134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0678 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0678  phosphate transport regulator-like protein  100 
 
 		 214 aa  443  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0054  Putitive phosphate transport regulator  40 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3507  phosphate transport regulator-like protein  38.07 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000596439  normal  0.317857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  27.75 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  28.5 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  27.5 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  27 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  29.56 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  27.94 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  26.37 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  27.8 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  27 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  27.09 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  25.85 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  30.52 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  25.85 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  29.11 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  26.5 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  27.09 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  27.09 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  26.6 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  25.24 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  26.13 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7344  hypothetical protein  26.96 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  26.09 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  27.8 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  25.24 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  26.17 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  24.76 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  25.25 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1647  hypothetical protein  25.12 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  22.66 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  27.57 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  28.3 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  25.62 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0920  hypothetical protein  28.4 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  27.23 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  26.64 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  25.5 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  23.33 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  27.04 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  25.82 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  28.02 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  26.64 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  25.12 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  22.86 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  27.4 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  24.64 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0042  protein of unknown function DUF47  25.51 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  25.62 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5568  hypothetical protein  24.11 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  24.88 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  25.46 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  25.46 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  25.25 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  22.75 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2032  hypothetical protein  25.35 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  23.44 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  27.49 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  21.74 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  26.05 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1024  phosphate transport regulator-like  20.85 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  25.49 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  21.74 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  21.74 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  25.62 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  23.61 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  25.62 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2947  hypothetical protein  23.33 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.847202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  24.63 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  24.39 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  21.26 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  21.26 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  21.26 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  25.36 
 
 		 282 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  21.26 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  25.48 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  23.58 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  23.81 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  24.31 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  24.76 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  23.11 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  23.11 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  23.11 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  24.77 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2334  hypothetical protein  24.89 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  23.11 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  23.11 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  23.11 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  23.11 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  23.11 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2877  protein of unknown function DUF47  25 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0461875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  25.12 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1961  hypothetical protein  38.75 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  24.63 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  24.63 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  23.11 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0953  hypothetical protein  27.44 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.928934  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  21.17 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>