165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1524 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01642  predicted oxidoreductase  99.43 
 
 
700 aa  1460    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123895  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1969  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  99.43 
 
 
700 aa  1460    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00220787  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01632  hypothetical protein  99.43 
 
 
700 aa  1460    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128433  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1080  putative oxidoreductase  47.01 
 
 
703 aa  649    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02060  putative oxidoreductase  51.43 
 
 
705 aa  702    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0286  putative oxidoreductase  79.71 
 
 
700 aa  1212    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0553353  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2386  putative oxidoreductase  99.14 
 
 
700 aa  1456    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228992  hitchhiker  0.000270058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1754  putative oxidoreductase  99.14 
 
 
700 aa  1457    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1888  putative oxidoreductase  99.29 
 
 
700 aa  1459    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000343114  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2922  putative oxidoreductase  51.7 
 
 
709 aa  747    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1958  putative oxidoreductase  99.14 
 
 
700 aa  1457    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.270117  hitchhiker  0.000000369258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1524  putative oxidoreductase  100 
 
 
700 aa  1467    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.125886  hitchhiker  0.00000188505 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1873  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  98.54 
 
 
548 aa  1143    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00342521  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2279  putative oxidoreductase  52.85 
 
 
700 aa  739    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000813402  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3106  putative oxidoreductase  45.42 
 
 
707 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3249  putative oxidoreductase  45.42 
 
 
707 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3096  putative oxidoreductase  45.28 
 
 
707 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1189  putative oxidoreductase  45.28 
 
 
707 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1380  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.11 
 
 
599 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1703  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.63 
 
 
597 aa  200  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1880  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.09 
 
 
608 aa  192  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1040  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.74 
 
 
608 aa  190  7e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000164152 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1343  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.34 
 
 
609 aa  189  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.462457  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1540  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.84 
 
 
604 aa  188  3e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0417829  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0474  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  43.12 
 
 
602 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2089  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.47 
 
 
680 aa  178  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.266887  hitchhiker  0.000000000290962 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0970  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.78 
 
 
634 aa  177  5e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.450094 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1677  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.99 
 
 
607 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0812  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  42.29 
 
 
617 aa  173  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.160166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0910  aldehyde:ferredoxin oxidoreductase, tungsten-containing  42.33 
 
 
601 aa  171  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2087  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.59 
 
 
653 aa  171  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000659758  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0722  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  43.87 
 
 
599 aa  171  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000472604  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2810  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.18 
 
 
673 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2287  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.16 
 
 
609 aa  167  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0187  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  38.86 
 
 
591 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2319  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.36 
 
 
626 aa  164  7e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1444  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.23 
 
 
672 aa  163  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.271742  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0339  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.15 
 
 
599 aa  163  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.180177  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0338  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.66 
 
 
620 aa  162  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.124472  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1609  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.66 
 
 
656 aa  161  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2620  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.52 
 
 
656 aa  161  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418358  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1310  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  38.36 
 
 
612 aa  159  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.859975  normal  0.338059 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2581  phenylacetaldehyde:ferredoxin oxidoreductase  40.91 
 
 
615 aa  158  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1115  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  35.33 
 
 
561 aa  157  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000328009  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2811  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  41.43 
 
 
615 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00127659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24640  phenylacetaldehyde:ferredoxin oxidoreductase  34.77 
 
 
603 aa  155  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3944  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  41.31 
 
 
615 aa  155  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1842  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.54 
 
 
618 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344973  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2285  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.16 
 
 
615 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.394139 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0005  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  39.81 
 
 
607 aa  154  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0427  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.71 
 
 
626 aa  154  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2323  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.62 
 
 
647 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1830  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  36.11 
 
 
631 aa  154  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.003873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1802  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.63 
 
 
656 aa  153  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000540653  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3293  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  41.31 
 
 
615 aa  153  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0154  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.81 
 
 
631 aa  152  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2850  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  42.25 
 
 
617 aa  152  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0049  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  40.72 
 
 
615 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0868561 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2057  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.88 
 
 
637 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1817  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  38.46 
 
 
615 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00038384 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1927  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.01 
 
 
627 aa  148  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.856284  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0381  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  39.45 
 
 
604 aa  147  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1297  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  38.5 
 
 
616 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1164  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.21 
 
 
635 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.19471  decreased coverage  0.00826779 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2150  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  24.82 
 
 
619 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.812832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1835  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  36.36 
 
 
629 aa  140  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2055  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.65 
 
 
617 aa  139  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000225152  hitchhiker  0.000000524906 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1563  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  36.07 
 
 
594 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.303039  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0313  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  39.15 
 
 
427 aa  137  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0710  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.54 
 
 
621 aa  137  9e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000031287  unclonable  8.45227e-17 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04450  aldehyde:ferredoxin oxidoreductase  36.87 
 
 
622 aa  136  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000642234 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0738  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.92 
 
 
614 aa  135  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0176  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.71 
 
 
618 aa  134  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.3724  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0687  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.55 
 
 
643 aa  134  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0904  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.92 
 
 
579 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12132e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3341  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.28 
 
 
579 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2007  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30 
 
 
593 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0094  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.27 
 
 
614 aa  131  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0664  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.28 
 
 
640 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2661  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.01 
 
 
642 aa  130  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0312  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.93 
 
 
600 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2289  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.15 
 
 
584 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0449918  normal  0.0613428 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5245  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.43 
 
 
678 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.747579 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1809  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  24.88 
 
 
614 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.908794 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1370  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.04 
 
 
643 aa  128  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3269  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.71 
 
 
579 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0304  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.23 
 
 
600 aa  128  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2191  aldehyde ferredoxin oxidoreductase, tungsten-containing  32.62 
 
 
579 aa  126  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1137  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  37.74 
 
 
615 aa  123  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.554063 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3867  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  37.67 
 
 
619 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2514  aldehyde:ferredoxin oxidoreductase  34.82 
 
 
628 aa  120  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230749  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1863  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.74 
 
 
609 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.678571 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0696  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.32 
 
 
591 aa  118  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.690146  normal  0.357053 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4718  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  24.94 
 
 
647 aa  119  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441968  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2300  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.33 
 
 
575 aa  118  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.189946  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2092  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  37.44 
 
 
600 aa  117  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1817  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.53 
 
 
595 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.564866  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0077  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.48 
 
 
630 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.452416 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1166  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.84 
 
 
609 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00905159 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1006  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  35.44 
 
 
575 aa  111  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000257551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>