82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7344 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7344  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114903  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5568  hypothetical protein  38.07 
 
 
219 aa  127  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1535  hypothetical protein  45.19 
 
 
140 aa  115  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00830  hypothetical protein  43.31 
 
 
157 aa  95.1  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0645901  normal  0.105938 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0054  Putitive phosphate transport regulator  33.33 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  30.73 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  25.13 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  25.13 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  27.87 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  27.62 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  30.57 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0678  phosphate transport regulator-like protein  26.96 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  28.26 
 
 
205 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3507  phosphate transport regulator-like protein  28.85 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000596439  normal  0.317857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  24.59 
 
 
205 aa  61.2  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  30.22 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  29.45 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  24.59 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  30.17 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  25.45 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  25.68 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  27.68 
 
 
205 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  26.74 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  27.59 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  30.38 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  23.46 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  26.28 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  27.16 
 
 
217 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  21.39 
 
 
209 aa  55.1  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  38.27 
 
 
211 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  21.74 
 
 
209 aa  55.1  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2716  protein of unknown function DUF47  28.8 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  34.15 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  34.15 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  25.64 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  34.15 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  34.15 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  34.15 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  23.35 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  34.15 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  34.15 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  34.15 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  34.15 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  25.25 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  34.15 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  28.4 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  26.21 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04040  phosphate transport regulator related to PhoU  35 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.679526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  22.11 
 
 
209 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  29.41 
 
 
207 aa  51.6  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  31.17 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  25.57 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  34.25 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  25.29 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  20.39 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  25.29 
 
 
282 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21880  phosphate transport regulator related to PhoU  23.53 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0223149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  27.87 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2877  protein of unknown function DUF47  45.65 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0461875  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0920  hypothetical protein  24.4 
 
 
208 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  23.03 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  28.26 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1647  hypothetical protein  32.2 
 
 
211 aa  45.4  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  26.38 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0953  hypothetical protein  33.87 
 
 
209 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.928934  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  23.75 
 
 
206 aa  45.1  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0316  hypothetical protein  34 
 
 
205 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0702  hypothetical protein  25.88 
 
 
205 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000282132  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0687  hypothetical protein  25.88 
 
 
205 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00131316  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2627  Putitive phosphate transport regulator  32.86 
 
 
203 aa  45.1  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1961  hypothetical protein  25 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  31.67 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0765  phosphate transport regulator-like protein  39.29 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.360674  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  27.22 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  41.3 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  24.04 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0643  phosphate transport regulator  32.95 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.233591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  24.44 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0386  protein of unknown function DUF47  21.47 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0042  protein of unknown function DUF47  23.81 
 
 
207 aa  41.6  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  24.12 
 
 
208 aa  41.6  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>