More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2973 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2973  streptogramin A acetyl transferase  100 
 
 		 217 aa  447  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0391  streptogramin A acetyl transferase  73.91 
 
 		 216 aa  340  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3169  streptogramin A acetyl transferase  71.56 
 
 		 213 aa  339  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.210498  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1384  streptogramin A acetyl transferase  69.71 
 
 		 226 aa  323  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0253879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0155  hexapaptide repeat-containing transferase  66.98 
 
 		 212 aa  309  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1563  hexapaptide repeat-containing transferase  68.6 
 
 		 218 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0994  acetyltransferase  68.93 
 
 		 210 aa  307  6.999999999999999e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2780  transferase hexapeptide repeat containing protein  68.12 
 
 		 218 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737809  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1461  hexapaptide repeat-containing transferase  66.19 
 
 		 218 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2692  streptogramin A acetyl transferase  68.63 
 
 		 224 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1569  hexapaptide repeat-containing transferase  67.63 
 
 		 218 aa  304  6e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1600  hexapaptide repeat-containing transferase  67.63 
 
 		 218 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000573546  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1763  streptogramin A acetyl transferase  67.16 
 
 		 225 aa  300  9e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2593  streptogramin A acetyl transferase  66.67 
 
 		 224 aa  299  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0704  chloramphenicol O-acetyltransferase  65.69 
 
 		 211 aa  296  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.191265  normal  0.790707 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  60.77 
 
 		 210 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1678  hypothetical protein  56.59 
 
 		 211 aa  266  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2233  Chloramphenicol O-acetyltransferase  55.83 
 
 		 213 aa  262  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0104377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2671  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  59.81 
 
 		 210 aa  262  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0117743 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4048  acetyltransferase  62.02 
 
 		 209 aa  261  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0377  hexapaptide repeat-containing transferase  56.87 
 
 		 212 aa  260  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2511  virginiamycin A acetyltransferase  59.62 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.153817  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2073  VatB  57.89 
 
 		 211 aa  258  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0183643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2656  acetyltransferase  60.29 
 
 		 210 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2450  acetyltransferase  58.85 
 
 		 210 aa  258  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.602654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2629  acetyltransferase  58.85 
 
 		 210 aa  258  6e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2049  VatB  57.42 
 
 		 211 aa  257  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2375  virginiamycin A acetyltransferase  58.85 
 
 		 210 aa  257  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.462397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2698  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  59.62 
 
 		 209 aa  257  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.832761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2412  virginiamycin A acetyltransferase  58.85 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2647  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  58.37 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000095527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2526  streptogramin A acetyl transferase  70.51 
 
 		 167 aa  240  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2927  streptogramin A acetyltransferase  55.45 
 
 		 217 aa  237  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2701  streptogramin A acetyltransferase  54.98 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97222  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2823  transferase hexapeptide repeat containing protein  54.03 
 
 		 217 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.469559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2536  hypothetical protein  51.46 
 
 		 212 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4504  streptogramin A acetyl transferase  52.91 
 
 		 216 aa  221  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1883  hypothetical protein  51.94 
 
 		 213 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5872  streptogramin A acetyl transferase  52.2 
 
 		 221 aa  214  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04310  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  50 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04620  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  50.47 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0635  transferase hexapeptide protein  51.17 
 
 		 214 aa  192  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2866  streptogramin A acetyl transferase  51.17 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.72072  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1978  hexapaptide repeat-containing transferase  45.64 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.811569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0600  hexapaptide repeat-containing transferase  43.2 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.152008  normal  0.590208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1706  putative acetyltransferase  44.27 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558833  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0346  putative acetyltransferase  43.75 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.735095 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0332  putative acetyltransferase  43.75 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0223  hexapaptide repeat-containing transferase  41.94 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0665  hexapaptide repeat-containing transferase  41.71 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  41.01 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.476323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4299  chloramphenicol acetyltransferase  42.72 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07054  acetyltransferase  43.4 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1536  putative chloramphenicol acetyltransferase  41.75 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000290239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2320  chloramphenicol O-acetyltransferase  43.52 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1181  antibiotic acetyltransferase  40.58 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0246811  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2289  hexapaptide repeat-containing transferase  41.06 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3561  hexapaptide repeat-containing transferase  44.74 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.367656  normal  0.425944 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000997  acetyltransferase  39.23 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1388  hexapaptide repeat-containing transferase  45.79 
 
 		 211 aa  151  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220754  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1998  chloramphenicol acetyltransferase  42.23 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.427174  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2950  chloramphenicol O-acetyltransferase  41.67 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359614  normal  0.149612 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2793  putative chloramphenicol acetyltransferase  42.33 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1494  chloramphenicol O-acetyltransferase  40.2 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00845499  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0116  hexapaptide repeat-containing transferase  42.78 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278258  hitchhiker  0.00730231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3559  acetyltransferase  43.35 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00169424  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0738  hexapaptide repeat-containing transferase  41.52 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12843  normal  0.0447634 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3304  acetyltransferase  43.68 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3254  acetyltransferase  43.68 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00705468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1664  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  46.58 
 
 		 185 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000881874  hitchhiker  1.93873e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3339  acetyltransferase  43.68 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00224861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  43.35 
 
 		 185 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3600  acetyltransferase  43.68 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000293004  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5557  hexapaptide repeat-containing transferase  38.14 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  37.39 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  38.6 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3248  chloramphenicol acetyltransferase  44.72 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3563  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  45.34 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000342506  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0799  putative acetyltransferase  63.33 
 
 		 105 aa  125  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2303  hexapaptide repeat-containing transferase  38.57 
 
 		 219 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000461  antibiotic acetyltransferase  37.38 
 
 		 214 aa  124  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0322  antibiotic acetyltransferase  39.81 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.799706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55170  chloramphenicol acetyltransferase  45.73 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000006331 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1155  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.32 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0378081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4157  Chloramphenicol O-acetyltransferase  35.29 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4361  chloramphenicol O-acetyltransferase  35.29 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  47.1 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4229  chloramphenicol O-acetyltransferase  35.29 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4496  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  39.47 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0977  antibiotic acetyltransferase  36.41 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1331  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  38.78 
 
 		 195 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.956774  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3259  putative acetyltransferase  37.09 
 
 		 206 aa  111  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3345  hexapaptide repeat-containing transferase  37 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.972352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0072  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  38.22 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1415  antibiotic acetyltransferase  37.82 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.241418  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3819  putative acetyltransferase (virginiamycin, streptogramin A, chloramphenicol)  42.65 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0731893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0499  chloramphenicol acetyltransferase  41.67 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0495191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3571  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  37.77 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.414497  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0046  hypothetical protein  33.65 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1147  acetyltransferase  37.86 
 
 		 213 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.789995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>