169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1444 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2620  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  65.54 
 
 
656 aa  909    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2810  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  98.37 
 
 
673 aa  1380    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1802  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  65.69 
 
 
656 aa  910    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000540653  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2087  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  90.91 
 
 
653 aa  1254    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000659758  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1609  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  65.38 
 
 
656 aa  907    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1444  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 
672 aa  1402    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.271742  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0154  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.44 
 
 
631 aa  239  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0710  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.31 
 
 
621 aa  237  4e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000031287  unclonable  8.45227e-17 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2319  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.07 
 
 
626 aa  226  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1880  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.38 
 
 
608 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0187  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  30.12 
 
 
591 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1830  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.85 
 
 
631 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.003873  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1835  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.91 
 
 
629 aa  219  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2287  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.86 
 
 
609 aa  216  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1540  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.65 
 
 
604 aa  216  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0417829  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1842  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.65 
 
 
618 aa  211  5e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344973  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1343  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.29 
 
 
609 aa  207  7e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.462457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2150  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.39 
 
 
619 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.812832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2056  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.8 
 
 
600 aa  204  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24640  phenylacetaldehyde:ferredoxin oxidoreductase  28.59 
 
 
603 aa  203  9e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1380  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.15 
 
 
599 aa  201  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1310  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.77 
 
 
612 aa  201  3e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.859975  normal  0.338059 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1677  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.85 
 
 
607 aa  200  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0474  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.93 
 
 
602 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0910  aldehyde:ferredoxin oxidoreductase, tungsten-containing  28.88 
 
 
601 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0722  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.87 
 
 
599 aa  196  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000472604  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1703  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.18 
 
 
597 aa  195  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0970  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.26 
 
 
634 aa  194  5e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.450094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2581  phenylacetaldehyde:ferredoxin oxidoreductase  28.46 
 
 
615 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1563  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.77 
 
 
594 aa  188  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.303039  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1817  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.81 
 
 
615 aa  187  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00038384 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2323  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.94 
 
 
647 aa  185  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2055  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.59 
 
 
617 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000225152  hitchhiker  0.000000524906 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0339  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.04 
 
 
599 aa  181  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.180177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2300  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.33 
 
 
575 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.189946  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0381  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.22 
 
 
604 aa  179  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2850  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27 
 
 
617 aa  179  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2514  aldehyde:ferredoxin oxidoreductase  25.52 
 
 
628 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230749  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3944  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.78 
 
 
615 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1040  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.65 
 
 
608 aa  174  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000164152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0049  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.87 
 
 
615 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0868561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2811  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.01 
 
 
615 aa  171  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00127659  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1809  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.19 
 
 
614 aa  170  7e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.908794 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3293  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.03 
 
 
615 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984081  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0312  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.18 
 
 
600 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0304  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.96 
 
 
600 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01642  predicted oxidoreductase  26.26 
 
 
700 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123895  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1969  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.26 
 
 
700 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00220787  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01632  hypothetical protein  26.26 
 
 
700 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128433  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1164  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.1 
 
 
635 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.19471  decreased coverage  0.00826779 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1754  putative oxidoreductase  26.26 
 
 
700 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1888  putative oxidoreductase  26.26 
 
 
700 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000343114  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1771  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.78 
 
 
621 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.129091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1958  putative oxidoreductase  26.26 
 
 
700 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.270117  hitchhiker  0.000000369258 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0427  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.17 
 
 
626 aa  165  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2386  putative oxidoreductase  26.21 
 
 
700 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228992  hitchhiker  0.000270058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1524  putative oxidoreductase  26.23 
 
 
700 aa  163  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.125886  hitchhiker  0.00000188505 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0812  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.99 
 
 
617 aa  163  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.160166  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0077  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.03 
 
 
630 aa  163  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.452416 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2922  putative oxidoreductase  25.85 
 
 
709 aa  160  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1413  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.15 
 
 
625 aa  158  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.814767  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2007  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.9 
 
 
593 aa  157  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0176  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.96 
 
 
618 aa  157  7e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.3724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0904  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.86 
 
 
579 aa  157  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12132e-32 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0664  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.79 
 
 
640 aa  157  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0286  putative oxidoreductase  23.83 
 
 
700 aa  156  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0553353  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0217  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.85 
 
 
615 aa  154  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2092  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.19 
 
 
600 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3341  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.96 
 
 
579 aa  154  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5245  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.04 
 
 
678 aa  153  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.747579 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2279  putative oxidoreductase  33.13 
 
 
700 aa  153  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000813402  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3590  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.16 
 
 
601 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0687  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.2 
 
 
643 aa  151  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4718  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.4 
 
 
647 aa  151  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1080  putative oxidoreductase  35.44 
 
 
703 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2001  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.92 
 
 
587 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1050  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.22 
 
 
555 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.849957  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2271  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.43 
 
 
596 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.012374 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0696  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.4 
 
 
591 aa  147  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.690146  normal  0.357053 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0094  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.13 
 
 
614 aa  147  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4359  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.01 
 
 
596 aa  147  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1370  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.65 
 
 
643 aa  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0338  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.09 
 
 
620 aa  145  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.124472  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0204  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.41 
 
 
589 aa  144  5e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2289  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.08 
 
 
619 aa  143  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.119922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3269  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.65 
 
 
579 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0738  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.57 
 
 
614 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1137  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.64 
 
 
615 aa  137  9e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.554063 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2661  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.96 
 
 
642 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2289  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.36 
 
 
584 aa  134  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0449918  normal  0.0613428 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1927  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.52 
 
 
627 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.856284  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0005  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.44 
 
 
607 aa  134  7.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3867  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.22 
 
 
619 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1166  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  24.43 
 
 
609 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00905159 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1115  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.29 
 
 
561 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000328009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04450  aldehyde:ferredoxin oxidoreductase  28.77 
 
 
622 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000642234 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1297  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.03 
 
 
616 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2191  aldehyde ferredoxin oxidoreductase, tungsten-containing  30.14 
 
 
579 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1189  putative oxidoreductase  25.17 
 
 
707 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3249  putative oxidoreductase  24.97 
 
 
707 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>