14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0770 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0770  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  279  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.468965  normal  0.046742 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1646  hypothetical protein  45.19 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1961  PilT domain-containing protein  34.38 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.249372  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3644  hypothetical protein  80 
 
 
57 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2470  hypothetical protein  80 
 
 
57 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.793518  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2147  hypothetical protein  37.1 
 
 
136 aa  72  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.580506  normal  0.267896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1570  hypothetical protein  31.11 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.652312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0789  PilT protein domain protein  32.35 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2989  PilT domain-containing protein  32.17 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00342264  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4031  PilT protein-like  30.71 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2013  hypothetical protein  25.93 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.145779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1954  PilT protein domain protein  30.65 
 
 
137 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2230  hypothetical protein  27.21 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5449  hypothetical protein  27.97 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>