169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2620 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2620  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 
656 aa  1375    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1802  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  91.01 
 
 
656 aa  1282    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000540653  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2087  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  64.98 
 
 
653 aa  905    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000659758  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2810  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  65.85 
 
 
673 aa  917    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1609  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  99.39 
 
 
656 aa  1369    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1444  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  65.54 
 
 
672 aa  909    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.271742  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0154  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  32.25 
 
 
631 aa  257  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1540  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.58 
 
 
604 aa  232  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0417829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2287  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.11 
 
 
609 aa  224  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0710  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.15 
 
 
621 aa  221  3e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000031287  unclonable  8.45227e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1703  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.83 
 
 
597 aa  219  8.999999999999998e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1380  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.57 
 
 
599 aa  219  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0474  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.51 
 
 
602 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0187  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  29.03 
 
 
591 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0910  aldehyde:ferredoxin oxidoreductase, tungsten-containing  29.36 
 
 
601 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0722  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.59 
 
 
599 aa  213  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000472604  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2319  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.56 
 
 
626 aa  206  9e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0049  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.08 
 
 
615 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0868561 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24640  phenylacetaldehyde:ferredoxin oxidoreductase  28.48 
 
 
603 aa  202  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1809  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.55 
 
 
614 aa  195  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.908794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2581  phenylacetaldehyde:ferredoxin oxidoreductase  26.73 
 
 
615 aa  190  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1677  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.84 
 
 
607 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3293  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.95 
 
 
615 aa  189  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984081  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2811  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.2 
 
 
615 aa  189  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00127659  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0381  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.62 
 
 
604 aa  188  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1842  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.38 
 
 
618 aa  188  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344973  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3944  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.5 
 
 
615 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1817  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.78 
 
 
615 aa  187  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00038384 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1343  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.67 
 
 
609 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.462457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2850  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.16 
 
 
617 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1563  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.47 
 
 
594 aa  185  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.303039  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1830  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.65 
 
 
631 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.003873  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1880  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.73 
 
 
608 aa  181  4e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2056  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.62 
 
 
600 aa  179  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1835  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.72 
 
 
629 aa  177  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0427  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.67 
 
 
626 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0339  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.48 
 
 
599 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.180177  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2092  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.4 
 
 
600 aa  173  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1040  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.99 
 
 
608 aa  168  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000164152 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0664  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.78 
 
 
640 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1310  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.2 
 
 
612 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.859975  normal  0.338059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2055  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.82 
 
 
617 aa  166  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000225152  hitchhiker  0.000000524906 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2514  aldehyde:ferredoxin oxidoreductase  25.35 
 
 
628 aa  163  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1524  putative oxidoreductase  26.52 
 
 
700 aa  161  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.125886  hitchhiker  0.00000188505 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0286  putative oxidoreductase  25.78 
 
 
700 aa  160  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0553353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2323  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.28 
 
 
647 aa  160  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1115  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.16 
 
 
561 aa  160  8e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000328009  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01642  predicted oxidoreductase  26.42 
 
 
700 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123895  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1969  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.42 
 
 
700 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00220787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1888  putative oxidoreductase  26.39 
 
 
700 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000343114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01632  hypothetical protein  26.42 
 
 
700 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128433  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0176  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.76 
 
 
618 aa  159  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.3724  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2150  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  30.93 
 
 
619 aa  159  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.812832  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1164  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.96 
 
 
635 aa  158  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.19471  decreased coverage  0.00826779 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1754  putative oxidoreductase  26.39 
 
 
700 aa  159  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866876  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0338  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.33 
 
 
620 aa  158  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.124472  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1958  putative oxidoreductase  26.39 
 
 
700 aa  159  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.270117  hitchhiker  0.000000369258 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0687  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.76 
 
 
643 aa  158  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2279  putative oxidoreductase  26.87 
 
 
700 aa  157  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000813402  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2386  putative oxidoreductase  26.25 
 
 
700 aa  156  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228992  hitchhiker  0.000270058 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0970  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.58 
 
 
634 aa  156  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.450094 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1413  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.74 
 
 
625 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.814767  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0077  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.02 
 
 
630 aa  155  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.452416 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0738  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.25 
 
 
614 aa  154  5e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0204  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.38 
 
 
589 aa  154  5e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1927  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.01 
 
 
627 aa  153  8e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.856284  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1080  putative oxidoreductase  44.5 
 
 
703 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04450  aldehyde:ferredoxin oxidoreductase  26.38 
 
 
622 aa  151  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000642234 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2661  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.09 
 
 
642 aa  150  8e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1297  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.32 
 
 
616 aa  148  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4718  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.87 
 
 
647 aa  147  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441968  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1370  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.07 
 
 
643 aa  146  9e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0312  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.46 
 
 
600 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0304  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  27.23 
 
 
600 aa  144  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5245  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  24.16 
 
 
678 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.747579 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0812  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.71 
 
 
617 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.160166  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0696  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.79 
 
 
591 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.690146  normal  0.357053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2001  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  24.4 
 
 
587 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1166  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  24.58 
 
 
609 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00905159 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1137  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.39 
 
 
615 aa  137  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.554063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1863  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.3 
 
 
609 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.678571 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0260  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.31 
 
 
593 aa  134  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000103902 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2922  putative oxidoreductase  35.96 
 
 
709 aa  133  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3341  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.07 
 
 
579 aa  133  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0094  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  29.38 
 
 
614 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2057  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.42 
 
 
637 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1771  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.38 
 
 
621 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.129091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3590  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.92 
 
 
601 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0904  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.89 
 
 
579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12132e-32 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2285  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.79 
 
 
615 aa  126  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.394139 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2007  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  28.05 
 
 
593 aa  123  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1189  putative oxidoreductase  24.26 
 
 
707 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4359  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.27 
 
 
596 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2271  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  23.86 
 
 
596 aa  120  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.012374 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0005  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  34.8 
 
 
607 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0900  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  26.64 
 
 
578 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4742  Aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.11 
 
 
589 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0135962  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1050  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  24.13 
 
 
555 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.849957  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2289  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  25.54 
 
 
619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.119922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2289  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  31.75 
 
 
584 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0449918  normal  0.0613428 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>