103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1873 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01642  predicted oxidoreductase  99.27 
 
 
700 aa  1150    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123895  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1969  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  99.27 
 
 
700 aa  1150    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00220787  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1754  putative oxidoreductase  99.64 
 
 
700 aa  1154    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1888  putative oxidoreductase  99.45 
 
 
700 aa  1152    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000343114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1958  putative oxidoreductase  99.64 
 
 
700 aa  1154    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.270117  hitchhiker  0.000000369258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1524  putative oxidoreductase  98.54 
 
 
700 aa  1143    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.125886  hitchhiker  0.00000188505 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1873  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 
548 aa  1154    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00342521  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2386  putative oxidoreductase  99.09 
 
 
700 aa  1146    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228992  hitchhiker  0.000270058 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0286  putative oxidoreductase  80.04 
 
 
700 aa  951    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0553353  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01632  hypothetical protein  99.27 
 
 
700 aa  1150    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2922  putative oxidoreductase  50.27 
 
 
709 aa  563  1.0000000000000001e-159  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2279  putative oxidoreductase  52.11 
 
 
700 aa  551  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000813402  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02060  putative oxidoreductase  51.74 
 
 
705 aa  545  1e-154  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1080  putative oxidoreductase  45.44 
 
 
703 aa  487  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1189  putative oxidoreductase  44.11 
 
 
707 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3106  putative oxidoreductase  43.83 
 
 
707 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3249  putative oxidoreductase  43.65 
 
 
707 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3096  putative oxidoreductase  43.47 
 
 
707 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2089  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  24.32 
 
 
680 aa  97.8  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.266887  hitchhiker  0.000000000290962 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1343  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  24.4 
 
 
609 aa  89  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.462457  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1703  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  24.73 
 
 
597 aa  87.4  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1380  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  22.74 
 
 
599 aa  84.3  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2055  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  24.54 
 
 
617 aa  82.8  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000225152  hitchhiker  0.000000524906 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2810  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  22.94 
 
 
673 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1880  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  24.68 
 
 
608 aa  76.6  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1040  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.01 
 
 
608 aa  74.7  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000164152 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2087  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  22.81 
 
 
653 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000659758  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1540  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.26 
 
 
604 aa  73.6  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0417829  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0338  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.23 
 
 
620 aa  73.6  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.124472  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2150  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.42 
 
 
619 aa  73.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.812832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1444  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  22.97 
 
 
672 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.271742  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0970  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.2 
 
 
634 aa  71.6  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.450094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1609  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.72 
 
 
656 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2620  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.55 
 
 
656 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418358  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2319  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  21.83 
 
 
626 aa  70.5  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0474  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  52.24 
 
 
602 aa  69.7  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2323  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.33 
 
 
647 aa  69.3  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2285  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.37 
 
 
615 aa  67  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.394139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1802  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  21.83 
 
 
656 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000540653  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5245  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.16 
 
 
678 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.747579 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1677  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  22.2 
 
 
607 aa  63.9  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2057  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.57 
 
 
637 aa  63.9  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0812  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  43.84 
 
 
617 aa  63.9  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.160166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0154  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.45 
 
 
631 aa  63.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0339  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  22.52 
 
 
599 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.180177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0722  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  54.1 
 
 
599 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000472604  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1842  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.19 
 
 
618 aa  59.7  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344973  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2581  phenylacetaldehyde:ferredoxin oxidoreductase  50.75 
 
 
615 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0910  aldehyde:ferredoxin oxidoreductase, tungsten-containing  55.56 
 
 
601 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2850  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  54.84 
 
 
617 aa  58.9  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3944  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  53.23 
 
 
615 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0312  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.56 
 
 
600 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3293  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  53.23 
 
 
615 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984081  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0427  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  21.39 
 
 
626 aa  58.9  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0304  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.56 
 
 
600 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1817  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  47.76 
 
 
615 aa  57.4  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00038384 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2287  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.12 
 
 
609 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0187  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  36.84 
 
 
591 aa  56.6  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1310  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  46.88 
 
 
612 aa  56.2  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.859975  normal  0.338059 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1115  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.75 
 
 
561 aa  56.6  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000328009  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2191  aldehyde ferredoxin oxidoreductase, tungsten-containing  33.15 
 
 
579 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1164  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.66 
 
 
635 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.19471  decreased coverage  0.00826779 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1413  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  20.9 
 
 
625 aa  55.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.814767  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0049  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  45.71 
 
 
615 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0868561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2007  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.57 
 
 
593 aa  55.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0176  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  39.44 
 
 
618 aa  53.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.3724  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2811  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  46.55 
 
 
615 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00127659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24640  phenylacetaldehyde:ferredoxin oxidoreductase  29.34 
 
 
603 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0738  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.91 
 
 
614 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2289  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.63 
 
 
584 aa  50.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0449918  normal  0.0613428 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0313  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  44.07 
 
 
427 aa  50.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2300  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.9 
 
 
575 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.189946  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1830  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  56 
 
 
631 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.003873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0904  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.49 
 
 
579 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12132e-32 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0696  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.11 
 
 
591 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.690146  normal  0.357053 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0077  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.56 
 
 
630 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.452416 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0381  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  48.33 
 
 
604 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3269  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.86 
 
 
579 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0005  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  55.56 
 
 
607 aa  48.5  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0710  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.64 
 
 
621 aa  48.5  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000031287  unclonable  8.45227e-17 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1809  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  42.42 
 
 
614 aa  48.9  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.908794 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3341  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.38 
 
 
579 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1835  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  45.16 
 
 
629 aa  47.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1927  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.55 
 
 
627 aa  47.8  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.856284  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1370  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.59 
 
 
643 aa  47.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0687  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.59 
 
 
643 aa  47.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1005  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  33.33 
 
 
589 aa  47.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.598156  normal  0.0187107 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0664  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.71 
 
 
640 aa  47.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1817  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.99 
 
 
595 aa  47  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.564866  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1563  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  22.55 
 
 
594 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.303039  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2361  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.3 
 
 
614 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2661  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.28 
 
 
642 aa  47  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0900  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.04 
 
 
578 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0094  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  38.33 
 
 
614 aa  45.8  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0261  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.47 
 
 
713 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1771  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  21.62 
 
 
621 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.129091  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1137  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.67 
 
 
615 aa  45.8  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.554063 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3867  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  41.27 
 
 
619 aa  46.2  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2056  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  20.77 
 
 
600 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0821  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  41.38 
 
 
586 aa  45.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000602903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>