22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2230 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2230  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  278  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2013  hypothetical protein  52.94 
 
 		 138 aa  140  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2989  PilT domain-containing protein  45.16 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00342264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4031  PilT protein-like  47.1 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2147  hypothetical protein  33.87 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.580506  normal  0.267896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2015  hypothetical protein  37.41 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10593  hypothetical protein  28.89 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3892  hypothetical protein  38.24 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.678557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1961  PilT domain-containing protein  27.59 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.249372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5449  hypothetical protein  31.88 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1646  hypothetical protein  28.93 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1570  hypothetical protein  30.17 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.652312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0789  PilT protein domain protein  28.21 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2128  PilT domain-containing protein  26.89 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0770  hypothetical protein  27.21 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.468965  normal  0.046742 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0688  PilT protein-like  27.64 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000301762  unclonable  0.00000000741036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4271  hypothetical protein  27.69 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1496  PilT protein domain protein  29.01 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.296648  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2473  PilT protein domain protein  31.15 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2122  PilT domain-containing protein  26.47 
 
 		 142 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0497789  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0563  PilT domain-containing protein  29.69 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0549  PilT protein domain protein  31.01 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.10178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>