151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2522 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  100 
 
 
214 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2334  hypothetical protein  92.52 
 
 
214 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  90.19 
 
 
214 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2947  hypothetical protein  88.32 
 
 
214 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.847202  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  82.24 
 
 
214 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  81.31 
 
 
218 aa  368  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2032  hypothetical protein  80.37 
 
 
215 aa  354  5.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635616  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  57.94 
 
 
214 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5971  hypothetical protein  57.48 
 
 
214 aa  258  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  56.07 
 
 
214 aa  255  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  56.07 
 
 
213 aa  254  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  56.54 
 
 
213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  54.67 
 
 
214 aa  239  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0776  hypothetical protein  53.27 
 
 
213 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.116713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  48.13 
 
 
390 aa  215  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  47.66 
 
 
214 aa  211  7.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0842  hypothetical protein  43.93 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  30.58 
 
 
205 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  33.81 
 
 
208 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  33.81 
 
 
208 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  34.62 
 
 
208 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  34.62 
 
 
208 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  34.62 
 
 
208 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  34.62 
 
 
208 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  34.62 
 
 
208 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  34.62 
 
 
208 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  34.62 
 
 
208 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  34.62 
 
 
208 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  30.58 
 
 
205 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  33.81 
 
 
208 aa  121  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  34.13 
 
 
208 aa  121  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  34.13 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  34.13 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  34.13 
 
 
208 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  34.13 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  34.13 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  34.13 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  28.99 
 
 
205 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  118  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  33.17 
 
 
208 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  32.69 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  31.55 
 
 
211 aa  111  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  30.58 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  28.64 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  36.15 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  32.2 
 
 
208 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  33.64 
 
 
215 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  32.35 
 
 
209 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  32.86 
 
 
215 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  32.86 
 
 
215 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  32.86 
 
 
215 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  31.1 
 
 
208 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  31.78 
 
 
215 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  33.18 
 
 
215 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  27.67 
 
 
205 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  32.71 
 
 
214 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  29.13 
 
 
205 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  30.29 
 
 
209 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  30.58 
 
 
204 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  31.16 
 
 
212 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  29.61 
 
 
211 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  27.96 
 
 
217 aa  101  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  29.33 
 
 
219 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  29.61 
 
 
211 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  30.99 
 
 
215 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  29.81 
 
 
209 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  32.39 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  29.61 
 
 
211 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  31.31 
 
 
215 aa  98.2  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  25.94 
 
 
211 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  28.64 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  28.92 
 
 
205 aa  95.9  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  32.2 
 
 
205 aa  95.9  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  29.47 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  30.39 
 
 
209 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  30.1 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  31.31 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  28.02 
 
 
209 aa  94.7  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  30.58 
 
 
205 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  28.64 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0054  Putitive phosphate transport regulator  30.58 
 
 
211 aa  92.4  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  27.45 
 
 
205 aa  92  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  27.94 
 
 
205 aa  92  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  28.08 
 
 
209 aa  91.7  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  31.1 
 
 
210 aa  91.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  29.38 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  29.13 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  26.83 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0920  hypothetical protein  28.99 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  28.37 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  25.62 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  29.3 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  26.83 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  31.07 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  26.79 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  29.52 
 
 
210 aa  89  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  28.57 
 
 
282 aa  89  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  28.37 
 
 
213 aa  89  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  29.13 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>