173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3341 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2191  aldehyde ferredoxin oxidoreductase, tungsten-containing  75.82 
 
 
579 aa  894    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2289  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  77.03 
 
 
584 aa  913    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0449918  normal  0.0613428 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0904  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  93.26 
 
 
579 aa  1104    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12132e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3269  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  79.62 
 
 
579 aa  929    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3341  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 
579 aa  1174    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1115  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  43.89 
 
 
561 aa  442  1e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000328009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2231  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  42.55 
 
 
520 aa  428  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0549785  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0187  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  39.5 
 
 
591 aa  397  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1380  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  39.34 
 
 
599 aa  395  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1703  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  40.8 
 
 
597 aa  385  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0696  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  39.36 
 
 
591 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.690146  normal  0.357053 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0176  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  38.7 
 
 
618 aa  374  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.3724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0910  aldehyde:ferredoxin oxidoreductase, tungsten-containing  39.83 
 
 
601 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0339  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  39.76 
 
 
599 aa  369  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.180177  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0474  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  39.6 
 
 
602 aa  369  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0722  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  39 
 
 
599 aa  362  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000472604  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1540  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  35.99 
 
 
604 aa  361  2e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0417829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1563  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  37.9 
 
 
594 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.303039  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1677  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  36.14 
 
 
607 aa  352  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2287  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  38.02 
 
 
609 aa  351  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2811  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  36.51 
 
 
615 aa  348  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00127659  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0381  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  36.08 
 
 
604 aa  347  3e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2581  phenylacetaldehyde:ferredoxin oxidoreductase  36.82 
 
 
615 aa  346  6e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1343  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  36.06 
 
 
609 aa  345  8.999999999999999e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.462457  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1817  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  36.45 
 
 
615 aa  341  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00038384 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0049  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  36.84 
 
 
615 aa  340  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0868561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3944  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  36.66 
 
 
615 aa  334  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1166  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  37.34 
 
 
609 aa  332  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00905159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2850  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  36.66 
 
 
617 aa  331  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1863  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  37.6 
 
 
609 aa  329  8e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.678571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3293  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  36.33 
 
 
615 aa  327  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984081  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24640  phenylacetaldehyde:ferredoxin oxidoreductase  36.87 
 
 
603 aa  325  1e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1297  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  35.66 
 
 
616 aa  318  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2055  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.77 
 
 
617 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000225152  hitchhiker  0.000000524906 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0664  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.74 
 
 
640 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1771  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  36.23 
 
 
621 aa  306  7e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.129091  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1370  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.52 
 
 
643 aa  306  9.000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2289  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  35.58 
 
 
619 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.119922  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1842  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.69 
 
 
618 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344973  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2007  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  36.13 
 
 
593 aa  300  6e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2661  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.73 
 
 
642 aa  295  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4718  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.85 
 
 
647 aa  291  3e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441968  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0710  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.3 
 
 
621 aa  288  2e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000031287  unclonable  8.45227e-17 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0970  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.49 
 
 
634 aa  280  7e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.450094 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0687  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.39 
 
 
643 aa  278  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1040  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.01 
 
 
608 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000164152 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1809  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.58 
 
 
614 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.908794 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2285  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.72 
 
 
615 aa  274  3e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.394139 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1310  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.23 
 
 
612 aa  273  6e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.859975  normal  0.338059 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0154  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.74 
 
 
631 aa  273  7e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1880  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.49 
 
 
608 aa  270  5e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3867  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.61 
 
 
619 aa  270  5.9999999999999995e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0204  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.23 
 
 
589 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0738  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.82 
 
 
614 aa  264  3e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2057  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.49 
 
 
637 aa  263  8.999999999999999e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0812  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.31 
 
 
617 aa  259  7e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.160166  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1927  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.1 
 
 
627 aa  258  2e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.856284  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2092  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.77 
 
 
600 aa  258  3e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2514  aldehyde:ferredoxin oxidoreductase  32.84 
 
 
628 aa  256  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230749  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0427  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.01 
 
 
626 aa  252  1e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0338  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.67 
 
 
620 aa  250  6e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.124472  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2118  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.41 
 
 
563 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4742  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.66 
 
 
589 aa  247  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0135962  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1050  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.48 
 
 
555 aa  246  6e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.849957  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0304  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.74 
 
 
600 aa  246  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0260  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.54 
 
 
593 aa  245  9.999999999999999e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000103902 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0312  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.41 
 
 
600 aa  243  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0387  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.18 
 
 
563 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2361  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.36 
 
 
614 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3833  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.35 
 
 
551 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2001  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.47 
 
 
587 aa  230  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0094  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.46 
 
 
614 aa  228  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2150  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.68 
 
 
619 aa  226  8e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.812832  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2319  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.19 
 
 
626 aa  226  8e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2300  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.86 
 
 
575 aa  225  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.189946  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0005  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.14 
 
 
607 aa  223  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0827  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.29 
 
 
577 aa  222  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00531828  hitchhiker  0.0000265151 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1830  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.03 
 
 
631 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.003873  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0217  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.73 
 
 
615 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0077  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.94 
 
 
630 aa  219  1e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.452416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2421  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.39 
 
 
576 aa  219  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4067  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.78 
 
 
543 aa  217  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1045  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.92 
 
 
576 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131266  hitchhiker  0.000000000976046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0456  tungsten containing aldehyde:ferredoxin oxidoreductase  32.57 
 
 
577 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00113433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1195  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.5 
 
 
576 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0279  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.64 
 
 
579 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0565  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.64 
 
 
564 aa  213  7e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.39692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0254  aldehyde:ferredoxin oxidoreductase  31.86 
 
 
576 aa  211  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1006  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.33 
 
 
575 aa  210  6e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000257551  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1877  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.78 
 
 
576 aa  210  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.615798  normal  0.94271 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1164  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.05 
 
 
635 aa  208  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.19471  decreased coverage  0.00826779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2460  aldehyde:ferredoxin oxidoreductase, tungsten-containing  32.15 
 
 
577 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264209  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1464  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.76 
 
 
628 aa  205  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0888  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.35 
 
 
576 aa  203  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3328  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.49 
 
 
573 aa  201  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.186112  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2970  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.32 
 
 
573 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1835  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.75 
 
 
629 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0715  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.93 
 
 
596 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0465  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.66 
 
 
576 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2933  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.54 
 
 
576 aa  194  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>