154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2568 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2568  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 
713 aa  1486    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0261  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  84.83 
 
 
713 aa  1275    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2089  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  38.3 
 
 
680 aa  477  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.266887  hitchhiker  0.000000000290962 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1343  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.63 
 
 
609 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.462457  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2279  putative oxidoreductase  37.92 
 
 
700 aa  137  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000813402  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0187  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  24.86 
 
 
591 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1842  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.84 
 
 
618 aa  134  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344973  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1677  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.79 
 
 
607 aa  131  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0474  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.88 
 
 
602 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3106  putative oxidoreductase  38.14 
 
 
707 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3096  putative oxidoreductase  37.71 
 
 
707 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3249  putative oxidoreductase  37.71 
 
 
707 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0381  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.2 
 
 
604 aa  128  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1380  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.07 
 
 
599 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1540  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.99 
 
 
604 aa  126  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0417829  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2922  putative oxidoreductase  32.08 
 
 
709 aa  126  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1080  putative oxidoreductase  33.61 
 
 
703 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2319  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  24.44 
 
 
626 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1189  putative oxidoreductase  37.08 
 
 
707 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0910  aldehyde:ferredoxin oxidoreductase, tungsten-containing  33.06 
 
 
601 aa  124  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2007  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.16 
 
 
593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0286  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
700 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0553353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1703  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.4 
 
 
597 aa  120  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0710  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.68 
 
 
621 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000031287  unclonable  8.45227e-17 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1563  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  35.02 
 
 
594 aa  119  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.303039  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24640  phenylacetaldehyde:ferredoxin oxidoreductase  32.06 
 
 
603 aa  119  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0722  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  24.03 
 
 
599 aa  117  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000472604  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1835  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.05 
 
 
629 aa  117  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2514  aldehyde:ferredoxin oxidoreductase  25.58 
 
 
628 aa  117  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0049  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.07 
 
 
615 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0868561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01642  predicted oxidoreductase  30.83 
 
 
700 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123895  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1969  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.83 
 
 
700 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00220787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1888  putative oxidoreductase  30.83 
 
 
700 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000343114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01632  hypothetical protein  30.83 
 
 
700 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1754  putative oxidoreductase  30.83 
 
 
700 aa  114  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1958  putative oxidoreductase  30.83 
 
 
700 aa  114  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.270117  hitchhiker  0.000000369258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1524  putative oxidoreductase  30.83 
 
 
700 aa  114  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.125886  hitchhiker  0.00000188505 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2386  putative oxidoreductase  30.83 
 
 
700 aa  114  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228992  hitchhiker  0.000270058 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1370  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.65 
 
 
643 aa  114  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2850  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.63 
 
 
617 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0904  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.33 
 
 
579 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12132e-32 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2581  phenylacetaldehyde:ferredoxin oxidoreductase  26.17 
 
 
615 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0077  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.16 
 
 
630 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.452416 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0687  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.14 
 
 
643 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0339  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  35.46 
 
 
599 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.180177  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02060  putative oxidoreductase  33.61 
 
 
705 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2055  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.24 
 
 
617 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000225152  hitchhiker  0.000000524906 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2323  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.46 
 
 
647 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0312  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.07 
 
 
600 aa  112  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2661  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.19 
 
 
642 aa  111  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1413  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.53 
 
 
625 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.814767  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3341  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.06 
 
 
579 aa  111  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0204  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.99 
 
 
589 aa  110  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3944  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.68 
 
 
615 aa  110  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0304  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.07 
 
 
600 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4718  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.2 
 
 
647 aa  109  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2287  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.2 
 
 
609 aa  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2001  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.29 
 
 
587 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2150  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.33 
 
 
619 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.812832  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2811  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.61 
 
 
615 aa  108  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00127659  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3293  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.14 
 
 
615 aa  108  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1830  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  22.86 
 
 
631 aa  108  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.003873  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0738  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.12 
 
 
614 aa  106  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0338  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.1 
 
 
620 aa  106  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.124472  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1817  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.72 
 
 
615 aa  106  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00038384 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2289  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.82 
 
 
584 aa  105  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0449918  normal  0.0613428 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0176  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.45 
 
 
618 aa  104  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.3724  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0094  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.84 
 
 
614 aa  103  8e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0664  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.56 
 
 
640 aa  103  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2810  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.35 
 
 
673 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1444  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.35 
 
 
672 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.271742  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2092  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.07 
 
 
600 aa  102  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0260  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.44 
 
 
593 aa  101  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000103902 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1164  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.28 
 
 
635 aa  101  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.19471  decreased coverage  0.00826779 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5245  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.15 
 
 
678 aa  101  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.747579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2087  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.25 
 
 
653 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000659758  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0821  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.9 
 
 
586 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000602903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0154  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.13 
 
 
631 aa  99.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04450  aldehyde:ferredoxin oxidoreductase  28.68 
 
 
622 aa  99  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000642234 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1310  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.86 
 
 
612 aa  98.6  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.859975  normal  0.338059 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1880  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.36 
 
 
608 aa  98.2  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1112  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.45 
 
 
584 aa  97.8  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0252855  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1809  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.05 
 
 
614 aa  97.8  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.908794 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1040  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.46 
 
 
608 aa  96.7  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000164152 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2285  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.82 
 
 
615 aa  96.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.394139 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1137  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.24 
 
 
615 aa  96.7  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.554063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1927  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.08 
 
 
627 aa  96.7  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.856284  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1802  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.09 
 
 
656 aa  95.5  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000540653  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2056  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.94 
 
 
600 aa  95.1  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1115  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.77 
 
 
561 aa  94.7  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000328009  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0812  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.59 
 
 
617 aa  94.4  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.160166  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2057  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.43 
 
 
637 aa  94  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0005  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.51 
 
 
607 aa  90.1  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0970  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.53 
 
 
634 aa  89  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.450094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3269  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.55 
 
 
579 aa  88.2  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1609  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.16 
 
 
656 aa  87.4  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2620  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.16 
 
 
656 aa  87  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418358  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2191  aldehyde ferredoxin oxidoreductase, tungsten-containing  29.01 
 
 
579 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3867  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.05 
 
 
619 aa  85.5  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1863  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.26 
 
 
609 aa  85.1  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.678571 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>