13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5449 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5449  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  279  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10593  hypothetical protein  38.69 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2013  hypothetical protein  36.69 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2989  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00342264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4031  PilT protein-like  36.17 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2230  hypothetical protein  31.88 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2147  hypothetical protein  30.83 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.580506  normal  0.267896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2015  hypothetical protein  31.21 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2772  PilT protein domain protein  26.37 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1961  PilT domain-containing protein  28.05 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.249372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1646  hypothetical protein  25.19 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0770  hypothetical protein  27.97 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.468965  normal  0.046742 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0688  PilT protein-like  25.2 
 
 		 132 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000301762  unclonable  0.00000000741036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>