16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2147 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2147  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  279  8.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.580506  normal  0.267896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1570  hypothetical protein  44.6 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.652312  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1961  PilT domain-containing protein  37.78 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.249372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1646  hypothetical protein  39.69 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2013  hypothetical protein  34.68 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0789  PilT protein domain protein  36.07 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4031  PilT protein-like  33.06 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0770  hypothetical protein  36.29 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.468965  normal  0.046742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2230  hypothetical protein  33.87 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2015  hypothetical protein  35.43 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2989  PilT domain-containing protein  27.27 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00342264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10593  hypothetical protein  29.69 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1954  PilT protein domain protein  31.45 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5449  hypothetical protein  30.83 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0549  PilT protein domain protein  29.46 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.10178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0563  PilT domain-containing protein  29.69 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>