44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00830 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00830  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  304  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0645901  normal  0.105938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7344  hypothetical protein  43.31 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5568  hypothetical protein  46.54 
 
 		 219 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1535  hypothetical protein  46.53 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0054  Putitive phosphate transport regulator  33.12 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3507  phosphate transport regulator-like protein  30.32 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000596439  normal  0.317857 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  27.67 
 
 		 213 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  24.68 
 
 		 217 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  21.14 
 
 		 210 aa  47.4  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  35.19 
 
 		 208 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0316  hypothetical protein  28.57 
 
 		 205 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0678  phosphate transport regulator-like protein  24.34 
 
 		 214 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  32.2 
 
 		 207 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  29.41 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  27.08 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  25.61 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  25.61 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  30.99 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  32.76 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  29.07 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  25.61 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  25.61 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  30.99 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  28.57 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  25.61 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2716  protein of unknown function DUF47  25.58 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  30.99 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  25.61 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  27.59 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  38.64 
 
 		 205 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  26.25 
 
 		 206 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  24.39 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  24.39 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0702  hypothetical protein  27.38 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000282132  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0687  hypothetical protein  27.38 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00131316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  24.39 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  24.39 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  35.59 
 
 		 204 aa  40.8  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  30.26 
 
 		 212 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  28.74 
 
 		 208 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  28.74 
 
 		 208 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  24.54 
 
 		 205 aa  40.4  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  25.84 
 
 		 209 aa  40.4  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>