81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5568 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5568  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7344  hypothetical protein  39.71 
 
 
210 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114903  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1535  hypothetical protein  47.01 
 
 
140 aa  95.9  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00830  hypothetical protein  45.91 
 
 
157 aa  84.7  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0645901  normal  0.105938 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0054  Putitive phosphate transport regulator  30.51 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3507  phosphate transport regulator-like protein  29.61 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000596439  normal  0.317857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0678  phosphate transport regulator-like protein  25 
 
 
214 aa  62  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  25.13 
 
 
210 aa  58.2  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  25.13 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  24.6 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  24.1 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  24.02 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  28.74 
 
 
205 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  24.86 
 
 
209 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  25.95 
 
 
282 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  24.42 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  24.43 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  25.86 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  21.23 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  22.87 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  25.41 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  19.79 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  23.49 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  20.5 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3186  protein of unknown function DUF47  25.63 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.640188 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  30.63 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  23.49 
 
 
205 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  23.08 
 
 
205 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  29.35 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  23.5 
 
 
214 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  22.22 
 
 
217 aa  48.9  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  25.71 
 
 
209 aa  48.9  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  21.32 
 
 
205 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  21.65 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  23.35 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2334  hypothetical protein  24.19 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  19.4 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  20.48 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  20.1 
 
 
209 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2032  hypothetical protein  23.2 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635616  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  35.42 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2947  hypothetical protein  23.88 
 
 
214 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.847202  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  21.56 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  23.76 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  22.02 
 
 
206 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  24.38 
 
 
214 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  20.39 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  31.82 
 
 
208 aa  45.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2716  protein of unknown function DUF47  22.02 
 
 
209 aa  45.1  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  29.27 
 
 
210 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  20.62 
 
 
205 aa  45.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  22.62 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  31.63 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  41.3 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  41.3 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  19.41 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  41.3 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  41.3 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  22.33 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  41.3 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  41.3 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04040  phosphate transport regulator related to PhoU  30.43 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.679526 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1961  hypothetical protein  23.56 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  41.3 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  21.71 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0920  hypothetical protein  22.05 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  27.91 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  34.69 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  23.38 
 
 
213 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  23.88 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  39.13 
 
 
206 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  39.13 
 
 
206 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  39.13 
 
 
206 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  26.8 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  36.54 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21880  phosphate transport regulator related to PhoU  24.73 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0223149 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2877  protein of unknown function DUF47  43.48 
 
 
206 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0461875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  39.13 
 
 
206 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  32.14 
 
 
211 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  25.15 
 
 
215 aa  42  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  22.98 
 
 
204 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>