18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2015 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2015  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  275  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2013  hypothetical protein  53.24 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4031  PilT protein-like  41.84 
 
 		 142 aa  88.6  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2230  hypothetical protein  37.41 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1646  hypothetical protein  35.11 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2147  hypothetical protein  35.43 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.580506  normal  0.267896 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2989  PilT domain-containing protein  31.75 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00342264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0789  PilT protein domain protein  32.56 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10593  hypothetical protein  33.01 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1961  PilT domain-containing protein  29.69 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.249372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5449  hypothetical protein  31.21 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4271  hypothetical protein  28.12 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3892  hypothetical protein  38.64 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.678557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0770  hypothetical protein  25.18 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.468965  normal  0.046742 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2128  PilT domain-containing protein  26.05 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0688  PilT protein-like  22.69 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000301762  unclonable  0.00000000741036 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1768  hypothetical protein  25.9 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2111  hypothetical protein  22.31 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>