144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3186 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3186  protein of unknown function DUF47  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.640188 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0953  hypothetical protein  70.33 
 
 		 209 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.928934  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2274  hypothetical protein  41.31 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.810246  normal  0.954547 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1961  hypothetical protein  40.49 
 
 		 209 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  27.4 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  27.4 
 
 		 205 aa  97.8  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  26.44 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  27.62 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  27.27 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  31.43 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  26.92 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  25.96 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  31.43 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  28.29 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  28.44 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  30.95 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  27.83 
 
 		 218 aa  88.6  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  28.1 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  26.92 
 
 		 212 aa  84.7  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  26.92 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2947  hypothetical protein  29.05 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.847202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2334  hypothetical protein  26.54 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  30.45 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  25.62 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  28.71 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  26.85 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2032  hypothetical protein  27.85 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  27.88 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  26.67 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  27.19 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  26.17 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  25.7 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  25.48 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  24.88 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  28.1 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  24.52 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  24.52 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  28.44 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  26.64 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  26.09 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  26.64 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  22.6 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  26.19 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  25.12 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  24.4 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0386  protein of unknown function DUF47  26.21 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  24.52 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  25 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2716  protein of unknown function DUF47  25.37 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  24.06 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  24.29 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  27.23 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0920  hypothetical protein  25.24 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  25.24 
 
 		 282 aa  71.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  28.7 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  26.89 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  27.65 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  24.06 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  24.17 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  24.53 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  26.54 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  23.56 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  24.54 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  25.35 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0042  protein of unknown function DUF47  24.02 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5971  hypothetical protein  26.54 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  25.88 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  23.11 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  27.23 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  26.7 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  24.04 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  24.66 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  24.4 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  25.23 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0643  phosphate transport regulator  25.96 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.233591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  24.66 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  24.3 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  24.07 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  23.56 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  24.88 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  23.56 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  23.44 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  23.56 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  23.56 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  23.56 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  23.56 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  23.56 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  27.75 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  23.44 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  23.26 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2627  Putitive phosphate transport regulator  25.37 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  23.83 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>