18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1646 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1646  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  285  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0770  hypothetical protein  45.19 
 
 
136 aa  107  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.468965  normal  0.046742 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1961  PilT domain-containing protein  39.68 
 
 
141 aa  100  9e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.249372  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2147  hypothetical protein  39.69 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.580506  normal  0.267896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1570  hypothetical protein  37.69 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.652312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0789  PilT protein domain protein  34.85 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2013  hypothetical protein  32.37 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.145779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4031  PilT protein-like  33.33 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2015  hypothetical protein  32.62 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2989  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00342264  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2230  hypothetical protein  28.93 
 
 
136 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1954  PilT protein domain protein  28.89 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0592  hypothetical protein  33.78 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0688  PilT protein-like  24.63 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000301762  unclonable  0.00000000741036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3644  hypothetical protein  43.9 
 
 
57 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2470  hypothetical protein  43.9 
 
 
57 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.793518  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5449  hypothetical protein  25.19 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10593  hypothetical protein  23.88 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0155469  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>