90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3507 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3507  phosphate transport regulator-like protein  100 
 
 		 202 aa  397  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000596439  normal  0.317857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0678  phosphate transport regulator-like protein  37.24 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0054  Putitive phosphate transport regulator  31.68 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  31.01 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  29.38 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  29.38 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  29.38 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7344  hypothetical protein  28.66 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  28.75 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5568  hypothetical protein  30 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  25.16 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  27.85 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  23.42 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  28.65 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1535  hypothetical protein  34.12 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  39.29 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  26.46 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  29.14 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0316  hypothetical protein  22.98 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  28.1 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  28.29 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  30.08 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  25.13 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  20.1 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  27.62 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  23.04 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0702  hypothetical protein  21.56 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000282132  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0687  hypothetical protein  21.56 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00131316  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  32.29 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  28.57 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  26.29 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  25.32 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  25.91 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  27.44 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2334  hypothetical protein  26.64 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  27.44 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2947  hypothetical protein  25.91 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.847202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  23.12 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00830  hypothetical protein  28.21 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0645901  normal  0.105938 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2032  hypothetical protein  24.06 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0368  putative Pit accessory protein  25.37 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  23.74 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  31.15 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3186  protein of unknown function DUF47  35 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.640188 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  23.57 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  22.93 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  45 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  23.83 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  25.31 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0207  putative Pit accessory protein  24.88 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  25.71 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  23.18 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0920  hypothetical protein  25.23 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  45 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  27.7 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  27.7 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  24.84 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  33.77 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  24.84 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  26.29 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04040  phosphate transport regulator related to PhoU  27.47 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.679526 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  24.84 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0953  hypothetical protein  36.21 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.928934  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  24.26 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  33.75 
 
 		 209 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  24.26 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  24.26 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  24.26 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  26.39 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  29.32 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  24.26 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  24.26 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  24.26 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  24.4 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  22.15 
 
 		 208 aa  42  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  25.47 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  25.47 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  24.84 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  23.9 
 
 		 206 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  23.9 
 
 		 206 aa  42  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  27.55 
 
 		 213 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  23.9 
 
 		 206 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  23.9 
 
 		 206 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  28.57 
 
 		 213 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  38 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  22.71 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  28.82 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  23.62 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0643  phosphate transport regulator  24.85 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.233591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>