  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2412  virginiamycin A acetyltransferase  40.47 
 
 
210 aa  141  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2375  virginiamycin A acetyltransferase  40.47 
 
 
210 aa  141  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.462397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2647  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  39.45 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000095527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2823  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.59 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.469559  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0223  hexapaptide repeat-containing transferase  35.12 
 
 
226 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2526  streptogramin A acetyl transferase  45.62 
 
 
167 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2289  hexapaptide repeat-containing transferase  37.88 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1155  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.16 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0378081  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04310  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  40.19 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3559  acetyltransferase  41.57 
 
 
185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00169424  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0600  hexapaptide repeat-containing transferase  34.48 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.152008  normal  0.590208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  42.7 
 
 
185 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07054  acetyltransferase  37.81 
 
 
217 aa  131  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1664  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  42.7 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000881874  hitchhiker  1.93873e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3248  chloramphenicol acetyltransferase  40.45 
 
 
185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3304  acetyltransferase  39.89 
 
 
185 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3254  acetyltransferase  39.89 
 
 
185 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00705468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3563  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  40.45 
 
 
185 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000342506  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000997  acetyltransferase  37.63 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  33.17 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.476323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3339  acetyltransferase  39.33 
 
 
185 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00224861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3600  acetyltransferase  39.33 
 
 
185 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000293004  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0116  hexapaptide repeat-containing transferase  43.52 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278258  hitchhiker  0.00730231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1536  putative chloramphenicol acetyltransferase  37.19 
 
 
208 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000290239  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3259  putative acetyltransferase  40.8 
 
 
206 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0665  hexapaptide repeat-containing transferase  33.66 
 
 
226 aa  123  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4299  chloramphenicol acetyltransferase  41.49 
 
 
210 aa  122  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1181  antibiotic acetyltransferase  38.54 
 
 
240 aa  121  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0246811  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2793  putative chloramphenicol acetyltransferase  37.24 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1998  chloramphenicol acetyltransferase  36.55 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.427174  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2950  chloramphenicol O-acetyltransferase  39.7 
 
 
210 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359614  normal  0.149612 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1388  hexapaptide repeat-containing transferase  42.02 
 
 
211 aa  117  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1494  chloramphenicol O-acetyltransferase  41.1 
 
 
218 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00845499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4496  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  42.76 
 
 
212 aa  114  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5557  hexapaptide repeat-containing transferase  38.51 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  35.56 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  35.56 
 
 
219 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  41.22 
 
 
219 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2303  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
219 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3345  hexapaptide repeat-containing transferase  36 
 
 
209 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.972352  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0420  putative acetyltransferase  37.95 
 
 
241 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.857208  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1991  antibiotic acetyltransferase  33.18 
 
 
207 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1415  antibiotic acetyltransferase  41.1 
 
 
229 aa  102  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.241418  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0913  chloramphenicol acetyltransferase  35.12 
 
 
212 aa  102  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1331  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  36.91 
 
 
195 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.956774  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4157  Chloramphenicol O-acetyltransferase  35.38 
 
 
215 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1762  hexapaptide repeat-containing transferase  38.62 
 
 
210 aa  101  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4361  chloramphenicol O-acetyltransferase  35.38 
 
 
215 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0799  putative acetyltransferase  52.22 
 
 
105 aa  101  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000461  antibiotic acetyltransferase  33.95 
 
 
214 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4229  chloramphenicol O-acetyltransferase  35.38 
 
 
215 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55170  chloramphenicol acetyltransferase  42.51 
 
 
177 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000006331 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0933  hexapeptide repeat-containing transferase  43.28 
 
 
209 aa  98.2  9e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.201434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1147  acetyltransferase  36.62 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0769  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  37.5 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4944  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  34.91 
 
 
174 aa  94.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>