15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10593 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10593  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  268  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0155469  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5449  hypothetical protein  38.69 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2989  PilT domain-containing protein  30.33 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00342264  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2013  hypothetical protein  31.11 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.145779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2230  hypothetical protein  28.89 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1570  hypothetical protein  33.62 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.652312  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4031  PilT protein-like  32.12 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2147  hypothetical protein  29.69 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.580506  normal  0.267896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2015  hypothetical protein  28.26 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2128  PilT domain-containing protein  26.89 
 
 
132 aa  50.1  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0829  hypothetical protein  30.5 
 
 
153 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0688  PilT protein-like  23.62 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000301762  unclonable  0.00000000741036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1646  hypothetical protein  23.88 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0789  PilT protein domain protein  24.14 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2111  hypothetical protein  26.06 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>